Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G139900.1,Sobic.008G139900.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PDL7 , A0A1B6PDK7
Pfam PF06549
Panther DB PTHR31425
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08050 : Protein of unknown function (DUF1118)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38640.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004298
Brachypodium KQJ86184 , KQK08468
Barley -
Wheat TraesCS5A02G081900 , TraesCS5D02G090700 , TraesCS5B02G083300 , TraesCS5B02G084500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G330400 expressed protein -
2 Sobic.001G493800 expressed protein -
3 Sobic.K044200 - -
4 Sobic.008G028500 expressed protein -
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6 Sobic.005G102100 chalcone synthase, putative, expressed -
7 Sobic.002G206200 monogalactosyldiacylglycerol synthase, putative, expressed K03715: 1,2-diacylglycerol 3-beta-galactosyltransferase
8 Sobic.006G204000 "Ascorbate peroxidase,heme binding / peroxidase (Os)"(PubMedID : 27208977)@Ascorbate peroxidasel heme binding / peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@peroxidase precursor, putative, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
9 Sobic.003G396900 expressed protein -
10 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G186600 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
12 Sobic.002G425900 expressed protein -
13 Sobic.001G115800 expressed protein -
14 Sobic.002G284800 expressed protein -
15 Sobic.010G179150 - -
16 Sobic.004G239000 - -
17 Sobic.009G154000 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
18 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
19 Sobic.001G255700 - -
20 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G139900 Sobic008G139900 Sobic004G330400 Sobic004G330400 Sobic008G139900--Sobic004G330400 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic008G139900--Sobic001G493800 SobicK044200 SobicK044200 Sobic008G139900--SobicK044200 Sobic008G028500 Sobic008G028500 Sobic008G139900--Sobic008G028500 Sobic003G229150 Sobic003G229150 Sobic008G139900--Sobic003G229150 Sobic005G102100 Sobic005G102100 Sobic008G139900--Sobic005G102100 Sobic002G206200 Sobic002G206200 Sobic008G139900--Sobic002G206200 Sobic006G204000 Sobic006G204000 Sobic008G139900--Sobic006G204000 Sobic003G396900 Sobic003G396900 Sobic008G139900--Sobic003G396900 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic004G330400--Sobic002G284800 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G330400--Sobic001G255700 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic004G330400--Sobic003G105300 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic004G330400--Sobic003G368150 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic004G330400--Sobic008G133100 Sobic002G425900 Sobic002G425900 Sobic004G330400--Sobic002G425900 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic004G330400--Sobic010G224800 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic004G330400--Sobic003G109400 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic004G330400--Sobic009G163500 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G493800--Sobic010G179150 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic001G493800--Sobic002G156300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic001G493800--Sobic007G001300 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G493800--Sobic001G537900 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G493800--Sobic004G197300 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G493800--Sobic008G020300 Sobic001G493800--Sobic003G109400 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic004G330400 SobicK044200--Sobic002G425900 Sobic009G154000 Sobic009G154000 SobicK044200--Sobic009G154000 SobicK044200--Sobic004G330400 SobicK044200--Sobic003G109400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 SobicK044200--Sobic004G354800 SobicK044200--Sobic001G255700 SobicK044200--Sobic009G163500 SobicK044200--Sobic002G284800 SobicK044200--Sobic010G224800 Sobic008G028500--Sobic002G425900 Sobic008G028500--SobicK044200 Sobic008G028500--Sobic010G224800 Sobic008G028500--Sobic004G330400 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic008G028500--Sobic009G031100 Sobic008G028500--Sobic002G284800 Sobic008G028500--Sobic003G109400 Sobic008G028500--Sobic003G368150 Sobic008G028500--Sobic001G255700 Sobic003G229150--Sobic008G139900 Sobic003G229150--Sobic001G493800 Sobic003G229150--Sobic004G330400 Sobic003G229150--Sobic005G102100 Sobic006G162700 Sobic006G162700 Sobic003G229150--Sobic006G162700 Sobic006G136600 Sobic006G136600 Sobic003G229150--Sobic006G136600 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic003G229150--Sobic003G099500 Sobic003G229150--Sobic008G028500 Sobic003G229150--Sobic003G396900 Sobic005G102100--Sobic008G133100 Sobic005G102100--Sobic004G330400 Sobic005G102100--Sobic002G284800 Sobic005G102100--Sobic002G425900 Sobic005G102100--Sobic001G255700 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic005G102100--Sobic001G200500 Sobic005G102100--Sobic010G224800 Sobic005G102100--Sobic003G368150 Sobic005G102100--Sobic007G001300 Sobic002G206200--Sobic003G109400 Sobic002G206200--Sobic002G156300 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic002G206200--Sobic006G172651 Sobic002G206200--Sobic010G224800 Sobic002G206200--Sobic009G031100 Sobic002G206200--Sobic009G163500 Sobic002G206200--Sobic007G001300 Sobic002G206200--Sobic010G114400 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic002G206200--Sobic001G261440 Sobic003G309600 Sobic003G309600 Sobic006G204000--Sobic003G309600 Sobic001G115800 Sobic001G115800 Sobic006G204000--Sobic001G115800 Sobic010G258700 Sobic010G258700 Sobic006G204000--Sobic010G258700 Sobic006G204000--Sobic008G139900 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic006G204000--Sobic003G120400 Sobic006G204000--Sobic003G099500 Sobic002G284901 Sobic002G284901 Sobic006G204000--Sobic002G284901 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic006G204000--Sobic001G460800 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic006G204000--Sobic002G320900 Sobic003G201400 Sobic003G201400 Sobic003G396900--Sobic003G201400 Sobic003G396900--Sobic002G206200 Sobic003G396900--Sobic002G156300 Sobic003G396900--Sobic009G031100 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic003G396900--Sobic001G145300 Sobic003G396900--Sobic004G330400 Sobic003G396900--Sobic010G114400 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic003G396900--Sobic003G081400 Sobic003G396900--Sobic003G109400
Octagon: transcription factors


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