Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G405100.1
Synonym ETO1, ATEOL1, Sb01g038320
Functional annotation BTBT1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with tetratricopeptide repeats, expressed
UniProt C5WNH6
Pfam PF13181 PF07719 PF13414
Panther DB PTHR23083 PTHR23083:SF420
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51770 : tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g18360.1 : BTBT1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with tetratricopeptide repeats, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052645 , Zm00025a002017
Brachypodium KQK22120 , KQK22121
Barley HORVU4Hr1G055900.8 , HORVU4Hr1G055900.5 , HORVU4Hr1G055900.4 , HORVU4Hr1G055900.7 , HORVU4Hr1G055900.6 , HORVU4Hr1G055900.3
Wheat TraesCS4A02G111500 , TraesCS4B02G192300 , TraesCS4D02G193600 , TraesCS4D02G193600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G405100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G024100 MRH1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic003G156900 Sobic003G156900 Sobic001G405100--Sobic003G156900 Sobic005G110559 Sobic005G110559 Sobic001G405100--Sobic005G110559 Sobic007G226700 Sobic007G226700 Sobic001G405100--Sobic007G226700 Sobic010G274100 Sobic010G274100 Sobic001G405100--Sobic010G274100 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic001G405100--Sobic002G323000 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic001G405100--Sobic008G075800 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G405100--Sobic007G061800 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic001G405100--Sobic001G364700 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G405100--Sobic010G118800 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic003G156900--Sobic003G175000 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic003G156900--Sobic007G091400 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic003G156900--Sobic002G254700 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic003G156900--Sobic001G232600 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic003G156900--Sobic009G102700 Sobic003G400000 Sobic003G400000 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Octagon: transcription factors


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