Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G113800.3,Sobic.010G113800.2
Synonym Sb10g009860
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YIH9
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF103 PTHR14155:SF103 PTHR14155
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding GO:0005515protein binding GO:0008270zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42360 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g16060.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042680
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic003G075901 Sobic003G075901 Sobic010G113800--Sobic003G075901 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic010G113800--Sobic009G061700 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic010G113800--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic010G113800--Sobic004G108900 Sobic010G191200 Sobic010G191200 Sobic010G113800--Sobic010G191200 Sobic009G145800 Sobic009G145800 Sobic010G113800--Sobic009G145800 Sobic004G077200 Sobic004G077200 Sobic010G113800--Sobic004G077200 Sobic004G221150 Sobic004G221150 Sobic010G113800--Sobic004G221150 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic010G113800--Sobic002G121701 Sobic003G075901--Sobic009G061700 Sobic003G075901--Sobic008G134000 Sobic003G075901--Sobic004G108900 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic003G075901--Sobic009G223700 Sobic003G075901--Sobic010G113800 Sobic003G075901--Sobic002G121701 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic003G075901--Sobic001G457100 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic003G075901--Sobic001G483700 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic003G075901--Sobic003G290700 Sobic009G061700--Sobic003G075901 Sobic009G061700--Sobic009G223700 Sobic009G061700--Sobic004G108900 Sobic009G061700--Sobic001G483700 Sobic009G061700--Sobic002G121701 Sobic009G061700--Sobic008G134000 Sobic009G061700--Sobic003G290700 Sobic009G061700--Sobic001G457100 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G061700--Sobic004G226300 Sobic008G134000--Sobic004G108900 Sobic008G134000--Sobic003G075901 Sobic008G134000--Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic002G121701 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic009G223700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic008G134000--Sobic006G169300 Sobic008G134000--Sobic001G457100 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic008G134000--Sobic001G399501 Sobic004G108900--Sobic006G169300 Sobic004G108900--Sobic009G223700 Sobic004G108900--Sobic008G134000 Sobic004G108900--Sobic009G061700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic004G108900--Sobic002G285525 Sobic004G128800 Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic001G457100 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic002G121701 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic010G191200--Sobic003G178400 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic010G191200--Sobic002G234900 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic010G191200--Sobic003G279600 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic010G191200--Sobic002G396900 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic010G191200--Sobic002G188100 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic010G191200--Sobic010G040000 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic010G191200--Sobic004G160950 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic010G191200--Sobic006G133650 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic010G191200--Sobic002G231800 Sobic009G145800--Sobic009G061700 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic009G145800--Sobic008G098098 Sobic009G145800--Sobic008G134000 Sobic009G145800--Sobic004G108900 Sobic009G145800--Sobic003G075901 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic009G145800--Sobic001G000900 Sobic009G145800--Sobic010G113800 Sobic009G145800--Sobic002G121701 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic009G145800--Sobic006G273500 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic004G077200--Sobic002G350800 Sobic008G005700 Sobic008G005700 Sobic004G077200--Sobic008G005700 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic004G077200--Sobic004G325832 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic004G077200--Sobic010G118600 Sobic004G077200--Sobic010G113800 Sobic006G044466 Sobic006G044466 Sobic004G077200--Sobic006G044466 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic004G077200--Sobic002G152000 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic004G077200--Sobic005G038700 Sobic003G418800 Sobic003G418800 Sobic004G077200--Sobic003G418800 Sobic004G221150--Sobic008G134000 Sobic004G221150--Sobic004G108900 Sobic004G221150--Sobic008G144100 Sobic004G221150--Sobic001G399501 Sobic004G221150--Sobic009G223700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic004G221150--Sobic001G179680 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic004G221150--Sobic004G089700 Sobic002G256500 Sobic002G256500 Sobic004G221150--Sobic002G256500 Sobic004G221150--Sobic006G169300 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic001G457100 Sobic002G121701--Sobic004G224300 Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic003G290700 Sobic002G121701--Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic009G061700
Octagon: transcription factors


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