Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G362701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA02
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF92
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G59610 : F-box family protein / jacalin lectin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g46140.1 : OsFBX101 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G320400 - -
2 Sobic.005G013800 WRKY104, expressed -
3 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
4 Sobic.002G223100 annexin, putative, expressed -
5 Sobic.001G539760 - -
6 Sobic.010G025100 HORMA domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G267300 expressed protein -
8 Sobic.004G139400 - -
9 Sobic.006G172400 expressed protein -
10 Sobic.003G157800 - -
11 Sobic.009G053001 - -
12 Sobic.004G200600 - -
13 Sobic.008G059566 - -
14 Sobic.001G162900 zinc finger protein-related, putative, expressed K11968: ariadne-1
15 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
16 Sobic.007G069450 - -
17 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
18 Sobic.004G303150 - -
19 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
20 Sobic.001G022000 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase


Gene co-expression network
sample Sobic001G362701 Sobic001G362701 Sobic003G320400 Sobic003G320400 Sobic001G362701--Sobic003G320400 Sobic005G013800 Sobic005G013800 Sobic001G362701--Sobic005G013800 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic001G362701--Sobic001G241500 Sobic002G223100 Sobic002G223100 Sobic001G362701--Sobic002G223100 Sobic001G539760 Sobic001G539760 Sobic001G362701--Sobic001G539760 Sobic010G025100 Sobic010G025100 Sobic001G362701--Sobic010G025100 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic001G362701--Sobic002G267300 Sobic004G139400 Sobic004G139400 Sobic001G362701--Sobic004G139400 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic001G362701--Sobic006G172400 Sobic008G059566 Sobic008G059566 Sobic003G320400--Sobic008G059566 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic003G320400--Sobic002G078600 Sobic003G320400--Sobic001G539760 Sobic003G038901 Sobic003G038901 Sobic003G320400--Sobic003G038901 Sobic009G117800 Sobic009G117800 Sobic003G320400--Sobic009G117800 Sobic002G303950 Sobic002G303950 Sobic003G320400--Sobic002G303950 Sobic009G196100 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