Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G247600.3,Sobic.010G247600.2,Sobic.010G247600.1
Synonym Sb10g028640, WIN2
Functional annotation Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
Up-reguralion under combine stress of drought and heat (PubMedID : 24916767)
protein phosphatase 2C, putative, expressed
UniProt A0A194YL84 , A0A194YMC3 , A0A194YLA2
Pfam PF00481
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF352
NCBI CDD KOG0699; Serine/threonine protein phosphatase KOG0698Serine/threonine protein phosphatase
KEGG Orthology K17506; PPM1L, protein phosphatase 1L
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G31750 : HOPW1-1-interacting 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g48300.1,LOC_Os02g05630.1 : protein phosphatase 2C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ93321
Barley -
Wheat TraesCS6B02G148200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G210400 OsFBDUF22 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic010G247600 Sobic010G247600 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic010G247600--Sobic005G210400 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic010G247600--Sobic004G166600 Sobic001G330775 Sobic001G330775 Sobic010G247600--Sobic001G330775 Sobic003G331750 Sobic003G331750 Sobic010G247600--Sobic003G331750 Sobic006G050550 Sobic006G050550 Sobic010G247600--Sobic006G050550 Sobic007G168700 Sobic007G168700 Sobic010G247600--Sobic007G168700 Sobic001G437050 Sobic001G437050 Sobic010G247600--Sobic001G437050 Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic010G247600--Sobic003G334500 Sobic001G265000 Sobic001G265000 Sobic010G247600--Sobic001G265000 Sobic005G210400--Sobic004G166600 Sobic005G210400--Sobic001G330775 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic005G210400--Sobic007G059150 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic005G210400--Sobic009G258800 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G210400--Sobic001G516400 Sobic009G195100 Sobic009G195100 Sobic005G210400--Sobic009G195100 Sobic005G210400--Sobic007G168700 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic005G210400--Sobic003G244850 Sobic005G076700 Sobic005G076700 Sobic005G210400--Sobic005G076700 Sobic004G166600--Sobic005G210400 Sobic004G166600--Sobic007G059150 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G166600--Sobic002G152100 Sobic004G166600--Sobic001G516400 Sobic004G166600--Sobic001G330775 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic004G166600--Sobic007G134300 Sobic004G166600--Sobic005G076700 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic004G166600--Sobic007G226900 Sobic004G166600--Sobic009G258800 Sobic001G330775--Sobic005G210400 Sobic001G330775--Sobic001G437050 Sobic001G330775--Sobic004G166600 Sobic007G195900 Sobic007G195900 Sobic001G330775--Sobic007G195900 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G330775--Sobic003G370800 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic001G330775--Sobic009G020300 Sobic010G037701 Sobic010G037701 Sobic001G330775--Sobic010G037701 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic007G168700 Sobic003G331750--Sobic010G003800 Sobic007G182700 Sobic007G182700 Sobic003G331750--Sobic007G182700 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic003G331750--Sobic006G250350 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic003G331750--Sobic001G112550 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic003G331750--Sobic006G113301 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic003G331750--Sobic001G042100 Sobic003G331750--Sobic001G437050 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic003G331750--Sobic001G443400 Sobic003G331750--Sobic009G195100 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic006G050550--Sobic005G181600 Sobic002G182900 Sobic002G182900 Sobic006G050550--Sobic002G182900 Sobic005G230100 Sobic005G230100 Sobic006G050550--Sobic005G230100 Sobic010G245900 Sobic010G245900 Sobic006G050550--Sobic010G245900 Sobic003G267300 Sobic003G267300 Sobic006G050550--Sobic003G267300 Sobic009G253950 Sobic009G253950 Sobic006G050550--Sobic009G253950 Sobic008G016850 Sobic008G016850 Sobic006G050550--Sobic008G016850 Sobic001G134000 Sobic001G134000 Sobic006G050550--Sobic001G134000 Sobic006G050550--Sobic003G334500 Sobic007G168700--Sobic001G265000 Sobic007G168700--Sobic005G210400 Sobic007G168700--Sobic009G020300 Sobic007G168700--Sobic001G330775 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic007G168700--Sobic008G108100 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic007G168700--Sobic004G248000 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic007G168700--Sobic009G115800 Sobic007G168700--Sobic001G437050 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic007G168700--Sobic004G313000 Sobic001G437050--Sobic010G003800 Sobic001G437050--Sobic001G112550 Sobic001G437050--Sobic001G330775 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic001G437050--Sobic003G148950 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G437050--Sobic007G132300 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic001G437050--Sobic002G018800 Sobic001G437050--Sobic003G331750 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic001G437050--Sobic007G050750 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic001G437050--Sobic001G334800 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic003G334500--Sobic008G041500 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic003G334500--Sobic007G179100 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic009G134700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G334500--Sobic006G083050 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G334500--Sobic006G214800 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic001G180950 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic003G334500--Sobic010G156300 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G334500--Sobic008G142500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic003G334500--Sobic010G166850 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G265000--Sobic002G160500 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic001G265000--Sobic004G262550 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G265000--Sobic003G267150 Sobic005G162200 Sobic005G162200 Sobic001G265000--Sobic005G162200 Sobic001G265000--Sobic008G108100
Octagon: transcription factors


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