Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G339300.1
Synonym Sb03g038340
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XNB6
Pfam PF04859
Panther DB PTHR31161 PTHR31161:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G45260 : Plant protein of unknown function (DUF641)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g60850.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027041
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G081270.2 , HORVU3Hr1G081270.5 , HORVU3Hr1G081270.4 , HORVU3Hr1G081270.6
Wheat TraesCS3B02G377400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G322650 - -
2 Sobic.003G160433 - -
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4 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G157050 - -
6 Sobic.003G160300 - -
7 Sobic.001G054050 - -
8 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
9 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.001G029500 GDP-mannose transporter, putative, expressed K15356: VRG4, GDP-mannose transporter
11 Sobic.001G128000 expressed protein -
12 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
14 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -
15 Sobic.001G278650 - -
16 Sobic.007G085900 - -
17 Sobic.005G199151 - -
18 Sobic.003G160400 zinc knuckle family protein, expressed -
19 Sobic.004G282933 - -
20 Sobic.010G002301 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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