Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G098400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W357
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3A02G481800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G142766 - -
2 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G085100 - -
4 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G210300 - -
8 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G219000 integral membrane protein TmpA, putative, expressed -
10 Sobic.001G271000 - -
11 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G221550 - -
13 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
14 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.004G166301 - -
16 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
17 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
18 Sobic.009G162401 - -
19 Sobic.004G036200 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.008G049000 diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G098400 Sobic002G098400 Sobic008G142766 Sobic008G142766 Sobic002G098400--Sobic008G142766 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic002G098400--Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic002G098400--Sobic005G085100 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic002G098400--Sobic001G181900 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic002G098400--Sobic007G104300 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic002G098400--Sobic005G148400 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic002G098400--Sobic005G210300 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic002G098400--Sobic005G170800 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G098400--Sobic003G219000 Sobic008G142766--Sobic002G098400 Sobic008G142766--Sobic007G104300 Sobic008G142766--Sobic003G219000 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic008G142766--Sobic008G117900 Sobic008G142766--Sobic005G148400 Sobic002G074300 Sobic002G074300 Sobic008G142766--Sobic002G074300 Sobic008G015300 Sobic008G015300 Sobic008G142766--Sobic008G015300 Sobic010G270900 Sobic010G270900 Sobic008G142766--Sobic010G270900 Sobic008G182500 Sobic008G182500 Sobic008G142766--Sobic008G182500 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic001G181900--Sobic005G043400 Sobic001G181900--Sobic002G060500 Sobic001G181900--Sobic007G104300 Sobic001G181900--Sobic005G148400 Sobic001G181900--Sobic005G085100 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic001G181900--Sobic008G045600 Sobic001G181900--Sobic001G271000 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic001G181900--Sobic008G049000 Sobic001G181900--Sobic009G101600 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic007G104300--Sobic004G166301 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic007G104300--Sobic008G167100 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic001G181900 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic007G104300--Sobic002G023400 Sobic007G104300--Sobic005G148400 Sobic007G104300--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic002G128400 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G210300--Sobic001G271000 Sobic005G210300--Sobic009G101600 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic005G210300--Sobic005G054300 Sobic005G210300--Sobic009G026400 Sobic005G210300--Sobic005G142200 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic005G210300--Sobic005G054600 Sobic005G210300--Sobic002G060500 Sobic005G210300--Sobic005G085100 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic005G210300--Sobic004G092300 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic003G219000--Sobic008G049000 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic003G219000--Sobic001G182300 Sobic003G219000--Sobic008G013900 Sobic003G219000--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic003G219000--Sobic002G094500 Sobic003G219000--Sobic002G060500 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic003G219000--Sobic007G066050 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic003G219000--Sobic007G129401 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic003G219000--Sobic006G132200
Octagon: transcription factors


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