Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G197600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QJX4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G046400 expressed protein -
2 Sobic.003G089300 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G211200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.004G001800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
5 Sobic.008G154700 expressed protein -
6 Sobic.007G179000 LRP1, putative, expressed -
7 Sobic.002G032500 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G366000 DUF623 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G135600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.004G302700 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G315500 ankyrin repeat domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G141300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.003G300400 expressed protein -
14 Sobic.010G192500 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.003G309400 OsSub4 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
16 Sobic.003G016200 expressed protein -
17 Sobic.004G211700 - -
18 Sobic.006G110850 - -
19 Sobic.009G047000 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
20 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase


Gene co-expression network
sample Sobic001G197600 Sobic001G197600 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic001G197600--Sobic001G046400 Sobic003G089300 Sobic003G089300 Sobic001G197600--Sobic003G089300 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic001G197600--Sobic007G211200 Sobic004G001800 Sobic004G001800 Sobic001G197600--Sobic004G001800 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic001G197600--Sobic008G154700 Sobic007G179000 Sobic007G179000 Sobic001G197600--Sobic007G179000 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic001G197600--Sobic002G032500 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic001G197600--Sobic003G366000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic001G197600--Sobic001G135600 Sobic001G046400--Sobic007G211200 Sobic008G150500 Sobic008G150500 Sobic001G046400--Sobic008G150500 Sobic006G187000 Sobic006G187000 Sobic001G046400--Sobic006G187000 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic001G046400--Sobic004G302700 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic001G046400--Sobic004G342000 Sobic002G337600 Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic002G337600 Sobic003G016200 Sobic003G016200 Sobic001G046400--Sobic003G016200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic004G211700 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic001G046400--Sobic003G283900 Sobic003G089300--Sobic007G211200 Sobic009G060800 Sobic009G060800 Sobic003G089300--Sobic009G060800 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic003G089300--Sobic010G192500 Sobic003G089300--Sobic002G032500 Sobic004G357000 Sobic004G357000 Sobic003G089300--Sobic004G357000 Sobic007G160300 Sobic007G160300 Sobic003G089300--Sobic007G160300 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic003G089300--Sobic001G286700 Sobic003G089300--Sobic004G211700 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic003G089300--Sobic001G155700 Sobic007G211200--Sobic001G046400 Sobic007G211200--Sobic004G357000 Sobic007G211200--Sobic003G089300 Sobic007G211200--Sobic002G032500 Sobic007G211200--Sobic004G211700 Sobic007G211200--Sobic004G342000 Sobic003G113500 Sobic003G113500 Sobic007G211200--Sobic003G113500 Sobic007G211200--Sobic001G135600 Sobic007G211200--Sobic002G337600 Sobic004G001800--Sobic001G197600 Sobic003G419700 Sobic003G419700 Sobic004G001800--Sobic003G419700 Sobic004G001800--Sobic008G154700 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic004G001800--Sobic003G338200 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic004G001800--Sobic006G219100 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic004G001800--Sobic007G094200 Sobic004G248100 Sobic004G248100 Sobic004G001800--Sobic004G248100 Sobic004G001800--Sobic002G032500 Sobic010G087800 Sobic010G087800 Sobic004G001800--Sobic010G087800 Sobic008G154700--Sobic007G094200 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic008G154700--Sobic002G416400 Sobic008G154700--Sobic006G219100 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic008G154700--Sobic003G300400 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic008G154700--Sobic010G027700 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic008G154700--Sobic001G438500 Sobic008G154700--Sobic002G032500 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic004G342000 Sobic002G355900 Sobic002G355900 Sobic007G179000--Sobic002G355900 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic007G179000--Sobic008G012600 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic007G179000--Sobic001G341700 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic007G179000--Sobic006G092300 Sobic001G159100 Sobic001G159100 Sobic007G179000--Sobic001G159100 Sobic003G009800 Sobic003G009800 Sobic007G179000--Sobic003G009800 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic007G179000--Sobic003G382400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic007G179000--Sobic010G049600 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic007G179000--Sobic001G491400 Sobic003G309400 Sobic003G309400 Sobic002G032500--Sobic003G309400 Sobic002G032500--Sobic007G094200 Sobic002G032500--Sobic003G300400 Sobic002G032500--Sobic007G211200 Sobic002G032500--Sobic004G211700 Sobic002G032500--Sobic003G089300 Sobic002G032500--Sobic004G248100 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic002G032500--Sobic005G091000 Sobic002G032500--Sobic003G338200 Sobic006G110850 Sobic006G110850 Sobic003G366000--Sobic006G110850 Sobic003G366000--Sobic006G187000 Sobic003G366000--Sobic009G060800 Sobic003G366000--Sobic004G302700 Sobic003G366000--Sobic010G192500 Sobic001G390400 Sobic001G390400 Sobic003G366000--Sobic001G390400 Sobic001G160000 Sobic001G160000 Sobic003G366000--Sobic001G160000 Sobic003G366000--Sobic001G046400 Sobic008G190000 Sobic008G190000 Sobic003G366000--Sobic008G190000 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic001G135600--Sobic009G141300 Sobic001G135600--Sobic004G302700 Sobic001G135600--Sobic004G211700 Sobic001G135600--Sobic003G089300 Sobic001G135600--Sobic007G211200 Sobic001G135600--Sobic001G046400 Sobic001G135600--Sobic001G286700 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic001G135600--Sobic002G011000 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic001G135600--Sobic009G254500
Octagon: transcription factors


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