Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G019400.1,Sobic.002G019400.2
Synonym Sb02g001820
Functional annotation OsMADS69 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed
UniProt C5X8M6 , A0A1W0W1X6 , A0A125QUG6
Pfam -
Panther DB PTHR33186 PTHR33186:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20440.1,LOC_Os08g20492.1 : OsMADS69 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed,OsFBX285 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G191200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
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10 Sobic.005G052200 expressed protein -
11 Sobic.005G124400 - -
12 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
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16 Sobic.008G181200 - -
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18 Sobic.010G137600 - -
19 Sobic.004G114700 - -
20 Sobic.006G143300 nuclear transport factor 2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G019400 Sobic002G019400 Sobic007G191200 Sobic007G191200 Sobic002G019400--Sobic007G191200 Sobic005G186400 Sobic005G186400 Sobic002G019400--Sobic005G186400 Sobic001G067000 Sobic001G067000 Sobic002G019400--Sobic001G067000 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic002G019400--Sobic005G042400 Sobic002G101500 Sobic002G101500 Sobic002G019400--Sobic002G101500 Sobic005G175150 Sobic005G175150 Sobic002G019400--Sobic005G175150 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic002G019400--Sobic003G103100 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic002G019400--Sobic009G062300 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic002G019400--Sobic010G029800 Sobic007G191200--Sobic005G042400 Sobic007G191200--Sobic010G029800 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic007G191200--Sobic005G124400 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic007G191200--Sobic004G008700 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic007G191200--Sobic010G137600 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic007G191200--Sobic005G052200 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic007G191200--Sobic008G069000 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic007G191200--Sobic004G114700 Sobic007G191200--Sobic003G103100 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic005G186400--Sobic002G238900 Sobic005G186400--Sobic007G191200 Sobic005G186400--Sobic008G069000 Sobic004G010000 Sobic004G010000 Sobic005G186400--Sobic004G010000 Sobic004G167900 Sobic004G167900 Sobic005G186400--Sobic004G167900 Sobic005G186400--Sobic002G019400 Sobic006G143300 Sobic006G143300 Sobic005G186400--Sobic006G143300 Sobic005G186400--Sobic010G029800 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic005G186400--Sobic008G181200 Sobic003G026900 Sobic003G026900 Sobic001G067000--Sobic003G026900 Sobic001G067000--Sobic006G143300 Sobic002G420800 Sobic002G420800 Sobic001G067000--Sobic002G420800 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic001G067000--Sobic002G230400 Sobic007G076500 Sobic007G076500 Sobic001G067000--Sobic007G076500 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic001G067000--Sobic002G147466 Sobic004G196800 Sobic004G196800 Sobic001G067000--Sobic004G196800 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic001G067000--Sobic007G199500 Sobic010G193700 Sobic010G193700 Sobic001G067000--Sobic010G193700 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic005G042400--Sobic005G226800 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic002G101500--Sobic005G227151 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic002G101500--Sobic002G105900 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic002G101500--Sobic003G319050 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic002G101500--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic002G101500--Sobic008G184500 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G101500--Sobic006G142850 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic002G101500--Sobic008G184000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic002G101500--Sobic004G207500 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic002G101500--Sobic003G099900 Sobic004G090100 Sobic004G090100 Sobic005G175150--Sobic004G090100 Sobic005G138100 Sobic005G138100 Sobic005G175150--Sobic005G138100 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic005G175150--Sobic006G034900 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic005G175150--Sobic005G148201 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic005G175150--Sobic008G068900 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic005G175150--Sobic004G132200 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic005G175150--Sobic005G150000 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic005G175150--Sobic005G146000 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic005G175150--Sobic008G068850 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic009G062300--Sobic005G226800 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic009G062300--Sobic003G211600 Sobic009G062300--Sobic005G124400 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic009G062300--Sobic007G066200 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic009G062300--Sobic001G269650 Sobic009G062300--Sobic005G042400 Sobic009G062300--Sobic003G103100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic009G062300--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic009G062300--Sobic010G133150 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic010G029800--Sobic004G114700
Octagon: transcription factors


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