Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G175600.1
Synonym SbSAUR58, Sb07g024740, small auxin up RNA
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database" (PubMedID : 20499123)
OsSAUR36 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
UniProt C5YH15
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31175 PTHR31175:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29500 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43700.1 : OsSAUR36 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031266
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G234300 - -
2 Sobic.006G103800 AGC_PVPK_like_CDK8.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
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7 Sobic.004G221100 uncharacterized protein PA4923, putative, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
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9 Sobic.005G083400 expressed protein -
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13 Sobic.002G321700 - -
14 Sobic.004G181000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
15 Sobic.004G007200 - -
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17 Sobic.010G242000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
18 Sobic.008G151900 expressed protein -
19 Sobic.004G306700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed K05864: PPID, peptidyl-prolyl isomerase D
20 Sobic.001G047500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G175600 Sobic007G175600 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic007G175600--Sobic003G234300 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic007G175600--Sobic006G103800 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic007G175600--Sobic010G201444 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic007G175600--Sobic006G111400 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic007G175600--Sobic002G234800 Sobic002G037700 Sobic002G037700 Sobic007G175600--Sobic002G037700 Sobic004G221100 Sobic004G221100 Sobic007G175600--Sobic004G221100 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic007G175600--Sobic008G007100 Sobic005G083400 Sobic005G083400 Sobic007G175600--Sobic005G083400 Sobic003G234300--Sobic007G175600 Sobic003G234300--Sobic002G037700 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic003G234300--Sobic004G007200 Sobic003G234300--Sobic006G111400 Sobic003G234300--Sobic002G234800 Sobic003G234300--Sobic006G103800 Sobic010G242000 Sobic010G242000 Sobic003G234300--Sobic010G242000 Sobic003G234300--Sobic010G201444 Sobic003G234300--Sobic004G221100 Sobic006G103800--Sobic010G201444 Sobic006G103800--Sobic005G083400 Sobic006G103800--Sobic007G175600 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic006G103800--Sobic003G251900 Sobic006G103800--Sobic003G234300 Sobic006G103800--Sobic004G221100 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic006G103800--Sobic006G027800 Sobic006G103800--Sobic006G111400 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic006G103800--Sobic001G093732 Sobic010G201444--Sobic001G093732 Sobic010G201444--Sobic006G103800 Sobic010G201444--Sobic003G251900 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic010G201444--Sobic008G007200 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic010G201444--Sobic009G252600 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic010G201444--Sobic005G014400 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic010G201444--Sobic006G024400 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic010G201444--Sobic004G181000 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic010G201444--Sobic006G154900 Sobic006G111400--Sobic008G007100 Sobic006G111400--Sobic002G234800 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic006G111400--Sobic006G169600 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic003G251900 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic003G234300 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic006G111400--Sobic004G350600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G111400--Sobic004G149000 Sobic002G234800--Sobic004G181000 Sobic002G234800--Sobic006G111400 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic002G234800--Sobic009G223900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic002G234800--Sobic008G103400 Sobic002G234800--Sobic003G251900 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic002G234800--Sobic002G110600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic002G234800--Sobic002G001500 Sobic002G234800--Sobic006G169600 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G234800--Sobic003G155800 Sobic002G037700--Sobic003G234300 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic002G037700--Sobic008G016800 Sobic002G037700--Sobic004G007200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G037700--Sobic005G110553 Sobic002G037700--Sobic010G242000 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic002G037700--Sobic008G159800 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic002G037700--Sobic002G197400 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic002G037700--Sobic007G226000 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic002G037700--Sobic001G367900 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G221100--Sobic004G074400 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G221100--Sobic002G208700 Sobic004G221100--Sobic010G201444 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic004G221100--Sobic004G091300 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic004G221100--Sobic010G042300 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic004G221100--Sobic006G280250 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic004G221100--Sobic007G075600 Sobic004G221100--Sobic006G103800 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G221100--Sobic009G180900 Sobic008G007100--Sobic008G007200 Sobic008G007100--Sobic006G111400 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic003G005332 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic008G007100--Sobic001G027400 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic008G007100--Sobic003G304900 Sobic008G007100--Sobic009G199900 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G251900 Sobic008G007100--Sobic006G169600 Sobic005G083400--Sobic006G103800 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic005G083400--Sobic008G064200 Sobic005G083400--Sobic006G027800 Sobic005G083400--Sobic010G201444 Sobic006G075200 Sobic006G075200 Sobic005G083400--Sobic006G075200 Sobic005G083400--Sobic007G175600 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic005G083400--Sobic009G218450 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic005G083400--Sobic004G203633 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic005G083400--Sobic002G365300
Octagon: transcription factors


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