Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G313301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8I5
Pfam PF13839
Panther DB PTHR13533
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03210 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g39400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052262 , Zm00025a003174
Brachypodium KQJ97603
Barley HORVU1Hr1G052000.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G436100 UDP-glucuronate 4-epimerase, putative, expressed K08679: UDP-glucuronate 4-epimerase
2 Sobic.002G075500 CESA8 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
3 Sobic.004G265600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G051300 galactosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.009G125900 expressed protein -
6 Sobic.008G043500 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G099100 endoglucanase, putative, expressed K01179: endoglucanase
8 Sobic.009G073400 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G090500 expressed protein -
10 Sobic.001G116000 dynamin family protein, putative, expressed K01528: dynamin 1/3
11 Sobic.009G026101 - -
12 Sobic.001G159800 KIP1, putative, expressed -
13 Sobic.001G196100 src homology-3 domain protein 3, putative, expressed -
14 Sobic.002G118700 -(PubMedID : 28944535)@CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
15 Sobic.004G007600 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G327600 domain of unknown function, DUF250 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G061000 DNA binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G133900 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
19 Sobic.003G353400 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
20 Sobic.002G342500 glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G313301 Sobic001G313301 Sobic001G436100 Sobic001G436100 Sobic001G313301--Sobic001G436100 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic001G313301--Sobic002G075500 Sobic004G265600 Sobic004G265600 Sobic001G313301--Sobic004G265600 Sobic004G051300 Sobic004G051300 Sobic001G313301--Sobic004G051300 Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic001G313301--Sobic009G125900 Sobic008G043500 Sobic008G043500 Sobic001G313301--Sobic008G043500 Sobic001G099100 Sobic001G099100 Sobic001G313301--Sobic001G099100 Sobic009G073400 Sobic009G073400 Sobic001G313301--Sobic009G073400 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic001G313301--Sobic010G090500 Sobic001G116000 Sobic001G116000 Sobic001G436100--Sobic001G116000 Sobic001G196100 Sobic001G196100 Sobic001G436100--Sobic001G196100 Sobic009G194200 Sobic009G194200 Sobic001G436100--Sobic009G194200 Sobic001G026600 Sobic001G026600 Sobic001G436100--Sobic001G026600 Sobic004G331900 Sobic004G331900 Sobic001G436100--Sobic004G331900 Sobic001G436100--Sobic002G075500 Sobic001G436100--Sobic001G313301 Sobic004G333100 Sobic004G333100 Sobic001G436100--Sobic004G333100 Sobic003G319000 Sobic003G319000 Sobic001G436100--Sobic003G319000 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic002G075500--Sobic009G063400 Sobic002G075500--Sobic009G125900 Sobic002G118700 Sobic002G118700 Sobic002G075500--Sobic002G118700 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic002G075500--Sobic009G026101 Sobic002G075500--Sobic004G051300 Sobic002G075500--Sobic001G099100 Sobic007G180900 Sobic007G180900 Sobic002G075500--Sobic007G180900 Sobic003G254700 Sobic003G254700 Sobic002G075500--Sobic003G254700 Sobic006G156600 Sobic006G156600 Sobic002G075500--Sobic006G156600 Sobic004G265600--Sobic009G125900 Sobic004G265600--Sobic001G116000 Sobic004G265600--Sobic009G063400 Sobic004G265600--Sobic009G026101 Sobic004G203900 Sobic004G203900 Sobic004G265600--Sobic004G203900 Sobic004G265600--Sobic002G075500 Sobic004G265600--Sobic003G254700 Sobic004G265600--Sobic010G090500 Sobic008G174900 Sobic008G174900 Sobic004G265600--Sobic008G174900 Sobic004G051300--Sobic001G099100 Sobic004G051300--Sobic002G118700 Sobic004G051300--Sobic009G125900 Sobic004G051300--Sobic002G075500 Sobic004G051300--Sobic009G026101 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic004G051300--Sobic002G276600 Sobic009G079100 Sobic009G079100 Sobic004G051300--Sobic009G079100 Sobic004G051300--Sobic010G090500 Sobic004G051300--Sobic009G063400 Sobic009G125900--Sobic009G063400 Sobic009G125900--Sobic009G026101 Sobic009G125900--Sobic002G075500 Sobic009G125900--Sobic002G118700 Sobic009G125900--Sobic010G090500 Sobic009G125900--Sobic004G265600 Sobic010G096100 Sobic010G096100 Sobic009G125900--Sobic010G096100 Sobic009G125900--Sobic004G051300 Sobic009G125900--Sobic003G254700 Sobic004G159100 Sobic004G159100 Sobic008G043500--Sobic004G159100 Sobic002G271300 Sobic002G271300 Sobic008G043500--Sobic002G271300 Sobic008G043500--Sobic001G313301 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic008G043500--Sobic001G133900 Sobic002G252000 Sobic002G252000 Sobic008G043500--Sobic002G252000 Sobic003G444200 Sobic003G444200 Sobic008G043500--Sobic003G444200 Sobic001G008900 Sobic001G008900 Sobic008G043500--Sobic001G008900 Sobic003G161500 Sobic003G161500 Sobic008G043500--Sobic003G161500 Sobic008G043500--Sobic001G436100 Sobic001G099100--Sobic004G051300 Sobic001G099100--Sobic002G118700 Sobic001G099100--Sobic002G276600 Sobic001G099100--Sobic002G075500 Sobic001G099100--Sobic010G090500 Sobic001G099100--Sobic009G026101 Sobic001G099100--Sobic009G125900 Sobic003G353400 Sobic003G353400 Sobic001G099100--Sobic003G353400 Sobic001G099100--Sobic009G079100 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic009G073400--Sobic009G061000 Sobic003G345200 Sobic003G345200 Sobic009G073400--Sobic003G345200 Sobic003G017500 Sobic003G017500 Sobic009G073400--Sobic003G017500 Sobic006G173200 Sobic006G173200 Sobic009G073400--Sobic006G173200 Sobic001G159800 Sobic001G159800 Sobic009G073400--Sobic001G159800 Sobic006G172200 Sobic006G172200 Sobic009G073400--Sobic006G172200 Sobic004G146300 Sobic004G146300 Sobic009G073400--Sobic004G146300 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic009G073400--Sobic009G206500 Sobic009G073400--Sobic010G090500 Sobic010G090500--Sobic001G159800 Sobic010G120300 Sobic010G120300 Sobic010G090500--Sobic010G120300 Sobic010G090500--Sobic009G206500 Sobic010G090500--Sobic009G079100 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic010G090500--Sobic001G437500 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic010G090500--Sobic006G267500 Sobic001G073150 Sobic001G073150 Sobic010G090500--Sobic001G073150 Sobic010G090500--Sobic009G061000 Sobic010G090500--Sobic009G125900
Octagon: transcription factors


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