Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G224400.1,Sobic.003G224400.2
Synonym Sb03g028270
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q4R6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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MaizeGDB (Corn) -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G240500 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
2 Sobic.003G222800 lipase, putative, expressed -
3 Sobic.009G077200 ribosomal protein L5, putative, expressed K02868: RP-L11e, large subunit ribosomal protein L11e
4 Sobic.006G127350 - -
5 Sobic.006G190300 ATP binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G165900 - -
7 Sobic.002G346300 - -
8 Sobic.001G166100 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G259200 POEI18 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G243500 polygalacturonase, putative, expressed -
11 Sobic.006G234200 expressed protein -
12 Sobic.002G352301 - -
13 Sobic.008G120132 - -
14 Sobic.004G260800 Fatty acid desaturase 2 (omega-6 fatty acid desaturase) FAD2 (Os)(PubMedID : 27208977)@Fatty acid desaturase 2 (omega-6 fatty acid desaturase) FAD2 (At)(PubMedID : 27208977)@fatty acid desaturase, putative, expressed K10256: omega-6 fatty acid desaturase / acyl-lipid omega-6 desaturase (Delta-12 desaturase)
15 Sobic.004G269100 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
16 Sobic.009G244200 ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed -
17 Sobic.001G170301 - -
18 Sobic.007G097100 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G311000 "Receptor-like kinase(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)"(PubMedID : 31659859)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G102350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G224400 Sobic003G224400 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic003G224400--Sobic002G240500 Sobic003G222800 Sobic003G222800 Sobic003G224400--Sobic003G222800 Sobic009G077200 Sobic009G077200 Sobic003G224400--Sobic009G077200 Sobic006G127350 Sobic006G127350 Sobic003G224400--Sobic006G127350 Sobic006G190300 Sobic006G190300 Sobic003G224400--Sobic006G190300 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic003G224400--Sobic010G165900 Sobic002G346300 Sobic002G346300 Sobic003G224400--Sobic002G346300 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic003G224400--Sobic001G166100 Sobic002G259200 Sobic002G259200 Sobic003G224400--Sobic002G259200 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic002G240500--Sobic004G291200 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic002G240500--Sobic009G031800 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic002G240500--Sobic007G192200 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic002G240500--Sobic006G226000 Sobic001G320000 Sobic001G320000 Sobic002G240500--Sobic001G320000 Sobic001G027500 Sobic001G027500 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Octagon: transcription factors


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