Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G065400.1
Synonym Sb03g005570
Functional annotation gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
UniProt C5XPA8
Pfam PF00135
Panther DB PTHR23024 PTHR23024:SF204
NCBI CDD KOG1515; Arylacetamide deacetylase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06570 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g06060.1 : gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023391 , Zm00025a023385 , Zm00025a035652
Brachypodium KQK06611
Barley HORVU5Hr1G103770.3 , HORVU5Hr1G103770.2 , HORVU5Hr1G103770.1
Wheat TraesCS3A02G307000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G134200 peroxiredoxin, putative, expressed -
2 Sobic.009G000900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
3 Sobic.009G146400 dnaJ domain containing protein, expressed K09519: DnaJ homolog subfamily B member 13
4 Sobic.002G093500 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
5 Sobic.010G109400 acylphosphatase, putative, expressed K01512: acylphosphatase
6 Sobic.001G467700 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
7 Sobic.004G007500 cytochrome P450, putative, expressed K10528: hydroperoxide lyase
8 Sobic.009G070800 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
9 Sobic.001G472000 Polyamine oxidase 1("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K13366: MPAO, polyamine oxidase
10 Sobic.001G357800 amino acid permease family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G281800 enzyme of the cupin superfamily protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G178500 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.004G351400 O-methyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.001G498300 galactose mutarotase-like, putative, expressed -
15 Sobic.001G065500 ZOS3-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
16 Sobic.010G265500 expressed protein -
17 Sobic.010G199000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G151600 fruit protein PKIWI502, putative, expressed -
19 Sobic.007G136600 SET domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G343100 YCF37, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G065400 Sobic003G065400 Sobic010G134200 Sobic010G134200 Sobic003G065400--Sobic010G134200 Sobic009G000900 Sobic009G000900 Sobic003G065400--Sobic009G000900 Sobic009G146400 Sobic009G146400 Sobic003G065400--Sobic009G146400 Sobic002G093500 Sobic002G093500 Sobic003G065400--Sobic002G093500 Sobic010G109400 Sobic010G109400 Sobic003G065400--Sobic010G109400 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic003G065400--Sobic001G467700 Sobic004G007500 Sobic004G007500 Sobic003G065400--Sobic004G007500 Sobic009G070800 Sobic009G070800 Sobic003G065400--Sobic009G070800 Sobic001G472000 Sobic001G472000 Sobic003G065400--Sobic001G472000 Sobic010G134200--Sobic010G109400 Sobic010G134200--Sobic002G093500 Sobic001G269000 Sobic001G269000 Sobic010G134200--Sobic001G269000 Sobic009G113400 Sobic009G113400 Sobic010G134200--Sobic009G113400 Sobic003G421000 Sobic003G421000 Sobic010G134200--Sobic003G421000 Sobic004G183100 Sobic004G183100 Sobic010G134200--Sobic004G183100 Sobic007G023300 Sobic007G023300 Sobic010G134200--Sobic007G023300 Sobic010G134200--Sobic003G065400 Sobic001G438100 Sobic001G438100 Sobic010G134200--Sobic001G438100 Sobic009G000900--Sobic004G007500 Sobic009G000900--Sobic009G070800 Sobic009G009500 Sobic009G009500 Sobic009G000900--Sobic009G009500 Sobic001G161300 Sobic001G161300 Sobic009G000900--Sobic001G161300 Sobic007G029000 Sobic007G029000 Sobic009G000900--Sobic007G029000 Sobic001G276100 Sobic001G276100 Sobic009G000900--Sobic001G276100 Sobic009G075100 Sobic009G075100 Sobic009G000900--Sobic009G075100 Sobic009G197300 Sobic009G197300 Sobic009G000900--Sobic009G197300 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic009G000900--Sobic004G343100 Sobic009G146400--Sobic001G472000 Sobic001G281800 Sobic001G281800 Sobic009G146400--Sobic001G281800 Sobic001G065500 Sobic001G065500 Sobic009G146400--Sobic001G065500 Sobic006G211701 Sobic006G211701 Sobic009G146400--Sobic006G211701 Sobic001G407900 Sobic001G407900 Sobic009G146400--Sobic001G407900 Sobic001G498300 Sobic001G498300 Sobic009G146400--Sobic001G498300 Sobic009G146400--Sobic009G000900 Sobic001G042301 Sobic001G042301 Sobic009G146400--Sobic001G042301 Sobic009G146400--Sobic004G007500 Sobic002G093500--Sobic010G134200 Sobic002G093500--Sobic001G467700 Sobic002G093500--Sobic001G269000 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic002G093500--Sobic008G073400 Sobic002G093500--Sobic001G407900 Sobic001G268850 Sobic001G268850 Sobic002G093500--Sobic001G268850 Sobic007G178500 Sobic007G178500 Sobic002G093500--Sobic007G178500 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic002G093500--Sobic003G106500 Sobic002G093500--Sobic007G023300 Sobic010G109400--Sobic010G134200 Sobic010G109400--Sobic009G113400 Sobic001G032200 Sobic001G032200 Sobic010G109400--Sobic001G032200 Sobic002G138300 Sobic002G138300 Sobic010G109400--Sobic002G138300 Sobic010G109400--Sobic003G421000 Sobic010G109400--Sobic001G269000 Sobic004G162500 Sobic004G162500 Sobic010G109400--Sobic004G162500 Sobic004G351400 Sobic004G351400 Sobic010G109400--Sobic004G351400 Sobic004G023700 Sobic004G023700 Sobic010G109400--Sobic004G023700 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic001G467700--Sobic009G070300 Sobic001G467700--Sobic002G093500 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic001G467700--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic001G467700--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic001G467700--Sobic009G214800 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G467700--Sobic010G143000 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic001G467700--Sobic005G089000 Sobic001G467700--Sobic008G073400 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic001G467700--Sobic001G198700 Sobic004G007500--Sobic009G000900 Sobic004G007500--Sobic007G029000 Sobic004G007500--Sobic001G161300 Sobic004G007500--Sobic009G075100 Sobic001G448800 Sobic001G448800 Sobic004G007500--Sobic001G448800 Sobic004G007500--Sobic009G070800 Sobic004G007500--Sobic001G276100 Sobic004G007500--Sobic001G281800 Sobic004G007500--Sobic003G106500 Sobic009G070800--Sobic009G009500 Sobic009G070800--Sobic009G000900 Sobic009G070800--Sobic007G029000 Sobic009G070800--Sobic004G007500 Sobic001G315200 Sobic001G315200 Sobic009G070800--Sobic001G315200 Sobic009G070800--Sobic009G197300 Sobic007G168000 Sobic007G168000 Sobic009G070800--Sobic007G168000 Sobic009G070800--Sobic009G075100 Sobic008G049200 Sobic008G049200 Sobic009G070800--Sobic008G049200 Sobic008G189500 Sobic008G189500 Sobic001G472000--Sobic008G189500 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic001G472000--Sobic003G007800 Sobic005G029400 Sobic005G029400 Sobic001G472000--Sobic005G029400 Sobic009G161100 Sobic009G161100 Sobic001G472000--Sobic009G161100 Sobic009G070600 Sobic009G070600 Sobic001G472000--Sobic009G070600 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic001G472000--Sobic001G255300 Sobic001G472000--Sobic001G315200 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic001G472000--Sobic001G541300 Sobic004G249400 Sobic004G249400 Sobic001G472000--Sobic004G249400
Octagon: transcription factors


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