Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G352800.1
Synonym Sb04g037950
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XWM1
Pfam -
Panther DB PTHR36705:SF1 PTHR36705
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK01481
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G439850 - -
2 Sobic.004G137701 - -
3 Sobic.005G065400 expressed protein -
4 Sobic.001G453150 - -
5 Sobic.002G227400 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
6 Sobic.005G196700 transporter family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G088500 expressed protein -
8 Sobic.006G212700 expressed protein -
9 Sobic.002G285101 - -
10 Sobic.001G120750 - -
11 Sobic.010G002201 - -
12 Sobic.002G205100 transferase family protein, putative, expressed K13065: E2.3.1.133, shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
13 Sobic.007G171300 - -
14 Sobic.007G214900 EDM2, putative, expressed -
15 Sobic.003G336600 homeobox domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G129500 expressed protein -
17 Sobic.004G337975 - -
18 Sobic.001G177700 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G405400 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G195866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G352800 Sobic004G352800 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic004G352800--Sobic001G439850 Sobic004G137701 Sobic004G137701 Sobic004G352800--Sobic004G137701 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic004G352800--Sobic005G065400 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic004G352800--Sobic001G453150 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic004G352800--Sobic002G227400 Sobic005G196700 Sobic005G196700 Sobic004G352800--Sobic005G196700 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic004G352800--Sobic002G088500 Sobic006G212700 Sobic006G212700 Sobic004G352800--Sobic006G212700 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic004G352800--Sobic002G285101 Sobic001G439850--Sobic005G065400 Sobic001G439850--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic002G088500 Sobic001G439850--Sobic002G227400 Sobic001G439850--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic008G091500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic001G439850--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic001G439850--Sobic007G171300 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G439850--Sobic010G135700 Sobic004G137701--Sobic001G439850 Sobic004G137701--Sobic005G065400 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic004G137701--Sobic001G120750 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic004G137701--Sobic005G227900 Sobic004G137701--Sobic002G088500 Sobic004G137701--Sobic004G352800 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic004G137701--Sobic003G059600 Sobic004G137701--Sobic007G129500 Sobic004G137701--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic002G088500 Sobic002G227400--Sobic007G171300 Sobic002G227400--Sobic005G065400 Sobic002G227400--Sobic001G453150 Sobic002G227400--Sobic001G439850 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic008G091500 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic002G227400--Sobic001G529301 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic002G227400--Sobic006G031866 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic002G227400--Sobic010G213100 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic005G196700--Sobic002G185400 Sobic010G083300 Sobic010G083300 Sobic005G196700--Sobic010G083300 Sobic001G420600 Sobic001G420600 Sobic005G196700--Sobic001G420600 Sobic001G075300 Sobic001G075300 Sobic005G196700--Sobic001G075300 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic005G196700--Sobic001G084200 Sobic001G449200 Sobic001G449200 Sobic005G196700--Sobic001G449200 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic005G196700--Sobic009G168700 Sobic007G053000 Sobic007G053000 Sobic005G196700--Sobic007G053000 Sobic005G196700--Sobic004G352800 Sobic002G088500--Sobic007G129500 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic002G088500--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic002G364301 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G065400 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G439850 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G088500--Sobic006G107332 Sobic002G088500--Sobic001G120750 Sobic006G212700--Sobic007G171300 Sobic003G186200 Sobic003G186200 Sobic006G212700--Sobic003G186200 Sobic006G212700--Sobic002G227400 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic006G212700--Sobic001G486400 Sobic006G212700--Sobic001G120750 Sobic006G212700--Sobic001G135000 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic006G212700--Sobic005G078600 Sobic002G265500 Sobic002G265500 Sobic006G212700--Sobic002G265500 Sobic006G212700--Sobic010G213100 Sobic002G285101--Sobic001G453150 Sobic002G285101--Sobic010G002201 Sobic002G285101--Sobic005G065400 Sobic002G285101--Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic001G439850 Sobic002G285101--Sobic008G087000 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G285101--Sobic009G174833 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G285101--Sobic008G139200 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic002G285101--Sobic003G385201
Octagon: transcription factors


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