Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G418800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q843
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G104500 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.002G350800 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G259000 - -
4 Sobic.006G111400 nodulation receptor kinase precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
5 Sobic.001G140101 - -
6 Sobic.003G005332 - -
7 Sobic.001G087500 - -
8 Sobic.004G345200 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
9 Sobic.008G151900 expressed protein -
10 Sobic.004G077200 expressed protein -
11 Sobic.004G228000 DUF1771 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
13 Sobic.010G113800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
15 Sobic.003G371900 ubiquitin fusion degradation protein, putative, expressed K14016: ubiquitin fusion degradation protein 1
16 Sobic.002G187350 - -
17 Sobic.001G027400 - -
18 Sobic.003G234300 - -
19 Sobic.007G175600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR36 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
20 Sobic.008G005700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G418800 Sobic003G418800 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic003G418800--Sobic002G104500 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic003G418800--Sobic002G350800 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic003G418800--Sobic003G259000 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G418800--Sobic006G111400 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic003G418800--Sobic001G140101 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic003G418800--Sobic003G005332 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic003G418800--Sobic001G087500 Sobic004G345200 Sobic004G345200 Sobic003G418800--Sobic004G345200 Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic003G418800--Sobic008G151900 Sobic002G104500--Sobic003G418800 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic002G104500--Sobic003G159400 Sobic002G104500--Sobic002G350800 Sobic002G104500--Sobic001G140101 Sobic005G232100 Sobic005G232100 Sobic002G104500--Sobic005G232100 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic002G104500--Sobic010G278400 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic002G104500--Sobic009G149600 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic002G104500--Sobic001G033800 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic002G104500--Sobic004G295900 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic002G350800--Sobic010G118600 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic002G350800--Sobic002G152000 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic002G350800--Sobic004G325832 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic002G350800--Sobic003G250340 Sobic004G077200 Sobic004G077200 Sobic002G350800--Sobic004G077200 Sobic002G350800--Sobic003G418800 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic002G350800--Sobic005G038700 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic002G350800--Sobic010G196200 Sobic002G350800--Sobic002G104500 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G259000--Sobic001G309000 Sobic003G259000--Sobic003G005332 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic003G259000--Sobic003G279600 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic003G259000--Sobic008G007100 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic003G259000--Sobic003G178400 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic003G259000--Sobic001G027400 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic003G259000--Sobic007G200300 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic003G259000--Sobic009G242032 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G259000--Sobic010G097800 Sobic006G111400--Sobic008G007100 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic006G111400--Sobic002G234800 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic006G111400--Sobic006G169600 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic009G199900 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic006G111400--Sobic003G251900 Sobic006G111400--Sobic007G200300 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic006G111400--Sobic003G234300 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic006G111400--Sobic004G350600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G111400--Sobic004G149000 Sobic001G140101--Sobic004G350600 Sobic005G063600 Sobic005G063600 Sobic001G140101--Sobic005G063600 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic001G140101--Sobic002G399000 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic001G140101--Sobic009G223900 Sobic001G140101--Sobic008G151900 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic001G140101--Sobic003G155800 Sobic001G140101--Sobic009G149600 Sobic001G140101--Sobic006G169600 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic001G140101--Sobic001G028500 Sobic003G005332--Sobic008G007100 Sobic003G005332--Sobic003G259000 Sobic003G005332--Sobic001G027400 Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic003G005332--Sobic005G126401 Sobic003G005332--Sobic006G111400 Sobic003G005332--Sobic010G097800 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic003G005332--Sobic008G007200 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic003G005332--Sobic003G304900 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic003G005332--Sobic004G306700 Sobic001G087500--Sobic010G278400 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic001G087500--Sobic004G205400 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic001G087500--Sobic009G187900 Sobic001G087500--Sobic010G118600 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic001G087500--Sobic005G116601 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic001G087500--Sobic007G114650 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G087500--Sobic010G060701 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic001G087500--Sobic009G181900 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic001G087500--Sobic010G118401 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic004G345200--Sobic002G035100 Sobic004G345200--Sobic010G118600 Sobic010G068001 Sobic010G068001 Sobic004G345200--Sobic010G068001 Sobic004G345200--Sobic008G151900 Sobic004G345200--Sobic010G118401 Sobic003G418900 Sobic003G418900 Sobic004G345200--Sobic003G418900 Sobic004G345200--Sobic005G116601 Sobic007G175600 Sobic007G175600 Sobic004G345200--Sobic007G175600 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic004G345200--Sobic004G228000 Sobic009G122201 Sobic009G122201 Sobic008G151900--Sobic009G122201 Sobic008G151900--Sobic002G035100 Sobic008G151900--Sobic004G228000 Sobic008G151900--Sobic001G140101 Sobic008G151900--Sobic001G027400 Sobic004G267950 Sobic004G267950 Sobic008G151900--Sobic004G267950 Sobic008G151900--Sobic010G118401 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic008G151900--Sobic004G202750 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic008G151900--Sobic002G387000
Octagon: transcription factors


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