Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G073400.1
Synonym Sb01g006620
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WZ60
Pfam -
Panther DB PTHR36398 PTHR36398:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42765 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56320.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008377
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G290200 expressed protein -
2 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
3 Sobic.009G255000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G028500 expressed protein -
5 Sobic.004G208301 - K15429: TRM5, tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase
6 Sobic.004G282933 - -
7 Sobic.004G104200 berberine and berberine like domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G085900 - -
9 Sobic.001G048500 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G401300 - -
11 Sobic.002G191900 OsFBX325 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G219400 - -
13 Sobic.001G445600 DNA polymerase I, putative, expressed -
14 Sobic.008G140050 - -
15 Sobic.001G331650 - -
16 Sobic.010G002301 - -
17 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G078200 - -
19 Sobic.007G113566 - -
20 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G073400 Sobic001G073400 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic001G073400--Sobic003G290200 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G073400--Sobic009G192200 Sobic009G255000 Sobic009G255000 Sobic001G073400--Sobic009G255000 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic001G073400--Sobic005G028500 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic001G073400--Sobic004G208301 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic001G073400--Sobic004G282933 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic001G073400--Sobic004G104200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic001G073400--Sobic007G085900 Sobic001G048500 Sobic001G048500 Sobic001G073400--Sobic001G048500 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic003G290200--Sobic001G331650 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic003G290200--Sobic001G465600 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic003G290200--Sobic006G219400 Sobic003G401300 Sobic003G401300 Sobic003G290200--Sobic003G401300 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic003G290200--Sobic004G207800 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic003G290200--Sobic003G233266 Sobic003G290200--Sobic001G048500 Sobic003G290200--Sobic009G192200 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic003G290200--Sobic007G107800 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic009G192200--Sobic003G352000 Sobic009G255000--Sobic005G028500 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic009G255000--Sobic004G078200 Sobic009G255000--Sobic009G192200 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic009G255000--Sobic007G113566 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic009G255000--Sobic006G100150 Sobic009G255000--Sobic004G207800 Sobic009G255000--Sobic006G219400 Sobic009G255000--Sobic004G104200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic009G255000--Sobic004G303900 Sobic005G028500--Sobic004G078200 Sobic005G028500--Sobic006G219400 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic005G028500--Sobic003G271100 Sobic005G028500--Sobic009G192200 Sobic005G028500--Sobic009G255000 Sobic005G028500--Sobic007G113566 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic005G028500--Sobic002G191900 Sobic005G028500--Sobic001G465600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic005G028500--Sobic010G002301 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic004G208301--Sobic004G268600 Sobic004G208301--Sobic003G160300 Sobic004G208301--Sobic003G160433 Sobic004G208301--Sobic007G085900 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic004G208301--Sobic001G054050 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G208301--Sobic001G128000 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic004G208301--Sobic002G390200 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic004G208301--Sobic003G337200 Sobic004G208301--Sobic009G192200 Sobic004G282933--Sobic009G192200 Sobic004G282933--Sobic004G104200 Sobic004G282933--Sobic007G085900 Sobic004G282933--Sobic008G140050 Sobic004G282933--Sobic003G160300 Sobic004G282933--Sobic002G390200 Sobic004G282933--Sobic001G054050 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic004G282933--Sobic008G024900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic004G282933--Sobic003G160400 Sobic004G104200--Sobic004G282933 Sobic004G104200--Sobic009G192200 Sobic004G104200--Sobic007G085900 Sobic004G104200--Sobic008G140050 Sobic004G104200--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic004G104200--Sobic005G167100 Sobic004G104200--Sobic006G057100 Sobic004G104200--Sobic008G024900 Sobic004G104200--Sobic005G028500 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic001G048500--Sobic003G233266 Sobic001G048500--Sobic001G331650 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic001G048500--Sobic003G169000 Sobic001G048500--Sobic003G401300 Sobic001G048500--Sobic004G207800 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic001G048500--Sobic008G040501 Sobic001G048500--Sobic009G192200 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G048500--Sobic007G065000 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic001G048500--Sobic001G270800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.