Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G016200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y3J7
Pfam PF06075
Panther DB PTHR31928 PTHR31928:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13370 : Plant protein of unknown function (DUF936)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g02710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188300 - -
2 Sobic.001G538425 - -
3 Sobic.007G204200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
4 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.007G198900 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.002G204500 Phospholipase D alpha 2 PLD Alpha 2 (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
7 Sobic.003G191200 expressed protein -
8 Sobic.007G031200 - -
9 Sobic.007G007700 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.004G057300 expressed protein -
12 Sobic.005G037700 OsFBX378 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G074100 - -
14 Sobic.007G197000 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, probable glucan endo-1,3-betaglucosidase A6"(PubMedID : 27755575)@glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G070400 expressed protein -
16 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
18 Sobic.002G279900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.004G171100 expressed protein -
20 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP


Gene co-expression network
sample Sobic005G016200 Sobic005G016200 Sobic002G188300 Sobic002G188300 Sobic005G016200--Sobic002G188300 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic005G016200--Sobic001G538425 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic005G016200--Sobic007G204200 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic005G016200--Sobic007G081100 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic005G016200--Sobic007G198900 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic005G016200--Sobic002G204500 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G016200--Sobic003G191200 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G016200--Sobic007G031200 Sobic007G007700 Sobic007G007700 Sobic005G016200--Sobic007G007700 Sobic002G188300--Sobic001G538425 Sobic002G188300--Sobic005G016200 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic002G188300--Sobic006G170500 Sobic002G188300--Sobic007G198900 Sobic008G155000 Sobic008G155000 Sobic002G188300--Sobic008G155000 Sobic004G057300 Sobic004G057300 Sobic002G188300--Sobic004G057300 Sobic002G188300--Sobic007G081100 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic002G188300--Sobic004G003300 Sobic002G188300--Sobic003G191200 Sobic001G538425--Sobic007G031200 Sobic001G538425--Sobic003G191200 Sobic001G538425--Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic007G082100 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G538425--Sobic005G058600 Sobic001G538425--Sobic002G204500 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic001G538425--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic001G538425--Sobic003G070400 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic007G204200--Sobic005G037700 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic007G204200--Sobic004G192600 Sobic008G074100 Sobic008G074100 Sobic007G204200--Sobic008G074100 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic007G204200--Sobic001G089400 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic007G204200--Sobic003G004000 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic007G204200--Sobic007G197000 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic007G204200--Sobic003G420500 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic007G204200--Sobic010G121700 Sobic007G204200--Sobic003G070400 Sobic007G081100--Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic007G082100 Sobic007G081100--Sobic003G191200 Sobic007G081100--Sobic003G070400 Sobic007G081100--Sobic007G031200 Sobic007G081100--Sobic004G100300 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic007G081100--Sobic009G060100 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic007G081100--Sobic002G182701 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic007G081100--Sobic001G211700 Sobic007G198900--Sobic003G191200 Sobic007G198900--Sobic007G082100 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic007G198900--Sobic005G058300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic007G198900--Sobic007G081800 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic007G198900--Sobic007G110800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic007G198900--Sobic010G123800 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic007G198900--Sobic007G167950 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic007G198900--Sobic005G087732 Sobic007G198900--Sobic007G031200 Sobic002G204500--Sobic007G081100 Sobic002G204500--Sobic003G070400 Sobic002G204500--Sobic007G031200 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G204500--Sobic004G168200 Sobic002G204500--Sobic007G204200 Sobic002G204500--Sobic004G100300 Sobic002G204500--Sobic007G082100 Sobic002G204500--Sobic003G191200 Sobic005G049850 Sobic005G049850 Sobic002G204500--Sobic005G049850 Sobic003G191200--Sobic007G082100 Sobic003G191200--Sobic007G031200 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic010G123800 Sobic003G191200--Sobic007G081800 Sobic003G191200--Sobic005G058300 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic003G191200--Sobic006G017900 Sobic003G191200--Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic003G191200 Sobic007G031200--Sobic004G100300 Sobic007G031200--Sobic002G182701 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic007G031200--Sobic005G000900 Sobic007G031200--Sobic007G082100 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic007G031200--Sobic009G182100 Sobic007G031200--Sobic006G017900 Sobic007G031200--Sobic001G211700 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic007G031200--Sobic006G017700 Sobic007G007700--Sobic003G420500 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic007G007700--Sobic002G279900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic007G007700--Sobic001G135950 Sobic007G007700--Sobic005G037700 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic007G007700--Sobic001G525600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic007G007700--Sobic010G001200 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic007G007700--Sobic002G125100 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic007G007700--Sobic004G099200 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic007G007700--Sobic005G145400
Octagon: transcription factors


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