Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G022400.1
Synonym Sb03g002100
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed
UniProt C5XL41
Pfam PF04765
Panther DB PTHR12956 PTHR12956:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46220 : Protein of unknown function (DUF616)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g11220.1 : hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022940
Brachypodium KQK03266
Barley -
Wheat TraesCS3B02G166800 , TraesCS3D02G149100 , TraesCS3A02G132800 , TraesCS3A02G132800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G022400 Sobic003G022400 Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic003G022400--Sobic008G076100 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic003G022400--Sobic007G112500 Sobic004G036400 Sobic004G036400 Sobic003G022400--Sobic004G036400 Sobic008G059700 Sobic008G059700 Sobic003G022400--Sobic008G059700 Sobic010G142401 Sobic010G142401 Sobic003G022400--Sobic010G142401 Sobic003G133000 Sobic003G133000 Sobic003G022400--Sobic003G133000 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic003G022400--Sobic005G043300 Sobic007G133800 Sobic007G133800 Sobic003G022400--Sobic007G133800 Sobic005G054401 Sobic005G054401 Sobic003G022400--Sobic005G054401 Sobic008G076100--Sobic004G036400 Sobic008G076100--Sobic008G059700 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic008G076100--Sobic001G188100 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic008G076100--Sobic008G053750 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic008G076100--Sobic005G204500 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G076100--Sobic008G043300 Sobic008G056700 Sobic008G056700 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Octagon: transcription factors


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