Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G234200.1
Synonym Sb06g030170
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y8X0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009605
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G099000 - -
2 Sobic.003G066600 expressed protein -
3 Sobic.001G170301 - -
4 Sobic.003G282500 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
5 Sobic.010G190800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF1680 domain containing protein, putative, expressed K09955: uncharacterized protein
6 Sobic.004G238801 - -
7 Sobic.003G443800 expressed protein -
8 Sobic.008G143300 - -
9 Sobic.007G082500 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.002G349200 expressed protein K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
11 Sobic.007G121650 - -
12 Sobic.001G405200 transcription factor like protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G129200 argonaute, putative, expressed -
14 Sobic.010G009100 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G321500 expressed protein -
16 Sobic.002G135400 Cupin domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G317000 growth regulating factor protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G031600 expressed protein -
19 Sobic.009G057800 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G196600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G234200 Sobic006G234200 Sobic004G099000 Sobic004G099000 Sobic006G234200--Sobic004G099000 Sobic003G066600 Sobic003G066600 Sobic006G234200--Sobic003G066600 Sobic001G170301 Sobic001G170301 Sobic006G234200--Sobic001G170301 Sobic003G282500 Sobic003G282500 Sobic006G234200--Sobic003G282500 Sobic010G190800 Sobic010G190800 Sobic006G234200--Sobic010G190800 Sobic004G238801 Sobic004G238801 Sobic006G234200--Sobic004G238801 Sobic003G443800 Sobic003G443800 Sobic006G234200--Sobic003G443800 Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic006G234200--Sobic008G143300 Sobic007G082500 Sobic007G082500 Sobic006G234200--Sobic007G082500 Sobic002G349200 Sobic002G349200 Sobic004G099000--Sobic002G349200 Sobic004G015050 Sobic004G015050 Sobic004G099000--Sobic004G015050 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G099000--Sobic010G121900 Sobic005G189600 Sobic005G189600 Sobic004G099000--Sobic005G189600 Sobic002G080500 Sobic002G080500 Sobic004G099000--Sobic002G080500 Sobic004G015150 Sobic004G015150 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Octagon: transcription factors


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