Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G185100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTD3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g40740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G286000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G071400 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G084700 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.008G168932 - -
5 Sobic.005G185750 - -
6 Sobic.008G057800 methyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.008G181900 OsFBLD9 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
9 Sobic.005G068500 expressed protein -
10 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
11 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
12 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
13 Sobic.001G068000 - -
14 Sobic.010G274100 spotted leaf 11, putative, expressed -
15 Sobic.001G202900 expressed protein -
16 Sobic.002G323000 TBC domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G099000 protein of unknown function domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G539880 - -
19 Sobic.008G097800 CAMK_CAMK_like.47 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
20 Sobic.001G103500 gp176, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G185100 Sobic005G185100 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic005G185100--Sobic003G286000 Sobic008G071400 Sobic008G071400 Sobic005G185100--Sobic008G071400 Sobic002G084700 Sobic002G084700 Sobic005G185100--Sobic002G084700 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic005G185100--Sobic008G168932 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic005G185100--Sobic005G185750 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic005G185100--Sobic008G057800 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic005G185100--Sobic008G181900 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic005G185100--Sobic004G289900 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic005G185100--Sobic005G068500 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G286000--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G286000--Sobic001G539880 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic003G286000--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic003G286000--Sobic003G195400 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic003G286000--Sobic004G158100 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic003G286000--Sobic002G225800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic003G286000--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic008G011901 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic003G286000--Sobic001G364700 Sobic008G071400--Sobic002G084700 Sobic008G071400--Sobic008G057800 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic008G071400--Sobic009G167201 Sobic004G136100 Sobic004G136100 Sobic008G071400--Sobic004G136100 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic008G071400--Sobic004G080800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic008G071400--Sobic006G173400 Sobic004G093100 Sobic004G093100 Sobic008G071400--Sobic004G093100 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic008G071400--Sobic006G234400 Sobic008G071400--Sobic002G225800 Sobic002G084700--Sobic008G057800 Sobic002G084700--Sobic008G071400 Sobic004G080000 Sobic004G080000 Sobic002G084700--Sobic004G080000 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic002G084700--Sobic010G176400 Sobic003G329600 Sobic003G329600 Sobic002G084700--Sobic003G329600 Sobic009G145750 Sobic009G145750 Sobic002G084700--Sobic009G145750 Sobic002G084700--Sobic009G167201 Sobic010G089900 Sobic010G089900 Sobic002G084700--Sobic010G089900 Sobic001G068000 Sobic001G068000 Sobic002G084700--Sobic001G068000 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic008G168932--Sobic004G222400 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic008G057800--Sobic008G011901 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic008G057800--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic008G057800--Sobic002G145400 Sobic008G057800--Sobic004G024800 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic008G057800--Sobic005G035200 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic008G057800--Sobic007G221932 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic003G195400 Sobic008G057800--Sobic001G539880 Sobic008G181900--Sobic008G168932 Sobic008G181900--Sobic005G068500 Sobic008G181900--Sobic008G099000 Sobic008G181900--Sobic004G289900 Sobic010G141001 Sobic010G141001 Sobic008G181900--Sobic010G141001 Sobic008G181900--Sobic004G222400 Sobic008G181900--Sobic003G329600 Sobic003G255400 Sobic003G255400 Sobic008G181900--Sobic003G255400 Sobic008G181900--Sobic010G176400 Sobic004G289900--Sobic008G168932 Sobic004G289900--Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic005G185750 Sobic004G289900--Sobic005G068500 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic008G099000 Sobic004G289900--Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic006G044800 Sobic004G289900--Sobic010G257800 Sobic005G068500--Sobic008G168932 Sobic005G068500--Sobic008G099000 Sobic001G539600 Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic004G222400 Sobic005G068500--Sobic010G141001 Sobic005G068500--Sobic003G255400 Sobic005G068500--Sobic003G329600 Sobic005G068500--Sobic010G176400 Sobic005G068500--Sobic004G289900
Octagon: transcription factors


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