Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G244200.1
Synonym Sb04g028470
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XZ75
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g04610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G102800 OsSCP48 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
2 Sobic.006G237600 expressed protein -
3 Sobic.004G248700 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
4 Sobic.005G047900 expressed protein -
5 Sobic.009G119800 GASR5 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
6 Sobic.009G155900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, expressed -
7 Sobic.003G434300 expressed protein -
8 Sobic.004G057700 zinc-binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G018100 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
10 Sobic.007G225700 phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, chloroplast precursor, putative, expressed K01626: E2.5.1.54, aroF, aroG, 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase
11 Sobic.004G222300 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.006G083900 PHD-finger domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G147600 - -
14 Sobic.010G218800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.005G184000 - -
16 Sobic.004G116500 expressed protein -
17 Sobic.004G134801 - -
18 Sobic.010G222666 - -
19 Sobic.008G165266 - -
20 Sobic.010G179300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G244200 Sobic004G244200 Sobic005G102800 Sobic005G102800 Sobic004G244200--Sobic005G102800 Sobic006G237600 Sobic006G237600 Sobic004G244200--Sobic006G237600 Sobic004G248700 Sobic004G248700 Sobic004G244200--Sobic004G248700 Sobic005G047900 Sobic005G047900 Sobic004G244200--Sobic005G047900 Sobic009G119800 Sobic009G119800 Sobic004G244200--Sobic009G119800 Sobic009G155900 Sobic009G155900 Sobic004G244200--Sobic009G155900 Sobic003G434300 Sobic003G434300 Sobic004G244200--Sobic003G434300 Sobic004G057700 Sobic004G057700 Sobic004G244200--Sobic004G057700 Sobic008G018100 Sobic008G018100 Sobic004G244200--Sobic008G018100 Sobic003G102700 Sobic003G102700 Sobic005G102800--Sobic003G102700 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic005G102800--Sobic007G192200 Sobic004G269100 Sobic004G269100 Sobic005G102800--Sobic004G269100 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic005G102800--Sobic006G226000 Sobic005G102800--Sobic009G119800 Sobic003G140800 Sobic003G140800 Sobic005G102800--Sobic003G140800 Sobic001G381000 Sobic001G381000 Sobic005G102800--Sobic001G381000 Sobic005G102800--Sobic004G244200 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic005G102800--Sobic009G031800 Sobic006G237600--Sobic004G244200 Sobic008G100400 Sobic008G100400 Sobic006G237600--Sobic008G100400 Sobic007G225700 Sobic007G225700 Sobic006G237600--Sobic007G225700 Sobic002G300100 Sobic002G300100 Sobic006G237600--Sobic002G300100 Sobic010G157700 Sobic010G157700 Sobic006G237600--Sobic010G157700 Sobic001G236800 Sobic001G236800 Sobic006G237600--Sobic001G236800 Sobic003G176200 Sobic003G176200 Sobic006G237600--Sobic003G176200 Sobic008G186500 Sobic008G186500 Sobic006G237600--Sobic008G186500 Sobic009G241966 Sobic009G241966 Sobic006G237600--Sobic009G241966 Sobic004G116500 Sobic004G116500 Sobic004G248700--Sobic004G116500 Sobic004G248700--Sobic009G155900 Sobic004G248700--Sobic003G434300 Sobic004G248700--Sobic004G057700 Sobic005G138000 Sobic005G138000 Sobic004G248700--Sobic005G138000 Sobic004G248700--Sobic004G244200 Sobic007G143800 Sobic007G143800 Sobic004G248700--Sobic007G143800 Sobic005G120600 Sobic005G120600 Sobic004G248700--Sobic005G120600 Sobic009G000600 Sobic009G000600 Sobic004G248700--Sobic009G000600 Sobic004G222300 Sobic004G222300 Sobic005G047900--Sobic004G222300 Sobic005G047900--Sobic009G119800 Sobic004G134801 Sobic004G134801 Sobic005G047900--Sobic004G134801 Sobic005G147600 Sobic005G147600 Sobic005G047900--Sobic005G147600 Sobic002G366300 Sobic002G366300 Sobic005G047900--Sobic002G366300 Sobic005G047900--Sobic005G102800 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic005G047900--Sobic006G083900 Sobic005G047900--Sobic001G381000 Sobic001G122600 Sobic001G122600 Sobic005G047900--Sobic001G122600 Sobic009G119800--Sobic001G381000 Sobic002G240000 Sobic002G240000 Sobic009G119800--Sobic002G240000 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic009G119800--Sobic001G534200 Sobic009G119800--Sobic008G018100 Sobic009G119800--Sobic006G083900 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic009G119800--Sobic005G126701 Sobic001G254800 Sobic001G254800 Sobic009G119800--Sobic001G254800 Sobic005G021000 Sobic005G021000 Sobic009G119800--Sobic005G021000 Sobic006G234433 Sobic006G234433 Sobic009G119800--Sobic006G234433 Sobic008G165300 Sobic008G165300 Sobic009G155900--Sobic008G165300 Sobic002G127900 Sobic002G127900 Sobic009G155900--Sobic002G127900 Sobic008G165266 Sobic008G165266 Sobic009G155900--Sobic008G165266 Sobic002G429700 Sobic002G429700 Sobic009G155900--Sobic002G429700 Sobic009G224300 Sobic009G224300 Sobic009G155900--Sobic009G224300 Sobic009G155900--Sobic005G138000 Sobic009G155900--Sobic004G248700 Sobic009G155900--Sobic003G434300 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic009G155900--Sobic002G266300 Sobic003G434300--Sobic006G234433 Sobic003G434300--Sobic006G083900 Sobic003G434300--Sobic001G122600 Sobic004G057700--Sobic009G000600 Sobic006G240900 Sobic006G240900 Sobic004G057700--Sobic006G240900 Sobic008G042200 Sobic008G042200 Sobic004G057700--Sobic008G042200 Sobic004G115700 Sobic004G115700 Sobic004G057700--Sobic004G115700 Sobic009G200000 Sobic009G200000 Sobic004G057700--Sobic009G200000 Sobic008G048966 Sobic008G048966 Sobic004G057700--Sobic008G048966 Sobic003G350400 Sobic003G350400 Sobic004G057700--Sobic003G350400 Sobic001G290500 Sobic001G290500 Sobic004G057700--Sobic001G290500 Sobic008G052300 Sobic008G052300 Sobic004G057700--Sobic008G052300 Sobic008G018100--Sobic006G083900 Sobic008G018100--Sobic006G234433 Sobic008G149300 Sobic008G149300 Sobic008G018100--Sobic008G149300 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic008G018100--Sobic007G025600 Sobic004G349550 Sobic004G349550 Sobic008G018100--Sobic004G349550 Sobic008G018100--Sobic005G126701 Sobic008G018100--Sobic001G122600
Octagon: transcription factors


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