Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G200100.2,Sobic.001G200100.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6H2 , A0A1Z5S6J6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G185400 expressed protein -
2 Sobic.002G120850 - -
3 Sobic.001G372600 DVR, putative, expressed K19073: divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase
4 Sobic.009G250700 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
5 Sobic.004G138650 - -
6 Sobic.008G048000 OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
7 Sobic.005G107400 POT family protein, expressed -
8 Sobic.006G024800 - -
9 Sobic.002G234500 beta-expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.002G352301 - -
11 Sobic.004G068350 - -
12 Sobic.002G328900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@TKL_IRAK_DUF26-lc.12 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
13 Sobic.002G083700 - -
14 Sobic.002G037300 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.008G159200 - -
16 Sobic.003G258000 wax synthase, putative, expressed -
17 Sobic.003G268650 - -
18 Sobic.001G252050 - -
19 Sobic.003G089400 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
20 Sobic.005G067000 OsWAK91 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G200100 Sobic001G200100 Sobic007G185400 Sobic007G185400 Sobic001G200100--Sobic007G185400 Sobic002G120850 Sobic002G120850 Sobic001G200100--Sobic002G120850 Sobic001G372600 Sobic001G372600 Sobic001G200100--Sobic001G372600 Sobic009G250700 Sobic009G250700 Sobic001G200100--Sobic009G250700 Sobic004G138650 Sobic004G138650 Sobic001G200100--Sobic004G138650 Sobic008G048000 Sobic008G048000 Sobic001G200100--Sobic008G048000 Sobic005G107400 Sobic005G107400 Sobic001G200100--Sobic005G107400 Sobic006G024800 Sobic006G024800 Sobic001G200100--Sobic006G024800 Sobic002G234500 Sobic002G234500 Sobic001G200100--Sobic002G234500 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic007G185400--Sobic008G159200 Sobic007G185400--Sobic002G120850 Sobic006G274833 Sobic006G274833 Sobic007G185400--Sobic006G274833 Sobic007G185400--Sobic006G024800 Sobic002G037300 Sobic002G037300 Sobic007G185400--Sobic002G037300 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic007G185400--Sobic007G078400 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic007G185400--Sobic003G035266 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic007G185400--Sobic003G268650 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic007G185400--Sobic005G067000 Sobic003G089400 Sobic003G089400 Sobic002G120850--Sobic003G089400 Sobic002G120850--Sobic008G048000 Sobic007G054300 Sobic007G054300 Sobic002G120850--Sobic007G054300 Sobic001G371500 Sobic001G371500 Sobic002G120850--Sobic001G371500 Sobic003G258000 Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic005G067000 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G120850--Sobic002G175000 Sobic002G044200 Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic007G078400 Sobic002G341500 Sobic002G341500 Sobic001G372600--Sobic002G341500 Sobic001G017000 Sobic001G017000 Sobic001G372600--Sobic001G017000 Sobic001G484300 Sobic001G484300 Sobic001G372600--Sobic001G484300 Sobic003G214800 Sobic003G214800 Sobic001G372600--Sobic003G214800 Sobic008G112300 Sobic008G112300 Sobic001G372600--Sobic008G112300 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G372600--Sobic003G058600 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic001G372600--Sobic004G076000 Sobic003G328200 Sobic003G328200 Sobic001G372600--Sobic003G328200 Sobic010G255600 Sobic010G255600 Sobic001G372600--Sobic010G255600 Sobic009G250700--Sobic005G107400 Sobic009G250700--Sobic006G024800 Sobic009G250700--Sobic007G185400 Sobic003G365900 Sobic003G365900 Sobic009G250700--Sobic003G365900 Sobic003G110866 Sobic003G110866 Sobic009G250700--Sobic003G110866 Sobic009G250700--Sobic002G037300 Sobic007G037700 Sobic007G037700 Sobic009G250700--Sobic007G037700 Sobic002G209500 Sobic002G209500 Sobic009G250700--Sobic002G209500 Sobic009G250700--Sobic002G120850 Sobic004G138650--Sobic002G044200 Sobic004G138650--Sobic002G120850 Sobic004G138650--Sobic003G089400 Sobic004G138650--Sobic008G048000 Sobic004G138650--Sobic003G258000 Sobic004G138650--Sobic007G054300 Sobic004G138650--Sobic001G371500 Sobic006G142365 Sobic006G142365 Sobic004G138650--Sobic006G142365 Sobic004G138650--Sobic002G175000 Sobic008G048000--Sobic003G089400 Sobic008G048000--Sobic001G371500 Sobic008G048000--Sobic007G054300 Sobic008G048000--Sobic002G120850 Sobic008G048000--Sobic003G258000 Sobic008G048000--Sobic002G044200 Sobic008G048000--Sobic005G067000 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic008G048000--Sobic003G094850 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic008G048000--Sobic005G102750 Sobic005G107400--Sobic009G250700 Sobic003G342300 Sobic003G342300 Sobic005G107400--Sobic003G342300 Sobic004G006100 Sobic004G006100 Sobic005G107400--Sobic004G006100 Sobic001G464700 Sobic001G464700 Sobic005G107400--Sobic001G464700 Sobic002G083700 Sobic002G083700 Sobic005G107400--Sobic002G083700 Sobic008G032701 Sobic008G032701 Sobic005G107400--Sobic008G032701 Sobic005G107400--Sobic001G372600 Sobic003G099400 Sobic003G099400 Sobic005G107400--Sobic003G099400 Sobic007G181000 Sobic007G181000 Sobic005G107400--Sobic007G181000 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic006G024800--Sobic005G190400 Sobic006G024800--Sobic002G037300 Sobic006G024800--Sobic005G102750 Sobic006G024800--Sobic003G094850 Sobic006G024800--Sobic008G159200 Sobic006G024800--Sobic003G268650 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic006G024800--Sobic003G066200 Sobic005G191000 Sobic005G191000 Sobic006G024800--Sobic005G191000 Sobic005G153033 Sobic005G153033 Sobic006G024800--Sobic005G153033 Sobic002G234500--Sobic002G120850 Sobic002G234500--Sobic004G138650 Sobic002G234500--Sobic003G258000 Sobic002G234500--Sobic008G048000 Sobic002G234500--Sobic003G089400 Sobic002G295200 Sobic002G295200 Sobic002G234500--Sobic002G295200 Sobic002G234500--Sobic002G175000 Sobic002G352301 Sobic002G352301 Sobic002G234500--Sobic002G352301 Sobic002G234500--Sobic007G054300
Octagon: transcription factors


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