Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G025100.1
Synonym ATASY1, ASY1
Functional annotation HORMA domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5Z3F1
Pfam PF02301
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67370 : DNA-binding HORMA family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g10570.1 : HORMA domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G215400 expressed protein -
2 Sobic.003G256300 transcription factor Dp, putative, expressed -
3 Sobic.006G096800 expressed protein -
4 Sobic.001G443300 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03353: APC6, anaphase-promoting complex subunit 6
5 Sobic.001G125600 - -
6 Sobic.008G131651 - -
7 Sobic.002G057050 - -
8 Sobic.008G012500 - -
9 Sobic.008G023801 - -
10 Sobic.002G108000 myosin, putative, expressed -
11 Sobic.001G162900 zinc finger protein-related, putative, expressed K11968: ariadne-1
12 Sobic.009G251600 cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial precursor, putative, expressed K02265: cytochrome c oxidase subunit 5b
13 Sobic.001G106300 fanconi anemia L, putative, expressed K10606: FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL
14 Sobic.003G066400 - -
15 Sobic.002G125500 aquaporin protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G226950 - -
17 Sobic.008G164375 - -
18 Sobic.010G056900 - -
19 Sobic.010G201100 expressed protein -
20 Sobic.007G025350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G025100 Sobic010G025100 Sobic010G215400 Sobic010G215400 Sobic010G025100--Sobic010G215400 Sobic003G256300 Sobic003G256300 Sobic010G025100--Sobic003G256300 Sobic006G096800 Sobic006G096800 Sobic010G025100--Sobic006G096800 Sobic001G443300 Sobic001G443300 Sobic010G025100--Sobic001G443300 Sobic001G125600 Sobic001G125600 Sobic010G025100--Sobic001G125600 Sobic008G131651 Sobic008G131651 Sobic010G025100--Sobic008G131651 Sobic002G057050 Sobic002G057050 Sobic010G025100--Sobic002G057050 Sobic008G012500 Sobic008G012500 Sobic010G025100--Sobic008G012500 Sobic008G023801 Sobic008G023801 Sobic010G025100--Sobic008G023801 Sobic004G071700 Sobic004G071700 Sobic010G215400--Sobic004G071700 Sobic001G174400 Sobic001G174400 Sobic010G215400--Sobic001G174400 Sobic010G215400--Sobic003G256300 Sobic010G142600 Sobic010G142600 Sobic010G215400--Sobic010G142600 Sobic001G153500 Sobic001G153500 Sobic010G215400--Sobic001G153500 Sobic004G264100 Sobic004G264100 Sobic010G215400--Sobic004G264100 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic010G215400--Sobic004G079600 Sobic001G207900 Sobic001G207900 Sobic010G215400--Sobic001G207900 Sobic009G167400 Sobic009G167400 Sobic010G215400--Sobic009G167400 Sobic003G256300--Sobic004G071700 Sobic003G256300--Sobic001G153500 Sobic003G256300--Sobic010G215400 Sobic003G256300--Sobic004G264100 Sobic003G216400 Sobic003G216400 Sobic003G256300--Sobic003G216400 Sobic003G256300--Sobic004G079600 Sobic003G256300--Sobic001G207900 Sobic003G256300--Sobic001G174400 Sobic001G135900 Sobic001G135900 Sobic003G256300--Sobic001G135900 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic006G096800--Sobic003G342500 Sobic002G151500 Sobic002G151500 Sobic006G096800--Sobic002G151500 Sobic006G156400 Sobic006G156400 Sobic006G096800--Sobic006G156400 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic006G096800--Sobic004G298600 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic006G096800--Sobic005G048600 Sobic009G201000 Sobic009G201000 Sobic006G096800--Sobic009G201000 Sobic010G057600 Sobic010G057600 Sobic006G096800--Sobic010G057600 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic006G096800--Sobic003G352900 Sobic001G073700 Sobic001G073700 Sobic006G096800--Sobic001G073700 Sobic001G106300 Sobic001G106300 Sobic001G443300--Sobic001G106300 Sobic008G164375 Sobic008G164375 Sobic001G443300--Sobic008G164375 Sobic001G443300--Sobic002G057050 Sobic001G443300--Sobic010G215400 Sobic001G443300--Sobic003G256300 Sobic004G313700 Sobic004G313700 Sobic001G443300--Sobic004G313700 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic001G443300--Sobic004G290400 Sobic002G241700 Sobic002G241700 Sobic001G443300--Sobic002G241700 Sobic001G443300--Sobic010G025100 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic001G125600--Sobic003G444700 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G125600--Sobic003G192200 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic001G125600--Sobic003G131900 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic001G125600--Sobic010G257900 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic001G125600--Sobic001G120800 Sobic010G056900 Sobic010G056900 Sobic001G125600--Sobic010G056900 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic001G125600--Sobic006G130900 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic001G125600--Sobic001G160900 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic001G125600--Sobic002G102600 Sobic008G131651--Sobic001G135900 Sobic002G213100 Sobic002G213100 Sobic008G131651--Sobic002G213100 Sobic008G131651--Sobic003G192200 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic008G131651--Sobic003G193600 Sobic008G131651--Sobic004G079600 Sobic008G131651--Sobic003G131900 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic008G131651--Sobic005G125200 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic008G131651--Sobic008G131300 Sobic008G131651--Sobic001G160900 Sobic002G057050--Sobic001G106300 Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic002G057050--Sobic009G063450 Sobic002G057050--Sobic001G443300 Sobic002G057050--Sobic004G290400 Sobic008G038700 Sobic008G038700 Sobic002G057050--Sobic008G038700 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic002G057050--Sobic002G267300 Sobic009G031450 Sobic009G031450 Sobic002G057050--Sobic009G031450 Sobic010G042700 Sobic010G042700 Sobic002G057050--Sobic010G042700 Sobic001G162900 Sobic001G162900 Sobic002G057050--Sobic001G162900 Sobic008G012500--Sobic010G142600 Sobic008G012500--Sobic008G023801 Sobic008G012500--Sobic006G130900 Sobic008G012500--Sobic003G444700 Sobic008G012500--Sobic001G120800 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic008G012500--Sobic004G240700 Sobic008G012500--Sobic010G257900 Sobic008G012500--Sobic010G056900 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic008G012500--Sobic005G072850 Sobic008G023801--Sobic010G056900 Sobic008G023801--Sobic003G192200 Sobic008G023801--Sobic003G131900 Sobic008G023801--Sobic003G444700 Sobic008G023801--Sobic010G257900 Sobic008G023801--Sobic002G102600 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic008G023801--Sobic005G098100 Sobic008G023801--Sobic001G125600 Sobic008G023801--Sobic001G120800
Octagon: transcription factors


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