Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G047500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHD3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G202550 - -
2 Sobic.004G008100 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
4 Sobic.003G253900 - -
5 Sobic.001G316500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G151900 expressed protein -
7 Sobic.006G000200 - -
8 Sobic.004G306700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed K05864: PPID, peptidyl-prolyl isomerase D
9 Sobic.001G388800 tRNA-specific adenosine deaminase 2, putative, expressed K15441: TAD2, tRNA-specific adenosine deaminase 2
10 Sobic.003G053750 - -
11 Sobic.008G086300 - -
12 Sobic.003G005332 - -
13 Sobic.010G217001 - -
14 Sobic.004G030850 - -
15 Sobic.007G096833 - -
16 Sobic.007G175600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR36 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
17 Sobic.002G231400 - -
18 Sobic.001G424066 - -
19 Sobic.002G234800 expressed protein -
20 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G047500 Sobic001G047500 Sobic001G202550 Sobic001G202550 Sobic001G047500--Sobic001G202550 Sobic004G008100 Sobic004G008100 Sobic001G047500--Sobic004G008100 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G047500--Sobic007G124800 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic001G047500--Sobic003G253900 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic001G047500--Sobic001G316500 Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic001G047500--Sobic008G151900 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic001G047500--Sobic006G000200 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic001G047500--Sobic004G306700 Sobic001G388800 Sobic001G388800 Sobic001G047500--Sobic001G388800 Sobic001G202550--Sobic004G008100 Sobic001G202550--Sobic006G000200 Sobic001G202550--Sobic001G047500 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G202550--Sobic005G031400 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic001G202550--Sobic004G030850 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic001G202550--Sobic007G075600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic001G202550--Sobic010G088100 Sobic003G358800 Sobic003G358800 Sobic001G202550--Sobic003G358800 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic001G202550--Sobic002G302800 Sobic004G008100--Sobic001G202550 Sobic004G008100--Sobic007G075600 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic004G008100--Sobic002G033200 Sobic004G008100--Sobic002G302800 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic004G008100--Sobic007G096833 Sobic004G008100--Sobic004G030850 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic004G008100--Sobic004G118300 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic004G008100--Sobic006G215650 Sobic006G140450 Sobic006G140450 Sobic004G008100--Sobic006G140450 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic003G253900--Sobic002G331050 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic003G253900--Sobic003G386400 Sobic003G253900--Sobic001G316500 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic003G253900--Sobic009G192450 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic003G253900--Sobic003G439200 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic003G253900--Sobic002G025100 Sobic003G253900--Sobic010G088100 Sobic003G253900--Sobic008G108000 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic003G253900--Sobic004G007032 Sobic001G316500--Sobic007G124800 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic010G217001 Sobic001G316500--Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic001G174300 Sobic001G316500--Sobic008G007200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic002G202200 Sobic001G316500--Sobic001G027400 Sobic009G122201 Sobic009G122201 Sobic008G151900--Sobic009G122201 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic008G151900--Sobic002G035100 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic008G151900--Sobic004G228000 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic008G151900--Sobic001G140101 Sobic008G151900--Sobic001G027400 Sobic004G267950 Sobic004G267950 Sobic008G151900--Sobic004G267950 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic008G151900--Sobic010G118401 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic008G151900--Sobic004G202750 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic008G151900--Sobic002G387000 Sobic006G000200--Sobic008G086300 Sobic006G000200--Sobic007G096833 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G000200--Sobic009G176100 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic006G000200--Sobic002G129900 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G000200--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic006G000200--Sobic006G021100 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic006G000200--Sobic005G018400 Sobic006G000200--Sobic001G202550 Sobic006G000200--Sobic006G215650 Sobic001G507700 Sobic001G507700 Sobic004G306700--Sobic001G507700 Sobic004G306700--Sobic001G316500 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G306700--Sobic001G312801 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic004G306700--Sobic009G252600 Sobic004G306700--Sobic001G027400 Sobic004G306700--Sobic002G387000 Sobic004G306700--Sobic010G217001 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic004G306700--Sobic008G007100 Sobic004G306700--Sobic007G124800 Sobic004G265066 Sobic004G265066 Sobic001G388800--Sobic004G265066 Sobic001G388800--Sobic010G217001 Sobic001G388800--Sobic001G202550 Sobic009G212500 Sobic009G212500 Sobic001G388800--Sobic009G212500 Sobic001G388800--Sobic004G306700 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic001G388800--Sobic006G243000 Sobic001G388800--Sobic001G047500 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic001G388800--Sobic004G091300 Sobic001G388800--Sobic007G124800
Octagon: transcription factors


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