Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G155400.1
Synonym Sb04g020660
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XSL9
Pfam -
Panther DB PTHR35280
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27300 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g30610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020402 , Zm00025a031358
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G084420.2 , HORVU2Hr1G084420.1
Wheat TraesCS2A02G346700 , TraesCS2B02G365000 , TraesCS2D02G345400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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3 Sobic.008G118300 expressed protein -
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6 Sobic.005G092301 - -
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8 Sobic.003G294900 expressed protein -
9 Sobic.004G215200 expressed protein -
10 Sobic.005G162800 expressed protein -
11 Sobic.003G062101 - -
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13 Sobic.003G041400 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
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19 Sobic.004G155300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.010G250700 rRNA 2-O-methyltransferase fibrillarin 2, putative, expressed K14563: NOP1, rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin


Gene co-expression network
sample Sobic004G155400 Sobic004G155400 Sobic006G277100 Sobic006G277100 Sobic004G155400--Sobic006G277100 Sobic002G037600 Sobic002G037600 Sobic004G155400--Sobic002G037600 Sobic008G118300 Sobic008G118300 Sobic004G155400--Sobic008G118300 Sobic006G208200 Sobic006G208200 Sobic004G155400--Sobic006G208200 Sobic008G017700 Sobic008G017700 Sobic004G155400--Sobic008G017700 Sobic005G092301 Sobic005G092301 Sobic004G155400--Sobic005G092301 Sobic004G353500 Sobic004G353500 Sobic004G155400--Sobic004G353500 Sobic003G294900 Sobic003G294900 Sobic004G155400--Sobic003G294900 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic004G155400--Sobic004G215200 Sobic006G277100--Sobic004G155400 Sobic008G116600 Sobic008G116600 Sobic006G277100--Sobic008G116600 Sobic006G277100--Sobic008G118300 Sobic006G277100--Sobic005G092301 Sobic001G294600 Sobic001G294600 Sobic006G277100--Sobic001G294600 Sobic004G155300 Sobic004G155300 Sobic006G277100--Sobic004G155300 Sobic006G277100--Sobic004G353500 Sobic004G066500 Sobic004G066500 Sobic006G277100--Sobic004G066500 Sobic001G418600 Sobic001G418600 Sobic006G277100--Sobic001G418600 Sobic001G196800 Sobic001G196800 Sobic002G037600--Sobic001G196800 Sobic002G037600--Sobic003G294900 Sobic001G203800 Sobic001G203800 Sobic002G037600--Sobic001G203800 Sobic002G037600--Sobic006G208200 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G037600--Sobic004G328100 Sobic006G272300 Sobic006G272300 Sobic002G037600--Sobic006G272300 Sobic001G309200 Sobic001G309200 Sobic002G037600--Sobic001G309200 Sobic005G185200 Sobic005G185200 Sobic002G037600--Sobic005G185200 Sobic003G270100 Sobic003G270100 Sobic002G037600--Sobic003G270100 Sobic001G286100 Sobic001G286100 Sobic008G118300--Sobic001G286100 Sobic002G304400 Sobic002G304400 Sobic008G118300--Sobic002G304400 Sobic008G118300--Sobic004G353500 Sobic008G118300--Sobic008G017700 Sobic004G160800 Sobic004G160800 Sobic008G118300--Sobic004G160800 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic008G118300--Sobic010G002800 Sobic003G418400 Sobic003G418400 Sobic008G118300--Sobic003G418400 Sobic008G118300--Sobic002G037600 Sobic006G271000 Sobic006G271000 Sobic008G118300--Sobic006G271000 Sobic006G208200--Sobic004G215200 Sobic006G208200--Sobic001G203800 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic006G208200--Sobic001G499500 Sobic006G208200--Sobic003G418400 Sobic006G208200--Sobic003G270100 Sobic006G208200--Sobic002G037600 Sobic006G208200--Sobic004G328100 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic006G208200--Sobic010G062900 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic006G208200--Sobic010G009600 Sobic008G017700--Sobic008G118300 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic008G017700--Sobic007G112100 Sobic009G244900 Sobic009G244900 Sobic008G017700--Sobic009G244900 Sobic007G192500 Sobic007G192500 Sobic008G017700--Sobic007G192500 Sobic009G103400 Sobic009G103400 Sobic008G017700--Sobic009G103400 Sobic008G017700--Sobic003G418400 Sobic005G210500 Sobic005G210500 Sobic008G017700--Sobic005G210500 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic008G017700--Sobic008G141900 Sobic008G046000 Sobic008G046000 Sobic008G017700--Sobic008G046000 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic005G092301--Sobic003G275400 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic005G092301--Sobic008G191700 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic005G092301--Sobic010G211200 Sobic005G092301--Sobic008G141900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G092301--Sobic004G222150 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic005G092301--Sobic002G064800 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G092301--Sobic009G241900 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic005G092301--Sobic005G212201 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic005G092301--Sobic009G168200 Sobic004G353500--Sobic003G294900 Sobic004G353500--Sobic008G118300 Sobic005G044300 Sobic005G044300 Sobic004G353500--Sobic005G044300 Sobic007G012900 Sobic007G012900 Sobic004G353500--Sobic007G012900 Sobic004G353500--Sobic004G160800 Sobic004G353500--Sobic001G286100 Sobic004G353500--Sobic002G037600 Sobic004G353500--Sobic001G203800 Sobic002G186500 Sobic002G186500 Sobic004G353500--Sobic002G186500 Sobic003G294900--Sobic002G037600 Sobic003G294900--Sobic004G353500 Sobic003G294900--Sobic006G208200 Sobic004G100100 Sobic004G100100 Sobic003G294900--Sobic004G100100 Sobic001G188000 Sobic001G188000 Sobic003G294900--Sobic001G188000 Sobic003G294900--Sobic001G203800 Sobic003G294900--Sobic001G309200 Sobic003G294900--Sobic005G185200 Sobic003G044700 Sobic003G044700 Sobic003G294900--Sobic003G044700 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic004G215200--Sobic001G053350 Sobic004G215200--Sobic010G062900 Sobic004G215200--Sobic006G208200 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic004G215200--Sobic001G485500 Sobic004G215200--Sobic001G499500 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic004G215200--Sobic009G163400 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic004G215200--Sobic002G309100 Sobic007G086600 Sobic007G086600 Sobic004G215200--Sobic007G086600 Sobic010G252100 Sobic010G252100 Sobic004G215200--Sobic010G252100
Octagon: transcription factors


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