Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G127350.3,Sobic.006G127350.1,Sobic.006G127350.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REK4 , A0A1Z5RDP6
Pfam -
Panther DB PTHR13710 PTHR13710:SF76
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27880 : DEAD/DEAH box RNA helicase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40970.1 : DEAD-box ATP-dependent RNA helicase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056335
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G084110.10 , HORVU2Hr1G084110.11 , HORVU2Hr1G084110.12 , HORVU2Hr1G084110.13 , HORVU2Hr1G084110.14 , HORVU2Hr1G084110.15 , HORVU2Hr1G084110.16 , HORVU2Hr1G084110.17 , HORVU2Hr1G084110.8 , HORVU2Hr1G084110.9 , HORVU2Hr1G084110.2 , HORVU2Hr1G084110.3 , HORVU2Hr1G084110.1 , HORVU2Hr1G084110.6 , HORVU2Hr1G084110.7 , HORVU2Hr1G084110.4 , HORVU2Hr1G084110.5 , HORVU2Hr1G084110.21 , HORVU2Hr1G084110.20 , HORVU2Hr1G084110.23 , HORVU2Hr1G084110.22
Wheat TraesCS2A02G345300 , TraesCS2B02G363700 , TraesCS2D02G344000 , TraesCS2D02G344000
Populus -


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G171900 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase precursor (Os)(PubMedID : 27208977)@glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
2 Sobic.008G105850 - -
3 Sobic.010G093500 CSLA3 - cellulose synthase-like family A@ mannan synthase, expressed K13680: beta-mannan synthase
4 Sobic.010G094301 - -
5 Sobic.010G109500 expressed protein -
6 Sobic.006G234100 shikimate/quinate 5-dehydrogenase, putative, expressed K02492: glutamyl-tRNA reductase
7 Sobic.002G000500 isoflavone reductase, putative, expressed -
8 Sobic.005G123200 cbbY, putative, expressed -
9 Sobic.006G222700 OsCHL Chloroplastic lipocalin, expressed -
10 Sobic.004G249800 expressed protein -
11 Sobic.001G448400 UbiE/COQ5 methyltransferase family protein (Sb)(PubMedID : 27208977)@methyltransferase domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G011100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.004G343300 -(PubMedID : 26465154)@unknown(PubMedID : 29017446)@expressed protein -
14 Sobic.004G023200 Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein(PubMedID : 26465154)@membrane related protein CP5, putative, expressed -
15 Sobic.002G098800 peroxiredoxin, putative, expressed -
16 Sobic.006G200800 phosphoribulokinase/Uridine kinase family protein, expressed K00855: PRK, phosphoribulokinase
17 Sobic.006G103400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.004G026700 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
19 Sobic.001G361700 expressed protein -
20 Sobic.006G054300 amidohydrolase family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G127350 Sobic006G127350 Sobic001G171900 Sobic001G171900 Sobic006G127350--Sobic001G171900 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic006G127350--Sobic008G105850 Sobic010G093500 Sobic010G093500 Sobic006G127350--Sobic010G093500 Sobic010G094301 Sobic010G094301 Sobic006G127350--Sobic010G094301 Sobic010G109500 Sobic010G109500 Sobic006G127350--Sobic010G109500 Sobic006G234100 Sobic006G234100 Sobic006G127350--Sobic006G234100 Sobic002G000500 Sobic002G000500 Sobic006G127350--Sobic002G000500 Sobic005G123200 Sobic005G123200 Sobic006G127350--Sobic005G123200 Sobic006G222700 Sobic006G222700 Sobic006G127350--Sobic006G222700 Sobic001G171900--Sobic006G127350 Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic001G171900--Sobic009G089101 Sobic002G098800 Sobic002G098800 Sobic001G171900--Sobic002G098800 Sobic001G171900--Sobic010G093500 Sobic004G026700 Sobic004G026700 Sobic001G171900--Sobic004G026700 Sobic006G200800 Sobic006G200800 Sobic001G171900--Sobic006G200800 Sobic004G307400 Sobic004G307400 Sobic001G171900--Sobic004G307400 Sobic004G274100 Sobic004G274100 Sobic001G171900--Sobic004G274100 Sobic005G149400 Sobic005G149400 Sobic001G171900--Sobic005G149400 Sobic008G105850--Sobic006G127350 