Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G341400.1
Synonym Sb01g032800
Functional annotation nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S993
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF40
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13840 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g29480.1 : nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002814 , Zm00025a052167
Brachypodium KQK21317
Barley HORVU7Hr1G115720.1 , HORVU7Hr1G115720.3 , HORVU7Hr1G115720.2 , HORVU2Hr1G040860.6 , HORVU2Hr1G040860.7 , HORVU2Hr1G040860.4 , HORVU2Hr1G040860.5 , HORVU2Hr1G040860.2 , HORVU2Hr1G040860.3 , HORVU2Hr1G040860.1 , HORVU7Hr1G060780.1 , HORVU5Hr1G117780.3 , HORVU5Hr1G117780.2 , HORVU5Hr1G117780.1 , HORVU5Hr1G117780.6 , HORVU5Hr1G117780.5 , HORVU5Hr1G117780.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110514 - -
2 Sobic.009G106100 GCRP9 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed -
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10 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
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13 Sobic.003G007400 expressed protein -
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20 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G341400 Sobic001G341400 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic001G341400--Sobic005G110514 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic001G341400--Sobic009G106100 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic001G341400--Sobic004G003100 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic001G341400--Sobic004G002901 Sobic007G186700 Sobic007G186700 Sobic001G341400--Sobic007G186700 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic001G341400--Sobic003G083800 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic001G341400--Sobic007G111800 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic001G341400--Sobic005G197400 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic001G341400--Sobic004G308500 Sobic005G110514--Sobic004G003100 Sobic005G110514--Sobic004G308500 Sobic009G233100 Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G106100 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic005G110514--Sobic003G007400 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic005G110514--Sobic007G186500 Sobic001G506800 Sobic001G506800 Sobic005G110514--Sobic001G506800 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G110514--Sobic005G216600 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic005G110514--Sobic004G121600 Sobic009G106100--Sobic003G083800 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic010G152500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic009G106100--Sobic004G009200 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic009G106100--Sobic003G382200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic007G111800 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G197400 Sobic004G003100--Sobic005G110514 Sobic004G003100--Sobic009G233100 Sobic004G003100--Sobic003G007400 Sobic010G013000 Sobic010G013000 Sobic004G003100--Sobic010G013000 Sobic005G206000 Sobic005G206000 Sobic004G003100--Sobic005G206000 Sobic004G003100--Sobic004G308500 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic004G003100--Sobic009G095800 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic004G003100--Sobic001G301000 Sobic004G003100--Sobic007G186500 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic004G002901--Sobic005G060200 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic004G002901--Sobic005G197500 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic004G002901--Sobic010G268700 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic004G002901--Sobic004G346300 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic004G002901--Sobic001G271300 Sobic004G002901--Sobic007G111800 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic004G002901--Sobic007G212000 Sobic010G245400 Sobic010G245400 Sobic004G002901--Sobic010G245400 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic004G002901--Sobic003G443700 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic007G186700--Sobic006G121000 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic007G186700--Sobic002G178200 Sobic007G186700--Sobic004G002901 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic007G186700--Sobic005G216400 Sobic007G186700--Sobic005G060200 Sobic007G186700--Sobic007G111800 Sobic006G229901 Sobic006G229901 Sobic007G186700--Sobic006G229901 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic007G186700--Sobic007G015000 Sobic007G186700--Sobic007G212000 Sobic003G083800--Sobic009G106100 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic003G083800--Sobic007G015100 Sobic003G083800--Sobic010G152500 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic003G083800--Sobic002G029500 Sobic003G083800--Sobic004G009200 Sobic003G083800--Sobic005G106300 Sobic003G083800--Sobic007G111800 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic003G083800--Sobic005G182900 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic003G083800--Sobic010G242800 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic007G111800--Sobic006G097900 Sobic007G111800--Sobic007G015000 Sobic007G111800--Sobic010G268700 Sobic007G111800--Sobic001G271300 Sobic007G111800--Sobic007G212000 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic007G111800--Sobic001G293100 Sobic007G111800--Sobic005G106300 Sobic007G111800--Sobic010G152500 Sobic007G111800--Sobic003G083800 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic004G308500--Sobic002G289500 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic004G308500--Sobic004G014600 Sobic004G308500--Sobic004G121600 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic004G308500--Sobic001G415100 Sobic004G308500--Sobic007G111800 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic004G308500--Sobic005G046400 Sobic004G308500--Sobic005G106300 Sobic004G308500--Sobic006G097900 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic004G308500--Sobic003G441800
Octagon: transcription factors


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