Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G015500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0U6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191500 ATBPM2, putative, expressed -
2 Sobic.004G352400 expressed protein -
3 Sobic.003G064500 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.4 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
4 Sobic.001G299400 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G289300 expressed protein -
6 Sobic.002G391000 - -
7 Sobic.002G048501 - -
8 Sobic.002G395200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
9 Sobic.003G279400 chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G161100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.009G202600 glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
12 Sobic.005G096866 - -
13 Sobic.005G094001 - -
14 Sobic.008G183150 - -
15 Sobic.006G103500 - -
16 Sobic.006G187401 - -
17 Sobic.001G520100 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
18 Sobic.003G214800 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.003G064600 - -
20 Sobic.005G203900 OsGrx_C17 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3


Gene co-expression network
sample Sobic003G015500 Sobic003G015500 Sobic005G191500 Sobic005G191500 Sobic003G015500--Sobic005G191500 Sobic004G352400 Sobic004G352400 Sobic003G015500--Sobic004G352400 Sobic003G064500 Sobic003G064500 Sobic003G015500--Sobic003G064500 Sobic001G299400 Sobic001G299400 Sobic003G015500--Sobic001G299400 Sobic004G289300 Sobic004G289300 Sobic003G015500--Sobic004G289300 Sobic002G391000 Sobic002G391000 Sobic003G015500--Sobic002G391000 Sobic002G048501 Sobic002G048501 Sobic003G015500--Sobic002G048501 Sobic002G395200 Sobic002G395200 Sobic003G015500--Sobic002G395200 Sobic003G279400 Sobic003G279400 Sobic003G015500--Sobic003G279400 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic005G191500--Sobic003G106500 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic005G191500--Sobic008G073400 Sobic001G520100 Sobic001G520100 Sobic005G191500--Sobic001G520100 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic005G191500--Sobic001G019300 Sobic001G161100 Sobic001G161100 Sobic005G191500--Sobic001G161100 Sobic007G178500 Sobic007G178500 Sobic005G191500--Sobic007G178500 Sobic005G191500--Sobic003G015500 Sobic010G179500 Sobic010G179500 Sobic005G191500--Sobic010G179500 Sobic001G260850 Sobic001G260850 Sobic005G191500--Sobic001G260850 Sobic004G352400--Sobic002G048501 Sobic004G352400--Sobic003G279400 Sobic004G352400--Sobic003G015500 Sobic006G103500 Sobic006G103500 Sobic004G352400--Sobic006G103500 Sobic009G165200 Sobic009G165200 Sobic004G352400--Sobic009G165200 Sobic004G352400--Sobic005G191500 Sobic003G369000 Sobic003G369000 Sobic004G352400--Sobic003G369000 Sobic002G352100 Sobic002G352100 Sobic004G352400--Sobic002G352100 Sobic004G071750 Sobic004G071750 Sobic004G352400--Sobic004G071750 Sobic003G064600 Sobic003G064600 Sobic003G064500--Sobic003G064600 Sobic003G310800 Sobic003G310800 Sobic003G064500--Sobic003G310800 Sobic005G094001 Sobic005G094001 Sobic003G064500--Sobic005G094001 Sobic003G064500--Sobic005G191500 Sobic003G064500--Sobic003G015500 Sobic001G048000 Sobic001G048000 Sobic003G064500--Sobic001G048000 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic003G064500--Sobic002G281000 Sobic002G366100 Sobic002G366100 Sobic003G064500--Sobic002G366100 Sobic001G044200 Sobic001G044200 Sobic003G064500--Sobic001G044200 Sobic004G303500 Sobic004G303500 Sobic001G299400--Sobic004G303500 Sobic004G023600 Sobic004G023600 Sobic001G299400--Sobic004G023600 Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic001G299400--Sobic004G109100 Sobic001G074800 Sobic001G074800 Sobic001G299400--Sobic001G074800 Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic001G299400--Sobic005G060400 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic001G299400--Sobic009G082800 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic001G299400--Sobic004G138400 Sobic003G401500 Sobic003G401500 Sobic001G299400--Sobic003G401500 Sobic004G126100 Sobic004G126100 Sobic001G299400--Sobic004G126100 Sobic003G214800 Sobic003G214800 Sobic004G289300--Sobic003G214800 Sobic010G162500 Sobic010G162500 Sobic004G289300--Sobic010G162500 Sobic006G122500 Sobic006G122500 Sobic004G289300--Sobic006G122500 Sobic004G289300--Sobic005G191500 Sobic004G289300--Sobic003G310800 Sobic010G006300 Sobic010G006300 Sobic004G289300--Sobic010G006300 Sobic010G161201 Sobic010G161201 Sobic004G289300--Sobic010G161201 Sobic010G279100 Sobic010G279100 Sobic004G289300--Sobic010G279100 Sobic001G252401 Sobic001G252401 Sobic004G289300--Sobic001G252401 Sobic006G125301 Sobic006G125301 Sobic002G391000--Sobic006G125301 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G391000--Sobic001G055300 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic002G391000--Sobic005G226700 Sobic003G217566 Sobic003G217566 Sobic002G391000--Sobic003G217566 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic002G391000--Sobic001G177700 Sobic002G391000--Sobic001G044200 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G391000--Sobic006G107332 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic002G391000--Sobic002G088500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic002G391000--Sobic007G129500 Sobic002G048501--Sobic004G071750 Sobic005G204000 Sobic005G204000 Sobic002G048501--Sobic005G204000 Sobic001G160700 Sobic001G160700 Sobic002G048501--Sobic001G160700 Sobic003G088800 Sobic003G088800 Sobic002G395200--Sobic003G088800 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic002G395200--Sobic005G097800 Sobic002G395200--Sobic001G019300 Sobic009G202600 Sobic009G202600 Sobic002G395200--Sobic009G202600 Sobic002G395200--Sobic002G281000 Sobic001G525900 Sobic001G525900 Sobic002G395200--Sobic001G525900 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic002G395200--Sobic002G337001 Sobic010G193000 Sobic010G193000 Sobic002G395200--Sobic010G193000 Sobic008G015100 Sobic008G015100 Sobic002G395200--Sobic008G015100 Sobic003G279400--Sobic002G048501 Sobic003G279400--Sobic001G160700
Octagon: transcription factors


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