Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G528350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SC85
Pfam -
Panther DB PTHR21576 PTHR21576:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30680 : toprim domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45980.1 : toprim domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041940
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G154200 serine carboxypeptidase, putative, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
2 Sobic.007G118400 cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G208301 - K15429: TRM5, tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase
4 Sobic.002G104600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G079725 - -
6 Sobic.007G141300 - -
7 Sobic.001G350400 steroid binding protein, putative, expressed K13484: 5-hydroxyisourate hydrolase / 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase
8 Sobic.002G322101 - -
9 Sobic.003G097701 - -
10 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
11 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G020350 - -
13 Sobic.003G255850 - -
14 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G397700 - -
16 Sobic.003G128575 - -
17 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
18 Sobic.002G394433 - -
19 Sobic.007G149750 - -
20 Sobic.006G093550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G528350 Sobic001G528350 Sobic003G154200 Sobic003G154200 Sobic001G528350--Sobic003G154200 Sobic007G118400 Sobic007G118400 Sobic001G528350--Sobic007G118400 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic001G528350--Sobic004G208301 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic001G528350--Sobic002G104600 Sobic003G079725 Sobic003G079725 Sobic001G528350--Sobic003G079725 Sobic007G141300 Sobic007G141300 Sobic001G528350--Sobic007G141300 Sobic001G350400 Sobic001G350400 Sobic001G528350--Sobic001G350400 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic001G528350--Sobic002G322101 Sobic003G097701 Sobic003G097701 Sobic001G528350--Sobic003G097701 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic003G154200--Sobic010G173600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic003G154200--Sobic006G147350 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G154200--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G154200--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G154200--Sobic006G017266 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic003G154200--Sobic001G249900 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic003G154200--Sobic006G020350 Sobic003G154200--Sobic002G104600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G154200--Sobic009G069450 Sobic007G118400--Sobic004G208301 Sobic007G123700 Sobic007G123700 Sobic007G118400--Sobic007G123700 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic007G118400--Sobic003G337200 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic007G118400--Sobic003G172450 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic007G118400--Sobic006G139200 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic007G118400--Sobic005G068300 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic007G118400--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic007G118400--Sobic002G397700 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic007G118400--Sobic004G268600 Sobic004G208301--Sobic004G268600 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic004G208301--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G208301--Sobic003G160433 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic004G208301--Sobic007G085900 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic004G208301--Sobic001G054050 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G208301--Sobic001G128000 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic004G208301--Sobic002G390200 Sobic004G208301--Sobic003G337200 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic004G208301--Sobic009G192200 Sobic007G164101 Sobic007G164101 Sobic002G104600--Sobic007G164101 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic006G017266 Sobic002G104600--Sobic005G093600 Sobic002G104600--Sobic006G147350 Sobic002G104600--Sobic003G128575 Sobic002G104600--Sobic006G020350 Sobic002G104600--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G104600--Sobic003G255850 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic003G079725--Sobic006G078450 Sobic003G079725--Sobic006G017266 Sobic003G079725--Sobic006G020350 Sobic003G079725--Sobic003G128575 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic003G079725--Sobic005G183450 Sobic003G079725--Sobic005G093600 Sobic003G079725--Sobic009G069450 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G079725--Sobic001G365332 Sobic003G079725--Sobic010G173600 Sobic007G028200 Sobic007G028200 Sobic007G141300--Sobic007G028200 Sobic007G141300--Sobic003G097701 Sobic005G166900 Sobic005G166900 Sobic007G141300--Sobic005G166900 Sobic002G025000 Sobic002G025000 Sobic007G141300--Sobic002G025000 Sobic007G141650 Sobic007G141650 Sobic007G141300--Sobic007G141650 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic007G141300--Sobic010G225400 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic007G141300--Sobic001G011600 Sobic005G096450 Sobic005G096450 Sobic007G141300--Sobic005G096450 Sobic007G141300--Sobic010G107901 Sobic001G350400--Sobic006G020350 Sobic001G350400--Sobic003G128575 Sobic001G350400--Sobic006G017266 Sobic001G350400--Sobic005G093600 Sobic001G350400--Sobic005G183450 Sobic002G394433 Sobic002G394433 Sobic001G350400--Sobic002G394433 Sobic001G350400--Sobic001G365332 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic001G350400--Sobic006G005550 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic001G350400--Sobic002G174000 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic006G093550 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic002G322101--Sobic007G149750 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic010G173600 Sobic002G322101--Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic006G147350 Sobic002G322101--Sobic001G249900 Sobic002G322101--Sobic002G397700 Sobic002G322101--Sobic010G107901 Sobic003G097701--Sobic005G166900 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic003G097701--Sobic005G167100 Sobic003G097701--Sobic001G054050 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic003G097701--Sobic010G107601 Sobic003G097701--Sobic002G025000 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G097701--Sobic003G172400 Sobic003G097701--Sobic010G225400 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G097701--Sobic008G140050 Sobic003G097701--Sobic007G141650
Octagon: transcription factors


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