Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G229150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYJ7
Pfam -
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF126
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g36414.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ82916
Barley HORVU1Hr1G013480.5 , HORVU1Hr1G013480.4 , HORVU1Hr1G013480.3 , HORVU1Hr1G013480.2 , HORVU1Hr1G013480.1
Wheat TraesCS1A02G064900 , TraesCS1A02G064900 , TraesCS1D02G065700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G139900 expressed protein -
2 Sobic.001G493800 expressed protein -
3 Sobic.004G330400 expressed protein -
4 Sobic.005G102100 chalcone synthase, putative, expressed -
5 Sobic.006G162700 - -
6 Sobic.006G136600 expressed protein K14775: UTP30, ribosome biogenesis protein UTP30
7 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G028500 expressed protein -
9 Sobic.003G396900 expressed protein -
10 Sobic.002G206200 monogalactosyldiacylglycerol synthase, putative, expressed K03715: 1,2-diacylglycerol 3-beta-galactosyltransferase
11 Sobic.002G156300 - -
12 Sobic.002G092700 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G407000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ proteins of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G105300 - -
15 Sobic.006G197000 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
17 Sobic.K044200 - -
18 Sobic.009G202900 Positive cytokinine regulator(PubMedID : 30367619)@histidine-containing phosphotransfer protein, putative, expressed K14490: histidine-containing phosphotransfer peotein
19 Sobic.008G133100 OsWAK13 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.010G179150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G229150 Sobic003G229150 Sobic008G139900 Sobic008G139900 Sobic003G229150--Sobic008G139900 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic003G229150--Sobic001G493800 Sobic004G330400 Sobic004G330400 Sobic003G229150--Sobic004G330400 Sobic005G102100 Sobic005G102100 Sobic003G229150--Sobic005G102100 Sobic006G162700 Sobic006G162700 Sobic003G229150--Sobic006G162700 Sobic006G136600 Sobic006G136600 Sobic003G229150--Sobic006G136600 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic003G229150--Sobic003G099500 Sobic008G028500 Sobic008G028500 Sobic003G229150--Sobic008G028500 Sobic003G396900 Sobic003G396900 Sobic003G229150--Sobic003G396900 Sobic008G139900--Sobic004G330400 Sobic008G139900--Sobic001G493800 SobicK044200 SobicK044200 Sobic008G139900--SobicK044200 Sobic008G139900--Sobic008G028500 Sobic008G139900--Sobic003G229150 Sobic008G139900--Sobic005G102100 Sobic002G206200 Sobic002G206200 Sobic008G139900--Sobic002G206200 Sobic006G204000 Sobic006G204000 Sobic008G139900--Sobic006G204000 Sobic008G139900--Sobic003G396900 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G493800--Sobic010G179150 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic001G493800--Sobic002G156300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic001G493800--Sobic007G001300 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G493800--Sobic001G537900 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G493800--Sobic004G197300 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G493800--Sobic008G020300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic001G493800--Sobic003G109400 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic004G330400 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic004G330400--Sobic002G284800 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G330400--Sobic001G255700 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic004G330400--Sobic003G105300 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic004G330400--Sobic003G368150 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic004G330400--Sobic008G133100 Sobic002G425900 Sobic002G425900 Sobic004G330400--Sobic002G425900 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic004G330400--Sobic010G224800 Sobic004G330400--Sobic003G109400 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic004G330400--Sobic009G163500 Sobic005G102100--Sobic008G133100 Sobic005G102100--Sobic004G330400 Sobic005G102100--Sobic002G284800 Sobic005G102100--Sobic002G425900 Sobic005G102100--Sobic001G255700 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic005G102100--Sobic001G200500 Sobic005G102100--Sobic010G224800 Sobic005G102100--Sobic003G368150 Sobic005G102100--Sobic007G001300 Sobic006G162700--Sobic004G330400 Sobic010G114500 Sobic010G114500 Sobic006G162700--Sobic010G114500 Sobic006G162700--Sobic008G028500 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic006G162700--Sobic009G031100 Sobic006G162700--Sobic010G224800 Sobic006G162700--Sobic003G105300 Sobic006G162700--Sobic007G001300 Sobic006G162700--Sobic002G284800 Sobic006G162700--Sobic003G109400 Sobic002G092700 Sobic002G092700 Sobic006G136600--Sobic002G092700 Sobic006G136600--Sobic005G102100 Sobic006G136600--Sobic003G229150 Sobic004G128600 Sobic004G128600 Sobic006G136600--Sobic004G128600 Sobic006G197000 Sobic006G197000 Sobic006G136600--Sobic006G197000 Sobic006G136600--Sobic008G133100 Sobic006G136600--Sobic008G028500 Sobic003G350100 Sobic003G350100 Sobic006G136600--Sobic003G350100 Sobic001G193400 Sobic001G193400 Sobic006G136600--Sobic001G193400 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic003G099500--Sobic004G239000 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic003G099500--Sobic002G387100 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic003G099500--Sobic002G430200 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic003G099500--Sobic001G016900 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic003G099500--Sobic007G122300 Sobic003G099500--Sobic002G284800 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic003G099500--Sobic008G131800 Sobic003G099500--Sobic003G368150 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic003G099500--Sobic007G111600 Sobic008G028500--Sobic002G425900 Sobic008G028500--SobicK044200 Sobic008G028500--Sobic010G224800 Sobic008G028500--Sobic004G330400 Sobic008G028500--Sobic009G031100 Sobic008G028500--Sobic002G284800 Sobic008G028500--Sobic003G109400 Sobic008G028500--Sobic003G368150 Sobic008G028500--Sobic001G255700 Sobic003G201400 Sobic003G201400 Sobic003G396900--Sobic003G201400 Sobic003G396900--Sobic002G206200 Sobic003G396900--Sobic002G156300 Sobic003G396900--Sobic009G031100 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic003G396900--Sobic001G145300 Sobic003G396900--Sobic004G330400 Sobic003G396900--Sobic010G114400 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic003G396900--Sobic003G081400 Sobic003G396900--Sobic003G109400
Octagon: transcription factors


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