Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G097700.1
Synonym Sb04g008030, ATH1
Functional annotation homeobox domain containing protein, expressed
UniProt C5XYH2
Pfam PF05920 PF07526
Panther DB PTHR11850 PTHR11850:SF119
NCBI CDD KOG0773; Transcription factor MEIS1 and related HOX domain proteins
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G32980 : homeobox gene 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g13310.1 : homeobox domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000805 , Zm00025a020132
Brachypodium KQJ96691 , KQJ94108 , PNT66208 , PNT66209 , PNT66210
Barley HORVU7Hr1G088090.8 , HORVU7Hr1G088090.9 , HORVU7Hr1G088090.6 , HORVU7Hr1G088090.7 , HORVU7Hr1G088090.4 , HORVU7Hr1G088090.5 , HORVU7Hr1G088090.3 , HORVU7Hr1G088090.1 , HORVU7Hr1G088090.10 , HORVU7Hr1G088090.11 , HORVU7Hr1G088090.12 , HORVU7Hr1G088090.13 , HORVU6Hr1G014680.9 , HORVU6Hr1G014680.8 , HORVU6Hr1G014680.3 , HORVU6Hr1G014680.2 , HORVU6Hr1G014680.1 , HORVU6Hr1G014680.7 , HORVU6Hr1G014680.6 , HORVU6Hr1G014680.5 , HORVU6Hr1G014680.4
Wheat TraesCS7B02G269400 , TraesCS7D02G364500 , TraesCS7A02G358300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G097700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G097700 Sobic004G097700 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic004G097700--Sobic006G186200 Sobic003G407500 Sobic003G407500 Sobic004G097700--Sobic003G407500 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic004G097700--Sobic006G273500 Sobic007G208500 Sobic007G208500 Sobic004G097700--Sobic007G208500 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic004G097700--Sobic004G180600 Sobic009G203400 Sobic009G203400 Sobic004G097700--Sobic009G203400 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic004G097700--Sobic008G098098 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic004G097700--Sobic004G061600 Sobic006G245200 Sobic006G245200 Sobic004G097700--Sobic006G245200 Sobic006G186200--Sobic006G273500 Sobic006G186200--Sobic004G061600 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic006G186200--Sobic004G107400 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic006G186200--Sobic003G390300 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic006G186200--Sobic010G014900 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic006G186200--Sobic007G158400 Sobic004G156600 Sobic004G156600 Sobic006G186200--Sobic004G156600 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic006G186200--Sobic003G290700 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G186200--Sobic001G137200 Sobic003G407500--Sobic004G061600 Sobic003G407500--Sobic003G390300 Sobic003G407500--Sobic004G107400 Sobic003G407500--Sobic006G273500 Sobic003G407500--Sobic004G180600 Sobic003G407500--Sobic006G186200 Sobic003G407500--Sobic007G158400 Sobic003G407500--Sobic010G014900 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic003G407500--Sobic008G136900 Sobic006G273500--Sobic008G098098 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic006G273500--Sobic008G119200 Sobic006G273500--Sobic004G107400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic006G273500--Sobic002G285525 Sobic006G273500--Sobic001G137200 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic010G002850 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G273500--Sobic006G171000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G273500--Sobic005G209800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic006G273500--Sobic005G231800 Sobic007G208500--Sobic006G273500 Sobic007G208500--Sobic009G203400 Sobic007G208500--Sobic004G180600 Sobic007G208500--Sobic008G098098 Sobic007G208500--Sobic006G186200 Sobic002G256500 Sobic002G256500 Sobic007G208500--Sobic002G256500 Sobic007G208500--Sobic004G061600 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic007G208500--Sobic004G043200 Sobic007G208500--Sobic003G390300 Sobic004G180600--Sobic006G273500 Sobic004G180600--Sobic008G098098 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic004G180600--Sobic009G088401 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic008G119200 Sobic004G180600--Sobic004G107400 Sobic004G180600--Sobic003G407500 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic004G180600--Sobic007G072400 Sobic004G180600--Sobic005G209800 Sobic009G203400--Sobic006G273500 Sobic001G104400 Sobic001G104400 Sobic009G203400--Sobic001G104400 Sobic009G203400--Sobic007G208500 Sobic009G203400--Sobic004G180600 Sobic009G203400--Sobic008G098098 Sobic009G203400--Sobic006G186200 Sobic009G203400--Sobic004G061600 Sobic009G203400--Sobic008G119200 Sobic009G203400--Sobic004G107400 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic004G061600--Sobic003G390300 Sobic004G061600--Sobic007G158400 Sobic004G061600--Sobic008G136900 Sobic004G061600--Sobic010G014900 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic004G107400 Sobic005G168500 Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic001G137200 Sobic004G061600--Sobic006G273500 Sobic006G108000 Sobic006G108000 Sobic006G245200--Sobic006G108000 Sobic006G245200--Sobic006G186200 Sobic008G163800 Sobic008G163800 Sobic006G245200--Sobic008G163800 Sobic003G406500 Sobic003G406500 Sobic006G245200--Sobic003G406500 Sobic007G153300 Sobic007G153300 Sobic006G245200--Sobic007G153300 Sobic006G245200--Sobic004G156600 Sobic006G245200--Sobic004G061600 Sobic003G377200 Sobic003G377200 Sobic006G245200--Sobic003G377200 Sobic006G245200--Sobic004G107400
Octagon: transcription factors


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