Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G131651.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6H6
Pfam PF02902
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g03180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G135900 transferase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G213100 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
3 Sobic.003G192200 transporter family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G193600 expressed protein -
5 Sobic.004G079600 - -
6 Sobic.003G131900 expressed protein -
7 Sobic.005G125200 OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
9 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
10 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
11 Sobic.003G166001 - -
12 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
14 Sobic.001G433500 expressed protein -
15 Sobic.005G054501 - -
16 Sobic.009G095640 - -
17 Sobic.005G098100 - -
18 Sobic.006G037100 expressed protein -
19 Sobic.003G444700 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
20 Sobic.008G023801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G131651 Sobic008G131651 Sobic001G135900 Sobic001G135900 Sobic008G131651--Sobic001G135900 Sobic002G213100 Sobic002G213100 Sobic008G131651--Sobic002G213100 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic008G131651--Sobic003G192200 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic008G131651--Sobic003G193600 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic008G131651--Sobic004G079600 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic008G131651--Sobic003G131900 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic008G131651--Sobic005G125200 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic008G131651--Sobic008G131300 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic008G131651--Sobic001G160900 Sobic001G135900--Sobic002G213100 Sobic001G135900--Sobic003G193600 Sobic001G135900--Sobic004G079600 Sobic009G095640 Sobic009G095640 Sobic001G135900--Sobic009G095640 Sobic001G135900--Sobic005G125200 Sobic001G135900--Sobic003G192200 Sobic002G295600 Sobic002G295600 Sobic001G135900--Sobic002G295600 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic001G135900--Sobic005G054501 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic001G135900--Sobic007G051200 Sobic002G213100--Sobic001G135900 Sobic002G213100--Sobic003G193600 Sobic002G213100--Sobic009G095640 Sobic002G213100--Sobic004G079600 Sobic002G213100--Sobic005G054501 Sobic002G213100--Sobic002G295600 Sobic002G213100--Sobic007G051200 Sobic002G213100--Sobic005G125200 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic002G213100--Sobic006G251100 Sobic003G192200--Sobic003G131900 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic003G192200--Sobic003G444700 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic003G192200--Sobic010G257900 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic003G192200--Sobic001G120800 Sobic010G056900 Sobic010G056900 Sobic003G192200--Sobic010G056900 Sobic001G125600 Sobic001G125600 Sobic003G192200--Sobic001G125600 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic003G192200--Sobic002G102600 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic003G192200--Sobic006G130900 Sobic003G192200--Sobic001G160900 Sobic003G193600--Sobic007G051200 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic003G193600--Sobic008G129800 Sobic003G193600--Sobic004G079600 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic003G193600--Sobic002G305800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic003G193600--Sobic004G163900 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic007G051200 Sobic004G079600--Sobic003G193600 Sobic004G079600--Sobic008G080700 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G251100 Sobic004G079600--Sobic002G305800 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic004G079600--Sobic006G037100 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic004G079600--Sobic004G080600 Sobic003G131900--Sobic003G444700 Sobic003G131900--Sobic003G192200 Sobic003G131900--Sobic010G257900 Sobic003G131900--Sobic010G056900 Sobic003G131900--Sobic002G102600 Sobic003G131900--Sobic001G120800 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic003G131900--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic003G131900--Sobic003G400700 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic003G131900--Sobic001G433500 Sobic005G125200--Sobic001G160900 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic005G125200--Sobic004G338900 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic005G125200--Sobic002G160200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic005G125200--Sobic009G044200 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic005G125200--Sobic006G099200 Sobic005G125200--Sobic003G193600 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic005G125200--Sobic005G027250 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic005G125200--Sobic007G204800 Sobic005G125200--Sobic008G129800 Sobic008G131300--Sobic002G122500 Sobic008G131300--Sobic008G080700 Sobic008G131300--Sobic006G037100 Sobic008G131300--Sobic008G129800 Sobic008G131300--Sobic002G305800 Sobic008G131300--Sobic004G163900 Sobic008G131300--Sobic003G166001 Sobic008G131300--Sobic003G400700 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G131300--Sobic003G322000 Sobic001G160900--Sobic007G204800 Sobic001G160900--Sobic002G160200 Sobic001G160900--Sobic004G338900 Sobic001G160900--Sobic002G102600 Sobic001G160900--Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic006G099200 Sobic001G160900--Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic001G120800 Sobic001G160900--Sobic010G257900
Octagon: transcription factors


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