Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G250700.1
Synonym Sb09g030130
Functional annotation pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed
UniProt C5YWL6
Pfam PF14432 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF107
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G01030 : pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g50950.1 : pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044788
Brachypodium KQK04628
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G107400 POT family protein, expressed -
2 Sobic.006G024800 - -
3 Sobic.007G185400 expressed protein -
4 Sobic.003G365900 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
5 Sobic.003G110866 - -
6 Sobic.002G037300 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.007G037700 expressed protein -
8 Sobic.002G209500 - -
9 Sobic.002G120850 - -
10 Sobic.001G372600 DVR, putative, expressed K19073: divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase
11 Sobic.009G066300 expressed protein -
12 Sobic.008G048000 OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
13 Sobic.004G080350 - -
14 Sobic.006G249100 expressed protein -
15 Sobic.002G304200 expressed protein -
16 Sobic.009G075300 expressed protein -
17 Sobic.001G200100 - -
18 Sobic.010G180750 - -
19 Sobic.002G093800 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G153033 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G250700 Sobic009G250700 Sobic005G107400 Sobic005G107400 Sobic009G250700--Sobic005G107400 Sobic006G024800 Sobic006G024800 Sobic009G250700--Sobic006G024800 Sobic007G185400 Sobic007G185400 Sobic009G250700--Sobic007G185400 Sobic003G365900 Sobic003G365900 Sobic009G250700--Sobic003G365900 Sobic003G110866 Sobic003G110866 Sobic009G250700--Sobic003G110866 Sobic002G037300 Sobic002G037300 Sobic009G250700--Sobic002G037300 Sobic007G037700 Sobic007G037700 Sobic009G250700--Sobic007G037700 Sobic002G209500 Sobic002G209500 Sobic009G250700--Sobic002G209500 Sobic002G120850 Sobic002G120850 Sobic009G250700--Sobic002G120850 Sobic005G107400--Sobic009G250700 Sobic003G342300 Sobic003G342300 Sobic005G107400--Sobic003G342300 Sobic004G006100 Sobic004G006100 Sobic005G107400--Sobic004G006100 Sobic001G464700 Sobic001G464700 Sobic005G107400--Sobic001G464700 Sobic002G083700 Sobic002G083700 Sobic005G107400--Sobic002G083700 Sobic008G032701 Sobic008G032701 Sobic005G107400--Sobic008G032701 Sobic001G372600 Sobic001G372600 Sobic005G107400--Sobic001G372600 Sobic003G099400 Sobic003G099400 Sobic005G107400--Sobic003G099400 Sobic007G181000 Sobic007G181000 Sobic005G107400--Sobic007G181000 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic006G024800--Sobic005G190400 Sobic006G024800--Sobic002G037300 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic006G024800--Sobic005G102750 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic006G024800--Sobic003G094850 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic006G024800--Sobic008G159200 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic006G024800--Sobic003G268650 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic006G024800--Sobic003G066200 Sobic005G191000 Sobic005G191000 Sobic006G024800--Sobic005G191000 Sobic005G153033 Sobic005G153033 Sobic006G024800--Sobic005G153033 Sobic007G185400--Sobic008G159200 Sobic007G185400--Sobic002G120850 Sobic006G274833 Sobic006G274833 Sobic007G185400--Sobic006G274833 Sobic007G185400--Sobic006G024800 Sobic007G185400--Sobic002G037300 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic007G185400--Sobic007G078400 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic007G185400--Sobic003G035266 Sobic007G185400--Sobic003G268650 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic007G185400--Sobic005G067000 Sobic004G253800 Sobic004G253800 Sobic003G365900--Sobic004G253800 Sobic009G035601 Sobic009G035601 Sobic003G365900--Sobic009G035601 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic003G365900--Sobic005G200600 Sobic006G249100 Sobic006G249100 Sobic003G365900--Sobic006G249100 Sobic002G141100 Sobic002G141100 Sobic003G365900--Sobic002G141100 Sobic009G119400 Sobic009G119400 Sobic003G365900--Sobic009G119400 Sobic002G033000 Sobic002G033000 Sobic003G365900--Sobic002G033000 Sobic010G219500 Sobic010G219500 Sobic003G365900--Sobic010G219500 Sobic008G066700 Sobic008G066700 Sobic003G365900--Sobic008G066700 Sobic003G110866--Sobic002G037300 Sobic003G110866--Sobic007G078400 Sobic003G110866--Sobic006G024800 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic003G110866--Sobic002G304200 Sobic003G110866--Sobic005G153033 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic003G110866--Sobic004G254200 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic003G110866--Sobic003G408700 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic003G110866--Sobic010G141700 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic003G110866--Sobic001G507933 Sobic002G037300--Sobic006G024800 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic002G037300--Sobic006G080050 Sobic002G037300--Sobic007G078400 Sobic007G084900 Sobic007G084900 Sobic002G037300--Sobic007G084900 Sobic002G037300--Sobic003G268650 Sobic001G515900 Sobic001G515900 Sobic002G037300--Sobic001G515900 Sobic002G037300--Sobic008G159200 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic002G037300--Sobic009G219601 Sobic004G071300 Sobic004G071300 Sobic002G037300--Sobic004G071300 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic007G037700--Sobic006G001400 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic007G037700--Sobic005G196500 Sobic010G202700 Sobic010G202700 Sobic007G037700--Sobic010G202700 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic007G037700--Sobic001G275800 Sobic006G233600 Sobic006G233600 Sobic007G037700--Sobic006G233600 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G037700--Sobic005G209900 Sobic009G196200 Sobic009G196200 Sobic007G037700--Sobic009G196200 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic007G037700--Sobic007G090415 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic007G037700--Sobic010G124200 Sobic009G066300 Sobic009G066300 Sobic002G209500--Sobic009G066300 Sobic009G075300 Sobic009G075300 Sobic002G209500--Sobic009G075300 Sobic001G211750 Sobic001G211750 Sobic002G209500--Sobic001G211750 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic002G209500--Sobic009G037400 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic002G209500--Sobic010G180750 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic002G209500--Sobic010G170800 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic002G209500--Sobic002G397001 Sobic008G082600 Sobic008G082600 Sobic002G209500--Sobic008G082600 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic002G209500--Sobic008G106550 Sobic003G089400 Sobic003G089400 Sobic002G120850--Sobic003G089400 Sobic008G048000 Sobic008G048000 Sobic002G120850--Sobic008G048000 Sobic007G054300 Sobic007G054300 Sobic002G120850--Sobic007G054300 Sobic001G371500 Sobic001G371500 Sobic002G120850--Sobic001G371500 Sobic003G258000 Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic005G067000 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G120850--Sobic002G175000 Sobic002G044200 Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic007G078400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.