Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G054300.1
Synonym Sb06g014260
Functional annotation amidohydrolase family protein, expressed
UniProt C5YEV2
Pfam PF04909
Panther DB PTHR21240 PTHR21240:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35450 : catalytics;hydrolases
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32150.1 : amidohydrolase family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055910
Brachypodium KQJ82310
Barley HORVU3Hr1G094270.7 , HORVU3Hr1G094270.6 , HORVU3Hr1G094270.5 , HORVU3Hr1G094270.4 , HORVU3Hr1G094270.3 , HORVU3Hr1G094270.2 , HORVU3Hr1G094270.1 , HORVU3Hr1G094270.9 , HORVU3Hr1G094270.8 , HORVU3Hr1G094270.14 , HORVU3Hr1G094270.12 , HORVU3Hr1G094270.11 , HORVU3Hr1G094270.10
Wheat TraesCS3B02G465000 , TraesCS3B02G464900 , TraesCS3A02G427900 , TraesCS3D02G423400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G054300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G152800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G054300 Sobic006G054300 Sobic005G116100 Sobic005G116100 Sobic006G054300--Sobic005G116100 Sobic008G078400 Sobic008G078400 Sobic006G054300--Sobic008G078400 Sobic009G030900 Sobic009G030900 Sobic006G054300--Sobic009G030900 Sobic004G343900 Sobic004G343900 Sobic006G054300--Sobic004G343900 Sobic007G143700 Sobic007G143700 Sobic006G054300--Sobic007G143700 Sobic002G274200 Sobic002G274200 Sobic006G054300--Sobic002G274200 Sobic001G104800 Sobic001G104800 Sobic006G054300--Sobic001G104800 Sobic005G123200 Sobic005G123200 Sobic006G054300--Sobic005G123200 Sobic003G157400 Sobic003G157400 Sobic006G054300--Sobic003G157400 Sobic005G116100--Sobic006G054300 Sobic005G116100--Sobic009G030900 Sobic005G116100--Sobic005G123200 Sobic005G116100--Sobic002G274200 Sobic002G152700 Sobic002G152700 Sobic005G116100--Sobic002G152700 Sobic009G125400 Sobic009G125400 Sobic005G116100--Sobic009G125400 Sobic002G299900 Sobic002G299900 Sobic005G116100--Sobic002G299900 Sobic008G021300 Sobic008G021300 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Octagon: transcription factors


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