Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G054200.1
Synonym Sb02g004530
Functional annotation Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
UniProt C5XB23
Pfam PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF744
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G62910 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35436.1 : Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G236000 CGMC_MAPKCMGC_2.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
2 Sobic.010G134650 - -
3 Sobic.004G234700 expressed protein -
4 Sobic.005G110559 - -
5 Sobic.001G405100 BTBT1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with tetratricopeptide repeats, expressed -
6 Sobic.009G096433 - -
7 Sobic.005G209600 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
8 Sobic.009G095640 - -
9 Sobic.010G257700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
10 Sobic.007G142600 DUF593 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G054501 - -
12 Sobic.007G133100 - -
13 Sobic.001G121800 - -
14 Sobic.005G016200 expressed protein -
15 Sobic.008G181900 OsFBLD9 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
17 Sobic.005G185750 - -
18 Sobic.006G062000 - -
19 Sobic.005G068500 expressed protein -
20 Sobic.005G185100 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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