Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G234300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XEK3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.003G234300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G175600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR36 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
2 Sobic.002G037700 expressed protein K10891: fanconi anemia group D2 protein
3 Sobic.004G007200 - -
4 Sobic.006G111400 nodulation receptor kinase precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
5 Sobic.002G234800 expressed protein -
6 Sobic.006G103800 AGC_PVPK_like_CDK8.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
7 Sobic.010G242000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
8 Sobic.010G201444 - -
9 Sobic.004G221100 uncharacterized protein PA4923, putative, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
10 Sobic.006G024400 receptor-like protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G091900 - -
13 Sobic.009G183650 - -
14 Sobic.003G251900 expressed protein -
15 Sobic.001G082700 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.1 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
16 Sobic.005G110553 - -
17 Sobic.007G185000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G182400 - -
19 Sobic.009G047033 - -
20 Sobic.004G345200 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic007G175600 Sobic007G175600 Sobic003G234300--Sobic007G175600 Sobic002G037700 Sobic002G037700 Sobic003G234300--Sobic002G037700 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic003G234300--Sobic004G007200 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G234300--Sobic006G111400 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic003G234300--Sobic002G234800 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic003G234300--Sobic006G103800 Sobic010G242000 Sobic010G242000 Sobic003G234300--Sobic010G242000 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic003G234300--Sobic010G201444 Sobic004G221100 Sobic004G221100 Sobic003G234300--Sobic004G221100 Sobic007G175600--Sobic003G234300 Sobic007G175600--Sobic006G103800 Sobic007G175600--Sobic010G201444 Sobic007G175600--Sobic006G111400 Sobic007G175600--Sobic002G234800 Sobic007G175600--Sobic002G037700 Sobic007G175600--Sobic004G221100 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic007G175600--Sobic008G007100 Sobic005G083400 Sobic005G083400 Sobic007G175600--Sobic005G083400 Sobic002G037700--Sobic003G234300 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic002G037700--Sobic008G016800 Sobic002G037700--Sobic004G007200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G037700--Sobic005G110553 Sobic002G037700--Sobic010G242000 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic002G037700--Sobic008G159800 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic002G037700--Sobic002G197400 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic002G037700--Sobic007G226000 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic002G037700--Sobic001G367900 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic004G007200--Sobic006G024400 Sobic004G007200--Sobic003G234300 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G007200--Sobic009G079700 Sobic004G007200--Sobic002G037700 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic004G007200--Sobic010G210400 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic004G007200--Sobic002G215600 Sobic004G007200--Sobic006G111400 Sobic004G007200--Sobic001G367900 Sobic004G007200--Sobic008G159800 Sobic006G111400--Sobic008G007100 Sobic006G111400--Sobic002G234800 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic006G111400--Sobic006G169600 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic009G199900 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic006G111400--Sobic003G251900 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic003G234300 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic006G111400--Sobic004G350600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G111400--Sobic004G149000 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic002G234800--Sobic004G181000 Sobic002G234800--Sobic006G111400 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic002G234800--Sobic009G223900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic002G234800--Sobic008G103400 Sobic002G234800--Sobic003G251900 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic002G234800--Sobic002G110600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic002G234800--Sobic002G001500 Sobic002G234800--Sobic006G169600 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G234800--Sobic003G155800 Sobic006G103800--Sobic010G201444 Sobic006G103800--Sobic005G083400 Sobic006G103800--Sobic007G175600 Sobic006G103800--Sobic003G251900 Sobic006G103800--Sobic003G234300 Sobic006G103800--Sobic004G221100 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic006G103800--Sobic006G027800 Sobic006G103800--Sobic006G111400 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic006G103800--Sobic001G093732 Sobic005G025400 Sobic005G025400 Sobic010G242000--Sobic005G025400 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic010G242000--Sobic006G170800 Sobic010G242000--Sobic008G159800 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic010G242000--Sobic007G114650 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic010G242000--Sobic002G399000 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic010G242000--Sobic003G440500 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic010G242000--Sobic001G350300 Sobic008G134500 Sobic008G134500 Sobic010G242000--Sobic008G134500 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic010G242000--Sobic002G320700 Sobic010G201444--Sobic001G093732 Sobic010G201444--Sobic006G103800 Sobic010G201444--Sobic003G251900 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic010G201444--Sobic008G007200 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic010G201444--Sobic009G252600 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic010G201444--Sobic005G014400 Sobic010G201444--Sobic006G024400 Sobic010G201444--Sobic004G181000 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic010G201444--Sobic006G154900 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G221100--Sobic004G074400 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic004G221100--Sobic002G208700 Sobic004G221100--Sobic010G201444 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic004G221100--Sobic004G091300 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic004G221100--Sobic010G042300 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic004G221100--Sobic006G280250 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic004G221100--Sobic007G075600 Sobic004G221100--Sobic006G103800 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G221100--Sobic009G180900
Octagon: transcription factors


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