Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G077200.2
Synonym Sb04g006375
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RLU8
Pfam -
Panther DB PTHR34996 PTHR34996:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g10030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019662 , Zm00025a034680
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G350800 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.008G005700 - -
3 Sobic.004G325832 - -
4 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
5 Sobic.010G113800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G044466 - -
7 Sobic.002G152000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G038700 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
9 Sobic.003G418800 - -
10 Sobic.002G035100 - -
11 Sobic.004G345200 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.005G116601 - -
13 Sobic.010G196200 OsSub51 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
14 Sobic.003G075901 - -
15 Sobic.010G191200 - -
16 Sobic.009G145800 expressed protein -
17 Sobic.010G068001 - K08679: UDP-glucuronate 4-epimerase
18 Sobic.010G233600 - -
19 Sobic.002G188200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G250340 - K07976: Rab family, other


Gene co-expression network
sample Sobic004G077200 Sobic004G077200 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic004G077200--Sobic002G350800 Sobic008G005700 Sobic008G005700 Sobic004G077200--Sobic008G005700 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic004G077200--Sobic004G325832 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic004G077200--Sobic010G118600 Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic004G077200--Sobic010G113800 Sobic006G044466 Sobic006G044466 Sobic004G077200--Sobic006G044466 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic004G077200--Sobic002G152000 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic004G077200--Sobic005G038700 Sobic003G418800 Sobic003G418800 Sobic004G077200--Sobic003G418800 Sobic002G350800--Sobic010G118600 Sobic002G350800--Sobic002G152000 Sobic002G350800--Sobic004G325832 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic002G350800--Sobic003G250340 Sobic002G350800--Sobic004G077200 Sobic002G350800--Sobic003G418800 Sobic002G350800--Sobic005G038700 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic002G350800--Sobic010G196200 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic002G350800--Sobic002G104500 Sobic008G005700--Sobic006G044466 Sobic008G005700--Sobic004G325832 Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic008G005700--Sobic002G188200 Sobic008G005700--Sobic010G196200 Sobic008G005700--Sobic004G077200 Sobic008G005700--Sobic002G152000 Sobic008G005700--Sobic002G350800 Sobic001G003300 Sobic001G003300 Sobic008G005700--Sobic001G003300 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic008G005700--Sobic008G175933 Sobic004G325832--Sobic006G044466 Sobic004G325832--Sobic002G152000 Sobic004G325832--Sobic010G196200 Sobic004G325832--Sobic002G188200 Sobic004G325832--Sobic008G005700 Sobic004G325832--Sobic008G175933 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic004G325832--Sobic008G045300 Sobic004G325832--Sobic002G350800 Sobic004G325832--Sobic001G003300 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic010G118600--Sobic005G116601 Sobic010G118600--Sobic003G250340 Sobic010G118600--Sobic010G196200 Sobic010G118600--Sobic002G350800 Sobic010G118600--Sobic005G038700 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic010G118600--Sobic002G035100 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic010G118600--Sobic001G087500 Sobic010G068001 Sobic010G068001 Sobic010G118600--Sobic010G068001 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic010G118600--Sobic003G130650 Sobic003G075901 Sobic003G075901 Sobic010G113800--Sobic003G075901 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic010G113800--Sobic009G061700 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic010G113800--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic010G113800--Sobic004G108900 Sobic010G191200 Sobic010G191200 Sobic010G113800--Sobic010G191200 Sobic009G145800 Sobic009G145800 Sobic010G113800--Sobic009G145800 Sobic010G113800--Sobic004G077200 Sobic004G221150 Sobic004G221150 Sobic010G113800--Sobic004G221150 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic010G113800--Sobic002G121701 Sobic006G044466--Sobic002G188200 Sobic006G044466--Sobic004G325832 Sobic006G044466--Sobic010G196200 Sobic006G044466--Sobic001G003300 Sobic006G044466--Sobic008G175933 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic006G044466--Sobic004G328800 Sobic006G044466--Sobic008G005700 Sobic006G044466--Sobic002G152000 Sobic006G044466--Sobic008G045300 Sobic002G152000--Sobic004G325832 Sobic002G152000--Sobic008G045300 Sobic002G152000--Sobic010G196200 Sobic002G152000--Sobic002G188200 Sobic002G152000--Sobic003G130650 Sobic002G152000--Sobic006G044466 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic002G152000--Sobic003G333150 Sobic002G152000--Sobic003G250340 Sobic002G152000--Sobic008G175933 Sobic005G038700--Sobic003G250340 Sobic005G038700--Sobic010G196200 Sobic005G038700--Sobic010G118600 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic005G038700--Sobic009G187900 Sobic005G038700--Sobic008G045300 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic005G038700--Sobic007G165100 Sobic005G038700--Sobic003G130650 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic005G038700--Sobic009G203600 Sobic005G038700--Sobic001G087500 Sobic003G418800--Sobic002G104500 Sobic003G418800--Sobic002G350800 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic003G418800--Sobic003G259000 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G418800--Sobic006G111400 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic003G418800--Sobic001G140101 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic003G418800--Sobic003G005332 Sobic003G418800--Sobic001G087500 Sobic004G345200 Sobic004G345200 Sobic003G418800--Sobic004G345200 Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic003G418800--Sobic008G151900
Octagon: transcription factors


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