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic008G105850--Sobic008G105300 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic008G105850--Sobic001G361700 Sobic003G404900 Sobic003G404900 Sobic008G105850--Sobic003G404900 Sobic008G105850--Sobic010G093500 Sobic003G069100 Sobic003G069100 Sobic008G105850--Sobic003G069100 Sobic007G171600 Sobic007G171600 Sobic008G105850--Sobic007G171600 Sobic006G011100 Sobic006G011100 Sobic008G105850--Sobic006G011100 Sobic008G105850--Sobic002G000500 Sobic010G093500--Sobic006G127350 Sobic010G030800 Sobic010G030800 Sobic010G093500--Sobic010G030800 Sobic004G095000 Sobic004G095000 Sobic010G093500--Sobic004G095000 Sobic010G093500--Sobic003G069100 Sobic008G067200 Sobic008G067200 Sobic010G093500--Sobic008G067200 Sobic001G300800 Sobic001G300800 Sobic010G093500--Sobic001G300800 Sobic005G202600 Sobic005G202600 Sobic010G093500--Sobic005G202600 Sobic010G093500--Sobic008G105850 Sobic003G131000 Sobic003G131000 Sobic010G093500--Sobic003G131000 Sobic003G057900 Sobic003G057900 Sobic010G094301--Sobic003G057900 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic010G094301--Sobic001G353800 Sobic001G192100 Sobic001G192100 Sobic010G094301--Sobic001G192100 Sobic009G132900 Sobic009G132900 Sobic010G094301--Sobic009G132900 Sobic010G094301--Sobic006G234100 Sobic010G094301--Sobic010G109500 Sobic002G339200 Sobic002G339200 Sobic010G094301--Sobic002G339200 Sobic001G448400 Sobic001G448400 Sobic010G094301--Sobic001G448400 Sobic006G264201 Sobic006G264201 Sobic010G094301--Sobic006G264201 Sobic010G109500--Sobic006G234100 Sobic010G109500--Sobic001G448400 Sobic010G109500--Sobic006G011100 Sobic003G209800 Sobic003G209800 Sobic010G109500--Sobic003G209800 Sobic010G276400 Sobic010G276400 Sobic010G109500--Sobic010G276400 Sobic010G109500--Sobic002G339200 Sobic010G109500--Sobic002G000500 Sobic003G052500 Sobic003G052500 Sobic010G109500--Sobic003G052500 Sobic004G343300 Sobic004G343300 Sobic010G109500--Sobic004G343300 Sobic006G234100--Sobic010G109500 Sobic006G234100--Sobic001G448400 Sobic006G234100--Sobic002G339200 Sobic006G234100--Sobic004G343300 Sobic010G241000 Sobic010G241000 Sobic006G234100--Sobic010G241000 Sobic006G234100--Sobic003G052500 Sobic002G329600 Sobic002G329600 Sobic006G234100--Sobic002G329600 Sobic001G078000 Sobic001G078000 Sobic006G234100--Sobic001G078000 Sobic006G234100--Sobic006G264201 Sobic002G040100 Sobic002G040100 Sobic002G000500--Sobic002G040100 Sobic002G000500--Sobic006G011100 Sobic002G000500--Sobic010G109500 Sobic002G000500--Sobic010G276400 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic002G000500--Sobic003G199800 Sobic008G038300 Sobic008G038300 Sobic002G000500--Sobic008G038300 Sobic002G000500--Sobic007G171600 Sobic002G000500--Sobic003G209800 Sobic001G274600 Sobic001G274600 Sobic002G000500--Sobic001G274600 Sobic001G527000 Sobic001G527000 Sobic005G123200--Sobic001G527000 Sobic004G239100 Sobic004G239100 Sobic005G123200--Sobic004G239100 Sobic009G030900 Sobic009G030900 Sobic005G123200--Sobic009G030900 Sobic009G183700 Sobic009G183700 Sobic005G123200--Sobic009G183700 Sobic010G277600 Sobic010G277600 Sobic005G123200--Sobic010G277600 Sobic005G194100 Sobic005G194100 Sobic005G123200--Sobic005G194100 Sobic009G043000 Sobic009G043000 Sobic005G123200--Sobic009G043000 Sobic008G102000 Sobic008G102000 Sobic005G123200--Sobic008G102000 Sobic002G152700 Sobic002G152700 Sobic005G123200--Sobic002G152700 Sobic002G030200 Sobic002G030200 Sobic006G222700--Sobic002G030200 Sobic003G197400 Sobic003G197400 Sobic006G222700--Sobic003G197400 Sobic006G222700--Sobic010G241000 Sobic001G041800 Sobic001G041800 Sobic006G222700--Sobic001G041800 Sobic010G000500 Sobic010G000500 Sobic006G222700--Sobic010G000500 Sobic007G029300 Sobic007G029300 Sobic006G222700--Sobic007G029300 Sobic006G222700--Sobic004G343300 Sobic005G042000 Sobic005G042000 Sobic006G222700--Sobic005G042000 Sobic006G222700--Sobic002G329600
Octagon: transcription factors


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