Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G281200.1
Synonym Sb02g031410
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5X6X3
Pfam -
Panther DB PTHR35167 PTHR35167:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049304 , Zm00025a014469
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G281200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G041301 - -
2 Sobic.009G029900 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
3 Sobic.004G187200 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G234000 expressed protein -
5 Sobic.001G530400 expressed protein -
6 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
7 Sobic.005G191350 - K13963: serpin B
8 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G176500 - -
10 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
11 Sobic.004G105300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.002G211501 - -
13 Sobic.002G291132 - -
14 Sobic.004G068000 expressed protein -
15 Sobic.006G011800 - -
16 Sobic.006G279000 expressed protein -
17 Sobic.004G055901 - -
18 Sobic.008G140500 expressed protein -
19 Sobic.007G060550 - -
20 Sobic.006G036201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G281200 Sobic002G281200 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic002G281200--Sobic009G041301 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic002G281200--Sobic009G029900 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic002G281200--Sobic004G187200 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic002G281200--Sobic001G234000 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic002G281200--Sobic001G530400 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G281200--Sobic007G064400 Sobic005G191350 Sobic005G191350 Sobic002G281200--Sobic005G191350 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic002G281200--Sobic004G090300 Sobic007G176500 Sobic007G176500 Sobic002G281200--Sobic007G176500 Sobic004G068000 Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic001G234000 Sobic009G041301--Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic009G029900 Sobic004G105300 Sobic004G105300 Sobic009G041301--Sobic004G105300 Sobic003G302466 Sobic003G302466 Sobic009G041301--Sobic003G302466 Sobic010G198700 Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic004G187200 Sobic009G041301--Sobic004G090300 Sobic009G029900--Sobic004G187200 Sobic009G029900--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic001G234000 Sobic009G029900--Sobic004G090300 Sobic006G011800 Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G011800 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic007G064400 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic009G041301 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G530400 Sobic002G211501 Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic002G211501 Sobic001G234000--Sobic004G090300 Sobic001G234000--Sobic007G064400 Sobic001G234000--Sobic006G279000 Sobic001G234000--Sobic004G187200 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic002G291132 Sobic001G234000--Sobic001G530400 Sobic001G234000--Sobic002G147500 Sobic010G274300 Sobic010G274300 Sobic001G234000--Sobic010G274300 Sobic001G530400--Sobic002G291132 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic001G530400--Sobic006G036201 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic009G061800 Sobic001G530400--Sobic002G211501 Sobic001G530400--Sobic004G090300 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic001G530400--Sobic005G074900 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic009G086800 Sobic001G530400--Sobic001G234000 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic001G530400--Sobic009G051301 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic002G147500 Sobic005G191350--Sobic001G234000 Sobic005G191350--Sobic007G064400 Sobic005G191350--Sobic009G029900 Sobic005G191350--Sobic007G156400 Sobic005G191350--Sobic009G041301 Sobic005G191350--Sobic004G187200 Sobic005G191350--Sobic004G105300 Sobic005G191350--Sobic006G011800 Sobic005G191350--Sobic001G530400 Sobic004G090300--Sobic006G279000 Sobic004G090300--Sobic001G234000 Sobic004G090300--Sobic002G147500 Sobic004G090300--Sobic002G291132 Sobic004G090300--Sobic001G530400 Sobic004G090300--Sobic004G187200 Sobic004G090300--Sobic002G211501 Sobic004G090300--Sobic001G330600 Sobic004G090300--Sobic006G036201 Sobic002G029200 Sobic002G029200 Sobic007G176500--Sobic002G029200 Sobic007G172800 Sobic007G172800 Sobic007G176500--Sobic007G172800 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic007G176500--Sobic001G166500 Sobic007G176500--Sobic004G105300 Sobic007G176500--Sobic010G274300 Sobic007G176500--Sobic004G068000 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic007G176500--Sobic006G059900 Sobic010G216800 Sobic010G216800 Sobic007G176500--Sobic010G216800 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic007G176500--Sobic001G203100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.