Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G196700.1
Synonym Sb05g025370, PMT5, ATPLT5, ATPMT5
Functional annotation transporter family protein, putative, expressed
UniProt C5Y6Y3
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF17
NCBI CDD KOG0254; Predicted transporter (major facilitator superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18830 : polyol/monosaccharide transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41850.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029256 , Zm00025a029259 , Zm00025a029265 , Zm00025a029266
Brachypodium KQJ87608
Barley HORVU4Hr1G071020.1 , HORVU4Hr1G071020.2
Wheat TraesCS4B02G262800 , TraesCS4D02G262900 , TraesCS4A02G042000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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19 Sobic.001G438900 - -
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Gene co-expression network
sample Sobic005G196700 Sobic005G196700 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic005G196700--Sobic002G185400 Sobic010G083300 Sobic010G083300 Sobic005G196700--Sobic010G083300 Sobic001G420600 Sobic001G420600 Sobic005G196700--Sobic001G420600 Sobic001G075300 Sobic001G075300 Sobic005G196700--Sobic001G075300 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic005G196700--Sobic001G084200 Sobic001G449200 Sobic001G449200 Sobic005G196700--Sobic001G449200 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic005G196700--Sobic009G168700 Sobic007G053000 Sobic007G053000 Sobic005G196700--Sobic007G053000 Sobic004G352800 Sobic004G352800 Sobic005G196700--Sobic004G352800 Sobic002G185400--Sobic001G084200 Sobic001G001132 Sobic001G001132 Sobic002G185400--Sobic001G001132 Sobic002G185400--Sobic009G168700 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic002G185400--Sobic006G138966 Sobic005G073101 Sobic005G073101 Sobic002G185400--Sobic005G073101 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic001G192750 Sobic004G067850 Sobic004G067850 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Sobic004G352800--Sobic006G212700 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic004G352800--Sobic002G285101
Octagon: transcription factors


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