Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G099100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RE57
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G253300 OsSAUR23 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
2 Sobic.004G239200 transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
3 Sobic.009G161300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@Ribosomal protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@40S ribosomal protein S15a, putative, expressed -
4 Sobic.002G363466 - -
5 Sobic.002G130601 - -
6 Sobic.007G079500 hypothetical protein -
7 Sobic.002G328250 - -
8 Sobic.010G188700 expressed protein -
9 Sobic.003G277850 - -
10 Sobic.007G002400 - -
11 Sobic.006G209200 transferase family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G421501 - -
13 Sobic.008G122200 expressed protein -
14 Sobic.007G141801 - -
15 Sobic.001G173251 - -
16 Sobic.010G030600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transporter family protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G292001 - -
19 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G065800 Cupin domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G099100 Sobic006G099100 Sobic006G253300 Sobic006G253300 Sobic006G099100--Sobic006G253300 Sobic004G239200 Sobic004G239200 Sobic006G099100--Sobic004G239200 Sobic009G161300 Sobic009G161300 Sobic006G099100--Sobic009G161300 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G099100--Sobic002G363466 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic006G099100--Sobic002G130601 Sobic007G079500 Sobic007G079500 Sobic006G099100--Sobic007G079500 Sobic002G328250 Sobic002G328250 Sobic006G099100--Sobic002G328250 Sobic010G188700 Sobic010G188700 Sobic006G099100--Sobic010G188700 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic006G099100--Sobic003G277850 Sobic006G253300--Sobic006G099100 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G253300--Sobic006G234900 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic006G253300--Sobic006G026500 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G253300--Sobic005G108601 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic006G253300--Sobic009G157450 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic006G253300--Sobic006G268500 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic006G253300--Sobic008G140900 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic006G253300--Sobic002G010900 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic006G253300--Sobic006G227750 Sobic004G239200--Sobic002G328250 Sobic004G239200--Sobic006G099100 Sobic010G124300 Sobic010G124300 Sobic004G239200--Sobic010G124300 Sobic007G170000 Sobic007G170000 Sobic004G239200--Sobic007G170000 Sobic004G240600 Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic009G161300 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic004G239200--Sobic006G190700 Sobic010G079600 Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic002G130601 Sobic009G161300--Sobic006G268500 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic009G161300--Sobic009G071000 Sobic009G161300--Sobic006G099100 Sobic009G161300--Sobic004G239200 Sobic009G161300--Sobic002G010900 Sobic009G161300--Sobic006G253300 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic009G161300--Sobic002G422300 Sobic009G161300--Sobic006G227750 Sobic009G161300--Sobic009G157450 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic002G363466--Sobic006G209200 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic001G173251 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic002G363466--Sobic003G095301 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic002G363466--Sobic004G093300 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic002G363466--Sobic010G092550 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic009G158200 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic002G175000 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic002G363466--Sobic004G121500 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G363466--Sobic007G181801 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic002G130601--Sobic004G292001 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic002G130601--Sobic007G065800 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic002G130601--Sobic007G065900 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic002G130601--Sobic004G023500 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic002G130601--Sobic008G157800 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic010G113600 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic002G130601--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic002G130601--Sobic005G217300 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic002G130601--Sobic003G364950 Sobic007G079500--Sobic001G173251 Sobic007G079500--Sobic002G363466 Sobic007G079500--Sobic006G209200 Sobic007G079500--Sobic004G093300 Sobic007G079500--Sobic003G277850 Sobic003G079466 Sobic003G079466 Sobic007G079500--Sobic003G079466 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G079500--Sobic004G279900 Sobic003G223600 Sobic003G223600 Sobic007G079500--Sobic003G223600 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic007G079500--Sobic007G002400 Sobic002G328250--Sobic004G239200 Sobic002G328250--Sobic001G173251 Sobic002G328250--Sobic006G099100 Sobic002G328250--Sobic007G079500 Sobic002G328250--Sobic002G363466 Sobic002G328250--Sobic010G188700 Sobic002G328250--Sobic003G277850 Sobic002G328250--Sobic007G170000 Sobic010G030600 Sobic010G030600 Sobic002G328250--Sobic010G030600 Sobic010G188700--Sobic002G328250 Sobic010G188700--Sobic006G099100 Sobic010G188700--Sobic007G079500 Sobic010G188700--Sobic004G239200 Sobic002G421501 Sobic002G421501 Sobic010G188700--Sobic002G421501 Sobic006G163033 Sobic006G163033 Sobic010G188700--Sobic006G163033 Sobic010G188700--Sobic003G277850 Sobic003G034200 Sobic003G034200 Sobic010G188700--Sobic003G034200 Sobic010G188700--Sobic006G209200 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic004G093300 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic006G209200 Sobic003G277850--Sobic001G173251 Sobic003G277850--Sobic007G079500 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic003G277850--Sobic004G022700 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic003G277850--Sobic005G144900 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic003G277850--Sobic006G175100
Octagon: transcription factors


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