Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G145600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QBC9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g23620.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G086670.1 , HORVU5Hr1G042640.1 , HORVU3Hr1G055100.1 , HORVU0Hr1G033640.1 , HORVU3Hr1G004810.4 , HORVU0Hr1G037110.1
Wheat TraesCS4A02G069500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G313750 - -
2 Sobic.010G132100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@thioredoxin domain-containing protein 17, putative, expressed -
3 Sobic.010G124133 - -
4 Sobic.001G377400 expressed protein -
5 Sobic.004G259800 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed K00621: GNPNAT1, glucosamine-phosphate N-acetyltransferase
6 Sobic.003G034350 - -
7 Sobic.004G248000 expressed protein -
8 Sobic.010G252800 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.007G177901 - -
10 Sobic.009G134700 - -
11 Sobic.005G168900 expressed protein -
12 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
13 Sobic.002G062400 - -
14 Sobic.001G050650 - -
15 Sobic.010G207175 - -
16 Sobic.007G045750 - -
17 Sobic.003G134100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@eukaryotic translation initiation factor 6, putative, expressed K03264: translation initiation factor 6
18 Sobic.004G176550 - -
19 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
20 Sobic.006G159350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G145600 Sobic002G145600 Sobic004G313750 Sobic004G313750 Sobic002G145600--Sobic004G313750 Sobic010G132100 Sobic010G132100 Sobic002G145600--Sobic010G132100 Sobic010G124133 Sobic010G124133 Sobic002G145600--Sobic010G124133 Sobic001G377400 Sobic001G377400 Sobic002G145600--Sobic001G377400 Sobic004G259800 Sobic004G259800 Sobic002G145600--Sobic004G259800 Sobic003G034350 Sobic003G034350 Sobic002G145600--Sobic003G034350 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic002G145600--Sobic004G248000 Sobic010G252800 Sobic010G252800 Sobic002G145600--Sobic010G252800 Sobic007G177901 Sobic007G177901 Sobic002G145600--Sobic007G177901 Sobic004G313750--Sobic003G034350 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic004G313750--Sobic004G176550 Sobic004G313750--Sobic002G145600 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic004G313750--Sobic009G134700 Sobic004G313750--Sobic004G248000 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic004G313750--Sobic005G041150 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic004G313750--Sobic006G159500 Sobic004G313750--Sobic010G124133 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic004G313750--Sobic006G099400 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic010G132100--Sobic009G027200 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic010G132100--Sobic002G112200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic010G132100--Sobic004G223700 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G132100--Sobic001G050650 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic010G132100--Sobic007G098050 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic010G132100--Sobic001G449300 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic010G132100--Sobic010G098800 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic010G132100--Sobic004G206000 SobicK031400 SobicK031400 Sobic010G132100--SobicK031400 Sobic010G124133--Sobic002G112200 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G124133--Sobic010G124100 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G124133--Sobic007G045750 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic010G124133--Sobic002G062400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic010G124133--Sobic001G401750 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic010G124133--Sobic007G167600 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic010G124133--Sobic005G119400 Sobic010G124133--Sobic001G050650 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic010G124133--Sobic009G095720 Sobic001G377400--Sobic004G248000 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic001G377400--Sobic002G319900 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G377400--Sobic003G267150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic001G377400--Sobic004G313000 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G377400--Sobic002G160500 Sobic004G259800--Sobic002G145600 Sobic004G259800--Sobic010G132100 Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic004G259800--Sobic008G174850 Sobic004G259800--Sobic001G449300 Sobic002G248800 Sobic002G248800 Sobic004G259800--Sobic002G248800 Sobic009G134766 Sobic009G134766 Sobic004G259800--Sobic009G134766 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic004G259800--Sobic009G255400 Sobic002G075300 Sobic002G075300 Sobic004G259800--Sobic002G075300 Sobic004G259800--Sobic007G177901 Sobic003G034350--Sobic004G176550 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic003G034350--Sobic010G241400 Sobic003G034350--Sobic004G313750 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic003G034350--Sobic005G168900 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic003G034350--Sobic001G217850 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic003G034350--Sobic006G192900 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic003G034350--Sobic006G009200 Sobic003G034350--Sobic002G062400 Sobic003G034350--Sobic007G045750 Sobic004G248000--Sobic002G160500 Sobic004G248000--Sobic004G313000 Sobic004G248000--Sobic003G267150 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic004G248000--Sobic004G262550 Sobic004G248000--Sobic002G319900 Sobic003G380100 Sobic003G380100 Sobic010G252800--Sobic003G380100 Sobic010G252800--Sobic002G145600 Sobic010G252800--Sobic005G168900 Sobic009G025800 Sobic009G025800 Sobic010G252800--Sobic009G025800 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic010G252800--Sobic006G174050 Sobic010G252800--Sobic009G134700 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic010G252800--Sobic002G421100 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic010G252800--Sobic009G074000 Sobic010G252800--Sobic004G313750 Sobic008G134401 Sobic008G134401 Sobic007G177901--Sobic008G134401 Sobic007G177901--Sobic004G248000 Sobic007G177901--Sobic002G145600 Sobic007G177901--Sobic004G259800 Sobic007G177901--Sobic004G313750 Sobic007G177901--Sobic006G159500 Sobic001G237250 Sobic001G237250 Sobic007G177901--Sobic001G237250 Sobic005G044101 Sobic005G044101 Sobic007G177901--Sobic005G044101 Sobic007G177901--Sobic009G134700
Octagon: transcription factors


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