Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G259000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5E5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.003G259000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
2 Sobic.003G005332 - -
3 Sobic.003G279600 - -
4 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
5 Sobic.003G178400 - -
6 Sobic.001G027400 - -
7 Sobic.007G200300 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G242032 - -
9 Sobic.010G097800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.007G157200 - -
11 Sobic.002G234900 zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed -
12 Sobic.010G055600 ThiF family domain containing protein, putative, expressed K11996: MOCS3, adenylyltransferase and sulfurtransferase
13 Sobic.010G150600 - -
14 Sobic.001G483200 ataxin-2 C-terminal region family protein, expressed -
15 Sobic.005G145700 - -
16 Sobic.002G314950 - -
17 Sobic.004G228000 DUF1771 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G111400 nodulation receptor kinase precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
19 Sobic.009G182000 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G004500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G259000--Sobic001G309000 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic003G259000--Sobic003G005332 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic003G259000--Sobic003G279600 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic003G259000--Sobic008G007100 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic003G259000--Sobic003G178400 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic003G259000--Sobic001G027400 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic003G259000--Sobic007G200300 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic003G259000--Sobic009G242032 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G259000--Sobic010G097800 Sobic001G309000--Sobic003G279600 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic001G309000--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic001G309000--Sobic008G096150 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic001G309000--Sobic001G212701 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic001G309000--Sobic007G174100 Sobic001G309000--Sobic003G178400 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic001G309000--Sobic010G132300 Sobic010G055600 Sobic010G055600 Sobic001G309000--Sobic010G055600 Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic001G309000--Sobic006G110600 Sobic003G005332--Sobic008G007100 Sobic003G005332--Sobic003G259000 Sobic003G005332--Sobic001G027400 Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic003G005332--Sobic005G126401 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G005332--Sobic006G111400 Sobic003G005332--Sobic010G097800 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic003G005332--Sobic008G007200 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic003G005332--Sobic003G304900 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic003G005332--Sobic004G306700 Sobic003G279600--Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic004G160950 Sobic003G279600--Sobic001G309000 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic010G132300 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic003G279600--Sobic007G157200 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic003G279600--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic001G212701 Sobic008G007100--Sobic008G007200 Sobic008G007100--Sobic006G111400 Sobic008G007100--Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic001G027400 Sobic008G007100--Sobic003G304900 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic008G007100--Sobic009G199900 Sobic008G007100--Sobic003G259000 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic008G007100--Sobic003G251900 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic008G007100--Sobic006G169600 Sobic003G178400--Sobic003G279600 Sobic003G178400--Sobic004G160950 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic002G188100 Sobic003G178400--Sobic004G069600 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic003G178400--Sobic002G234900 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic001G309000 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic003G178400--Sobic006G133650 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic007G200300--Sobic004G149000 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic007G200300--Sobic002G280001 Sobic006G270300 Sobic006G270300 Sobic007G200300--Sobic006G270300 Sobic002G227100 Sobic002G227100 Sobic007G200300--Sobic002G227100 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic007G200300--Sobic002G320700 Sobic004G081000 Sobic004G081000 Sobic007G200300--Sobic004G081000 Sobic007G200300--Sobic009G199900 Sobic007G200300--Sobic006G111400 Sobic004G203600 Sobic004G203600 Sobic007G200300--Sobic004G203600 Sobic009G053201 Sobic009G053201 Sobic009G242032--Sobic009G053201 Sobic009G242032--Sobic001G027400 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic009G242032--Sobic002G202200 Sobic009G242032--Sobic003G119266 Sobic009G242032--Sobic007G157200 Sobic009G242032--Sobic002G234900 Sobic009G242032--Sobic010G097800 Sobic009G242032--Sobic003G279600 Sobic009G242032--Sobic002G284701 Sobic010G097800--Sobic007G157200 Sobic010G097800--Sobic001G212701 Sobic010G097800--Sobic001G027400 Sobic010G097800--Sobic003G279600 Sobic002G161200 Sobic002G161200 Sobic010G097800--Sobic002G161200 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic010G097800--Sobic002G138200 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic010G097800--Sobic010G009532 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G097800--Sobic007G090406 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic010G097800--Sobic001G176800
Octagon: transcription factors


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