Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G183000.1
Synonym Sb03g024260, AtbZIP44, bZIP44
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
bZIP transcription factor domain containing protein, expressed
UniProt C5XMW6
Pfam PF00170
Panther DB PTHR22952 PTHR22952:SF120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75390 : basic leucine-zipper 44
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g36220.1 : bZIP transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ86328
Barley HORVU3Hr1G047180.1 , HORVU2Hr1G021080.1 , HORVU5Hr1G054510.1 , HORVU5Hr1G054510.2 , HORVU5Hr1G054510.4 , HORVU5Hr1G054510.5 , HORVU5Hr1G054510.8
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.005G187800 - -
20 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein


Gene co-expression network
sample Sobic003G183000 Sobic003G183000 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic003G183000--Sobic004G091900 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic003G183000--Sobic003G050100 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic003G183000--Sobic003G330350 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G183000--Sobic001G270800 Sobic004G186800 Sobic004G186800 Sobic003G183000--Sobic004G186800 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic003G183000--Sobic010G193100 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic003G183000--Sobic008G007500 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic003G183000--Sobic002G087700 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic003G183000--Sobic003G375400 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G091900--Sobic003G064901 Sobic004G091900--Sobic008G007500 Sobic004G091900--Sobic003G330350 Sobic004G091900--Sobic001G270800 Sobic004G091900--Sobic002G087700 Sobic010G065001 Sobic010G065001 Sobic004G091900--Sobic010G065001 Sobic004G091900--Sobic010G193100 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic004G091900--Sobic001G098700 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic004G091900--Sobic001G011600 Sobic003G050100--Sobic003G330350 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G050100--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G050100--Sobic003G160433 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G050100--Sobic007G085900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G050100--Sobic006G057100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic003G050100--Sobic009G192200 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G050100--Sobic003G218950 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G050100--Sobic005G216900 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G050100--Sobic002G390200 Sobic003G330350--Sobic001G270800 Sobic003G330350--Sobic003G050100 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G330350--Sobic006G131700 Sobic003G330350--Sobic003G218950 Sobic003G330350--Sobic001G098700 Sobic003G330350--Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic006G057100 Sobic003G330350--Sobic009G192200 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G330350--Sobic001G167000 Sobic001G270800--Sobic003G330350 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic001G167000 Sobic001G270800--Sobic004G091900 Sobic001G270800--Sobic006G131700 Sobic001G270800--Sobic003G064901 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic001G270800--Sobic003G169000 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G270800--Sobic003G233266 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G270800--Sobic009G101500 Sobic004G186800--Sobic001G011600 Sobic004G186800--Sobic003G064901 Sobic004G186800--Sobic004G091900 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic004G186800--Sobic003G369566 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic004G186800--Sobic003G369533 Sobic004G186800--Sobic001G098700 Sobic004G186800--Sobic003G169000 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic004G186800--Sobic001G278650 Sobic004G186800--Sobic003G160433 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic010G193100--Sobic008G029000 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G193100--Sobic002G190600 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic010G193100--Sobic006G202900 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic008G007500 Sobic010G193100--Sobic004G091900 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G193100--Sobic003G192500 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G193100--Sobic005G065050 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic010G193100--Sobic005G119250 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic008G007500--Sobic005G187800 Sobic008G007500--Sobic008G029000 Sobic008G007500--Sobic004G091900 Sobic008G007500--Sobic006G202900 Sobic008G007500--Sobic002G190600 Sobic008G007500--Sobic010G018200 Sobic008G007500--Sobic010G193100 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic008G007500--Sobic003G003300 Sobic008G007500--Sobic002G087700 Sobic002G087700--Sobic003G192500 Sobic002G087700--Sobic004G091900 Sobic002G087700--Sobic002G190600 Sobic002G087700--Sobic003G064901 Sobic002G087700--Sobic008G007500 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic002G087700--Sobic008G040501 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic002G087700--Sobic009G102250 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G087700--Sobic002G380550 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic002G087700--Sobic004G032200 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic003G375400--Sobic009G236900 Sobic003G375400--Sobic003G050100 Sobic003G375400--Sobic003G330350 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic003G375400--Sobic004G193350 Sobic003G375400--Sobic001G270800 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic003G375400--Sobic004G322650 Sobic003G375400--Sobic003G160433 Sobic003G375400--Sobic006G131700 Sobic003G375400--Sobic003G160300
Octagon: transcription factors


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