Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G161200.3,Sobic.003G161200.2,Sobic.003G161200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3I5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G223350 - -
2 Sobic.002G142350 - -
3 Sobic.008G112400 - -
4 Sobic.008G086100 - -
5 Sobic.002G346250 - -
6 Sobic.001G311700 - -
7 Sobic.005G169800 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed K03665: GTPase
8 Sobic.005G083866 - -
9 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
10 Sobic.002G008701 - -
11 Sobic.005G139000 expressed protein -
12 Sobic.008G166250 - -
13 Sobic.007G203850 - -
14 Sobic.007G016300 - -
15 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
16 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
17 Sobic.009G144050 - -
18 Sobic.007G173901 - -
19 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
20 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G161200 Sobic003G161200 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic003G161200--Sobic004G223350 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic003G161200--Sobic002G142350 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic003G161200--Sobic008G112400 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic003G161200--Sobic008G086100 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic003G161200--Sobic002G346250 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic003G161200--Sobic001G311700 Sobic005G169800 Sobic005G169800 Sobic003G161200--Sobic005G169800 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G161200--Sobic005G083866 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic003G161200--Sobic008G175600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G223350--Sobic008G096300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G142350--Sobic007G081400 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic004G223350 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G142350--Sobic004G288900 Sobic002G142350--Sobic003G241600 Sobic002G142350--Sobic008G096300 Sobic002G142350--Sobic007G203850 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G142350--Sobic009G049100 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic002G142350--Sobic008G024700 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic001G311700--Sobic005G083866 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic007G203850 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic001G311700--Sobic006G045301 Sobic001G311700--Sobic007G081400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic001G311700--Sobic002G231400 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic001G311700--Sobic003G305250 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic001G311700--Sobic004G200000 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic001G311700--Sobic002G030001 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G169800--Sobic006G280900 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic005G169800--Sobic001G204200 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic005G169800--Sobic006G146400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic005G169800--Sobic006G222650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic005G169800--Sobic009G236000 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic005G169800--Sobic009G083100 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic005G169800--Sobic004G302400 Sobic005G169800--Sobic007G119300 Sobic005G169800--Sobic009G082500 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic008G175600--Sobic009G174600 Sobic008G175600--Sobic008G112400 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic008G175600--Sobic008G166250 Sobic008G175600--Sobic002G065300 Sobic008G175600--Sobic004G269500 Sobic008G175600--Sobic002G426650 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic008G175600--Sobic003G101600 Sobic008G175600--Sobic002G008701 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic008G175600--Sobic002G284300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.