Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G206800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QK15
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G096801 - -
2 Sobic.004G357066 - -
3 Sobic.010G158766 - -
4 Sobic.004G357033 - -
5 Sobic.001G220200 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G225450 - -
7 Sobic.001G410800 OsTOP6A3 - Topoisomerase 6 subunit A homolog 3, expressed K10878: meiotic recombination protein SPO11
8 Sobic.010G106400 - -
9 Sobic.006G103601 - -
10 Sobic.005G027032 - -
11 Sobic.009G250800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@polygalacturonase, putative, expressed -
12 Sobic.009G258150 - -
13 Sobic.009G225300 - -
14 Sobic.003G379500 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
15 Sobic.001G537600 expressed protein -
16 Sobic.002G218200 protein kinase domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G261553 - -
18 Sobic.004G344301 - -
19 Sobic.002G285800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
20 Sobic.001G308450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic001G206800--Sobic010G096801 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic001G206800--Sobic004G357066 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic001G206800--Sobic010G158766 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic001G206800--Sobic004G357033 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic001G206800--Sobic001G220200 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic001G206800--Sobic004G225450 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic001G206800--Sobic001G410800 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic001G206800--Sobic010G106400 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G206800--Sobic006G103601 Sobic010G096801--Sobic004G357066 Sobic010G096801--Sobic001G220200 Sobic010G096801--Sobic001G206800 Sobic010G096801--Sobic001G410800 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic010G096801--Sobic001G261553 Sobic010G096801--Sobic004G357033 Sobic010G096801--Sobic010G158766 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic010G096801--Sobic001G139600 Sobic002G218200 Sobic002G218200 Sobic010G096801--Sobic002G218200 Sobic004G357066--Sobic004G225450 Sobic004G357066--Sobic004G357033 Sobic004G357066--Sobic010G096801 Sobic004G357066--Sobic001G261553 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic004G357066--Sobic005G027032 Sobic004G344301 Sobic004G344301 Sobic004G357066--Sobic004G344301 Sobic004G357066--Sobic001G220200 Sobic004G357066--Sobic001G139600 Sobic004G357066--Sobic001G410800 Sobic010G158766--Sobic001G220200 Sobic010G158766--Sobic004G357033 Sobic010G158766--Sobic001G410800 Sobic010G158766--Sobic010G096801 Sobic010G158766--Sobic004G344301 Sobic009G225300 Sobic009G225300 Sobic010G158766--Sobic009G225300 Sobic006G259201 Sobic006G259201 Sobic010G158766--Sobic006G259201 Sobic010G158100 Sobic010G158100 Sobic010G158766--Sobic010G158100 Sobic007G224600 Sobic007G224600 Sobic010G158766--Sobic007G224600 Sobic004G357033--Sobic004G344301 Sobic004G357033--Sobic001G220200 Sobic004G357033--Sobic004G225450 Sobic004G357033--Sobic004G357066 Sobic004G357033--Sobic001G410800 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic004G357033--Sobic010G136601 Sobic001G223400 Sobic001G223400 Sobic004G357033--Sobic001G223400 Sobic004G357033--Sobic010G158766 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic004G357033--Sobic002G285800 Sobic001G220200--Sobic010G158766 Sobic001G220200--Sobic001G410800 Sobic001G220200--Sobic004G357033 Sobic001G220200--Sobic004G344301 Sobic001G220200--Sobic010G096801 Sobic001G220200--Sobic007G224600 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic001G220200--Sobic001G519300 Sobic001G220200--Sobic009G225300 Sobic001G220200--Sobic004G357066 Sobic004G225450--Sobic004G357066 Sobic004G225450--Sobic004G357033 Sobic004G225450--Sobic004G344301 Sobic004G225450--Sobic001G220200 Sobic004G225450--Sobic010G096801 Sobic004G225450--Sobic001G410800 Sobic004G225450--Sobic001G261553 Sobic004G225450--Sobic009G225300 Sobic004G225450--Sobic010G158766 Sobic001G410800--Sobic001G220200 Sobic001G410800--Sobic004G357033 Sobic001G410800--Sobic002G218200 Sobic001G410800--Sobic010G096801 Sobic001G535601 Sobic001G535601 Sobic001G410800--Sobic001G535601 Sobic001G410800--Sobic001G139600 Sobic001G410800--Sobic010G158766 Sobic001G410800--Sobic010G136601 Sobic001G410800--Sobic001G223400 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic010G106400--Sobic001G537600 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic010G106400--Sobic009G238200 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic010G106400--Sobic006G065200 Sobic010G106400--Sobic006G103601 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic010G106400--Sobic001G068901 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic010G106400--Sobic009G258150 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic010G106400--Sobic006G280900 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic010G106400--Sobic004G012100 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic010G106400--Sobic006G146400 Sobic006G103601--Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic002G285800 Sobic006G103601--Sobic010G106400 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic006G146400 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic006G103601--Sobic009G174600 Sobic006G103601--Sobic001G537600 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic009G258150
Octagon: transcription factors


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