Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G137701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMI4
Pfam -
Panther DB PTHR33257 PTHR33257:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G25845 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g26330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK02995 , KQK02994
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G439850 - -
2 Sobic.005G065400 expressed protein -
3 Sobic.001G120750 - -
4 Sobic.005G227900 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.002G088500 expressed protein -
6 Sobic.004G352800 expressed protein -
7 Sobic.003G059600 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
8 Sobic.007G129500 expressed protein -
9 Sobic.001G453150 - -
10 Sobic.007G115600 protein kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G226700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G177700 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G227400 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G363600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
15 Sobic.001G055300 expressed protein -
16 Sobic.K044402 - -
17 Sobic.010G135700 ZOS6-04 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.006G212700 expressed protein -
19 Sobic.002G364301 - -
20 Sobic.004G345300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G137701 Sobic004G137701 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic004G137701--Sobic001G439850 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic004G137701--Sobic005G065400 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic004G137701--Sobic001G120750 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic004G137701--Sobic005G227900 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic004G137701--Sobic002G088500 Sobic004G352800 Sobic004G352800 Sobic004G137701--Sobic004G352800 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic004G137701--Sobic003G059600 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic004G137701--Sobic007G129500 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic004G137701--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic005G065400 Sobic001G439850--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic002G088500 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic001G439850--Sobic002G227400 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic001G439850--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic001G439850--Sobic007G171300 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G439850--Sobic010G135700 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic001G120750--Sobic001G055300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic001G120750--Sobic002G185000 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic001G120750--Sobic010G133800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G120750--Sobic006G107332 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic001G120750--Sobic001G258700 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G120750--Sobic003G076300 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic001G120750--Sobic001G461101 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic001G120750--Sobic005G226700 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic001G120750--Sobic009G184450 Sobic004G041600 Sobic004G041600 Sobic005G227900--Sobic004G041600 SobicK044402 SobicK044402 Sobic005G227900--SobicK044402 Sobic003G015700 Sobic003G015700 Sobic005G227900--Sobic003G015700 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic005G227900--Sobic008G014601 Sobic007G055400 Sobic007G055400 Sobic005G227900--Sobic007G055400 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic005G227900--Sobic007G115600 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic005G227900--Sobic001G423900 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic005G227900--Sobic007G176300 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic005G227900--Sobic002G342901 Sobic002G088500--Sobic007G129500 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic002G088500--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G065400 Sobic002G088500--Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G439850 Sobic002G088500--Sobic006G107332 Sobic002G088500--Sobic001G120750 Sobic004G352800--Sobic001G439850 Sobic004G352800--Sobic004G137701 Sobic004G352800--Sobic005G065400 Sobic004G352800--Sobic001G453150 Sobic004G352800--Sobic002G227400 Sobic005G196700 Sobic005G196700 Sobic004G352800--Sobic005G196700 Sobic004G352800--Sobic002G088500 Sobic006G212700 Sobic006G212700 Sobic004G352800--Sobic006G212700 Sobic004G352800--Sobic002G285101 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G059600--Sobic008G133750 Sobic002G163950 Sobic002G163950 Sobic003G059600--Sobic002G163950 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic003G059600--Sobic008G191800 Sobic009G025950 Sobic009G025950 Sobic003G059600--Sobic009G025950 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G059600--Sobic003G318600 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic003G059600--Sobic001G209000 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G059600--Sobic008G157400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G059600--Sobic003G254400 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic003G059600--Sobic003G360500 Sobic007G129500--Sobic002G088500 Sobic007G129500--Sobic001G177700 Sobic007G129500--Sobic002G364301 Sobic007G129500--Sobic005G226700 Sobic007G129500--Sobic001G055300 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic006G107332 Sobic007G129500--Sobic005G065400 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic007G129500--Sobic009G214700 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic002G088500
Octagon: transcription factors


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