Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G014500.1,Sobic.003G014500.2
Synonym CKR1, EIN2, ORE2, ORE3, PIR2, ATEIN2, ERA3, Sb03g001440
Functional annotation "MHZ7(Ortholog in rice:Ma et al., 2013)" (PubMedID : 31659865)
ethylene-insensitive protein, putative, expressed
UniProt C5XKD6 , A0A1W0VVF7
Pfam PF01566
Panther DB PTHR11706 PTHR11706:SF49
NCBI CDD KOG1291; Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
KEGG Orthology K14513; ethylene-insensitive protein 2
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03280 : NRAMP metal ion transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g06130.1,LOC_Os07g06130.2 : ethylene-insensitive protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022879
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G158500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G334700 OsWAK28 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
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5 Sobic.001G002000 protein kinase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G112300 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative, expressed K11835: USP4_11, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4/11
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9 Sobic.008G132600 expressed protein -
10 Sobic.002G397500 SAC3/GANP family protein, expressed -
11 Sobic.009G094300 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
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14 Sobic.001G261492 - -
15 Sobic.003G408600 GYF domain containing protein, putative, expressed K18730: PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein
16 Sobic.010G010700 PHD-finger family protein, expressed -
17 Sobic.001G196500 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G133300 ZOS9-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
19 Sobic.004G158400 AML1, putative, expressed -
20 Sobic.004G276400 expressed protein K11320: E1A-binding protein p400


Gene co-expression network
sample Sobic003G014500 Sobic003G014500 Sobic001G334700 Sobic001G334700 Sobic003G014500--Sobic001G334700 Sobic004G135400 Sobic004G135400 Sobic003G014500--Sobic004G135400 Sobic009G047200 Sobic009G047200 Sobic003G014500--Sobic009G047200 Sobic003G072200 Sobic003G072200 Sobic003G014500--Sobic003G072200 Sobic001G002000 Sobic001G002000 Sobic003G014500--Sobic001G002000 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G014500--Sobic005G112300 Sobic001G534800 Sobic001G534800 Sobic003G014500--Sobic001G534800 Sobic003G164200 Sobic003G164200 Sobic003G014500--Sobic003G164200 Sobic008G132600 Sobic008G132600 Sobic003G014500--Sobic008G132600 Sobic004G260100 Sobic004G260100 Sobic001G334700--Sobic004G260100 Sobic002G397500 Sobic002G397500 Sobic001G334700--Sobic002G397500 Sobic001G334700--Sobic003G014500 Sobic001G280900 Sobic001G280900 Sobic001G334700--Sobic001G280900 Sobic002G362800 Sobic002G362800 Sobic001G334700--Sobic002G362800 Sobic001G334700--Sobic003G164200 Sobic008G150700 Sobic008G150700 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Octagon: transcription factors


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