Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G214900.4,Sobic.007G214900.5,Sobic.007G214900.1,Sobic.007G214900.2,Sobic.007G214900.3
Synonym EDM2
Functional annotation EDM2, putative, expressed
UniProt A0A1B6PIZ9 , A0A1Z5RB34 , A0A1B6PJ43 , A0A1Z5RB81
Pfam -
Panther DB PTHR22884 PTHR22884:SF340
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55390 : ENHANCED DOWNY MILDEW 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g39250.1 : EDM2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033770
Brachypodium KQJ98885 , PNT68378 , PNT68377
Barley -
Wheat TraesCS7D02G242100 , TraesCS7A02G243300 , TraesCS7B02G148200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G214900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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7 Sobic.003G271000 - -
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12 Sobic.001G439850 - -
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14 Sobic.009G218450 - K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
15 Sobic.001G074601 - -
16 Sobic.007G129500 expressed protein -
17 Sobic.008G087000 POLA2 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed K02321: DNA polymerase alpha subunit B
18 Sobic.009G047033 - -
19 Sobic.005G086700 ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed -
20 Sobic.006G201350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G214900 Sobic007G214900 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic007G214900--Sobic005G065400 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic007G214900--Sobic002G285101 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic007G214900--Sobic002G088500 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic007G214900--Sobic001G453150 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic007G214900--Sobic010G002201 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic007G214900--Sobic010G213100 Sobic003G271000 Sobic003G271000 Sobic007G214900--Sobic003G271000 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic007G214900--Sobic003G091900 Sobic003G336600 Sobic003G336600 Sobic007G214900--Sobic003G336600 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic002G285101--Sobic001G453150 Sobic002G285101--Sobic010G002201 Sobic002G285101--Sobic005G065400 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic001G439850 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic002G285101--Sobic008G087000 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G285101--Sobic009G174833 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G285101--Sobic008G139200 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic002G285101--Sobic003G385201 Sobic002G088500--Sobic007G129500 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic002G088500--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic002G364301 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G065400 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G439850 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G088500--Sobic006G107332 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic002G088500--Sobic001G120750 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic001G453150 Sobic010G002201--Sobic002G285101 Sobic010G002201--Sobic008G087000 Sobic010G002201--Sobic004G048201 Sobic010G002201--Sobic005G065400 Sobic010G002201--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic009G174833 Sobic010G002201--Sobic001G439850 Sobic010G002201--Sobic003G385201 Sobic010G213100--Sobic003G091900 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic010G213100--Sobic010G054400 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic010G213100--Sobic001G062000 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic010G213100--Sobic007G182400 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic010G213100--Sobic003G308900 Sobic010G213100--Sobic003G336600 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic010G213100--Sobic009G047033 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic010G213100--Sobic002G377400 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic010G213100--Sobic004G343733 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic003G271000--Sobic006G233400 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic003G271000--Sobic010G265100 Sobic003G271000--Sobic003G308900 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic003G271000--Sobic002G256400 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic003G271000--Sobic004G304900 Sobic005G175700 Sobic005G175700 Sobic003G271000--Sobic005G175700 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G271000--Sobic002G296800 Sobic003G271000--Sobic002G377400 Sobic006G150500 Sobic006G150500 Sobic003G271000--Sobic006G150500 Sobic003G091900--Sobic010G213100 Sobic003G091900--Sobic007G182400 Sobic003G091900--Sobic009G047033 Sobic003G091900--Sobic001G062000 Sobic003G056900 Sobic003G056900 Sobic003G091900--Sobic003G056900 Sobic003G091900--Sobic010G054400 Sobic003G091900--Sobic002G377400 Sobic003G091900--Sobic003G336600 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic003G091900--Sobic007G185000 Sobic003G336600--Sobic003G091900 Sobic003G336600--Sobic010G213100 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic003G336600--Sobic008G159800 Sobic003G336600--Sobic003G308900 Sobic005G090700 Sobic005G090700 Sobic003G336600--Sobic005G090700 Sobic003G336600--Sobic007G185000 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic003G336600--Sobic003G243750 Sobic003G336600--Sobic002G377400 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic003G336600--Sobic007G165100
Octagon: transcription factors


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