Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G461200.1
Synonym Sb01g043280
Functional annotation DUF538 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WTP2
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03350 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g11210.1 : DUF538 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053111 , Zm00025a001080
Brachypodium KQK22979
Barley HORVU4Hr1G069070.10 , HORVU4Hr1G069070.6 , HORVU4Hr1G069070.7 , HORVU4Hr1G069070.4 , HORVU4Hr1G069070.5 , HORVU4Hr1G069070.2 , HORVU4Hr1G069070.3 , HORVU4Hr1G069070.1 , HORVU4Hr1G069070.8 , HORVU4Hr1G069070.9
Wheat TraesCS4A02G052400 , TraesCS4D02G251700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G242501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G461200 Sobic001G461200 Sobic003G030700 Sobic003G030700 Sobic001G461200--Sobic003G030700 Sobic008G148500 Sobic008G148500 Sobic001G461200--Sobic008G148500 Sobic001G047900 Sobic001G047900 Sobic001G461200--Sobic001G047900 Sobic004G288500 Sobic004G288500 Sobic001G461200--Sobic004G288500 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic001G461200--Sobic009G175200 Sobic008G064601 Sobic008G064601 Sobic001G461200--Sobic008G064601 Sobic008G039800 Sobic008G039800 Sobic001G461200--Sobic008G039800 Sobic004G044100 Sobic004G044100 Sobic001G461200--Sobic004G044100 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic001G461200--Sobic009G134000 Sobic009G124800 Sobic009G124800 Sobic003G030700--Sobic009G124800 Sobic001G074100 Sobic001G074100 Sobic003G030700--Sobic001G074100 Sobic003G030700--Sobic009G134000 Sobic002G142500 Sobic002G142500 Sobic003G030700--Sobic002G142500 Sobic001G113800 Sobic001G113800 Sobic003G030700--Sobic001G113800 Sobic003G291000 Sobic003G291000 Sobic003G030700--Sobic003G291000 Sobic001G047200 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Octagon: transcription factors


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