Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G118400.1,Sobic.007G118400.2
Synonym ATCB5LP, CB5LP, B5#5, Sb07g019410
Functional annotation cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed
UniProt C5YKM1
Pfam PF00173
Panther DB PTHR19359 PTHR19359:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G60660 : cytochrome B5-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g29669.1 : cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030973 , Zm00025a006016
Brachypodium KQJ91841 , KQJ98085
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G118400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G208301 - K15429: TRM5, tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase
2 Sobic.007G123700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G172450 - -
5 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
6 Sobic.005G068300 - -
7 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
8 Sobic.002G397700 - -
9 Sobic.004G268600 nodulin, putative, expressed -
10 Sobic.009G087480 - -
11 Sobic.002G040550 - -
12 Sobic.004G234766 - -
13 Sobic.006G093550 - -
14 Sobic.008G024900 expressed protein -
15 Sobic.010G133225 - -
16 Sobic.002G322101 - -
17 Sobic.010G241450 - -
18 Sobic.002G180732 - -
19 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.007G149750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G118400 Sobic007G118400 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic007G118400--Sobic004G208301 Sobic007G123700 Sobic007G123700 Sobic007G118400--Sobic007G123700 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic007G118400--Sobic003G337200 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic007G118400--Sobic003G172450 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic007G118400--Sobic006G139200 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic007G118400--Sobic005G068300 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic007G118400--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic007G118400--Sobic002G397700 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic007G118400--Sobic004G268600 Sobic004G208301--Sobic004G268600 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic004G208301--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G208301--Sobic003G160433 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic004G208301--Sobic007G085900 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic004G208301--Sobic001G054050 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G208301--Sobic001G128000 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic004G208301--Sobic002G390200 Sobic004G208301--Sobic003G337200 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic004G208301--Sobic009G192200 Sobic007G123700--Sobic006G139200 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic007G123700--Sobic002G040550 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic007G123700--Sobic009G087480 Sobic007G123700--Sobic003G172450 Sobic007G123700--Sobic002G390200 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic007G123700--Sobic008G024900 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic007G123700--Sobic002G180732 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic007G123700--Sobic004G282933 Sobic007G123700--Sobic010G107901 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic003G337200--Sobic004G234766 Sobic003G337200--Sobic010G107901 Sobic003G337200--Sobic004G268600 Sobic003G337200--Sobic002G397700 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic003G337200--Sobic006G093550 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic003G337200--Sobic002G322101 Sobic003G337200--Sobic003G172450 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic003G337200--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic003G337200--Sobic007G149750 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic006G139200--Sobic002G040550 Sobic006G139200--Sobic003G172450 Sobic006G139200--Sobic002G390200 Sobic006G139200--Sobic002G180732 Sobic006G139200--Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic010G107901 Sobic006G139200--Sobic002G397700 Sobic006G139200--Sobic003G160300 Sobic006G139200--Sobic004G234766 Sobic005G068300--Sobic003G172450 Sobic005G068300--Sobic010G107901 Sobic005G068300--Sobic004G234766 Sobic005G068300--Sobic002G397700 Sobic005G068300--Sobic006G093550 Sobic005G068300--Sobic003G337200 Sobic005G068300--Sobic010G225400 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic005G068300--Sobic001G249900 Sobic005G030266 Sobic005G030266 Sobic005G068300--Sobic005G030266 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic010G107901 Sobic002G397700--Sobic004G234766 Sobic002G397700--Sobic006G093550 Sobic002G397700--Sobic003G172450 Sobic002G397700--Sobic002G322101 Sobic002G397700--Sobic010G133225 Sobic002G397700--Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic003G337200 Sobic004G268600--Sobic003G337200 Sobic004G268600--Sobic001G128000 Sobic004G268600--Sobic002G180732 Sobic004G268600--Sobic004G234766 Sobic004G268600--Sobic003G160433 Sobic005G163932 Sobic005G163932 Sobic004G268600--Sobic005G163932 Sobic004G268600--Sobic010G107901 Sobic004G268600--Sobic008G024900 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic004G268600--Sobic003G119750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.